test results fixed
old code was wrong, new code is hopefully better

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32168 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

rework MGConstrainedDofs to use IndexSet as the datastructure

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32167 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

simplify logic

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32166 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

is_boundary_index() returns false if no boundary indices are set

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32165 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

MGTools::make_boundary_list can work on ghost cells too

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32164 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

typo

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32162 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove one big field

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32161 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove if with identical code in both branches

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32160 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

simplify again

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32159 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add comment

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32156 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove superfluous boundary logic

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32155 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

simplify test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32154 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add test to check meshworker boundary terms

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32153 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

meshworker: only assemble boundary terms for own cells

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32152 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove dead code

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32151 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add documentation of level_cell

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32150 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix parallel mg test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32149 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

handle artificial cells in DofInfoBox

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32148 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove default argument

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32147 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add new test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32146 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update meshworker tests

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32145 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

meshworker: work on logic for ghost faces

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32144 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make new function default

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32143 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove deprecated constructor

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32142 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

meshworker loop: own_faces=both with hanging nodes not supported

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32141 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Note that both side processing is not implemetned for hanging nodes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32140 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add meshworker tests

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32139 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

meshworker loop: use LoopControl, add cells_first flag, fix logic, deprecate old functions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32138 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update publications html page

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32137 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove arraycolsep in documentation because mathjax can not deal with it

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32135 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Add a configuration option for mathjax

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32134 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bugfix: Only compile bundled boost::iostreams if zlib is available

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32133 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Cleanup some code

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32130 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix compilation with 64 bit integers

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32129 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Forgot to set default argument

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32128 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

One more

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32127 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix Trilinos vectors

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32126 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement a parallel for approach for WorkStream::run when the copier function is empty.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32124 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Patch by Valentin Zingan: Add VectorTools::interpolate_based_on_material_id.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32123 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update step-18 to write .vtu files

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32122 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make Clang happy: Put default parameter to declaration as is required by the standard ([decl.fct.default] 3 + 4)

Also remove tabs and reindent parts of the file

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32121 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Actually enable parallel run of WorkStream. Now some tests might fail from time to time because writing into a TrilinosWrappers::MPI::Vector is not thread-safe. Will fix that during the next days

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32120 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make compile with clang

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32119 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert r32112 "Export whether we have found bzip2."

This is already present in config.h.in

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32118 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Workaround for a CMake bug: Add the library to the library component

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32117 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert r32111. It doesn't work because when we compile boost files, we apparently have no access to the deal.II config.h file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32116 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Quicktests: Remove "build_library" target - this dependency is already implicitly present..

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32115 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Bugfix, let library and build_library depend on the debug library, too

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32114 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

First step towards using parallel_for whenever the copier function is
empty: defer from implementation 2 to implementation 3.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32113 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Export whether we have found bzip2.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32112 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Guard these files to make sure one gets compiler errors and not just linker errors.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32111 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Committed test cases too quickly

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32108 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Unfortunately, for FindLAPACK and FindBzip2 we need a C compiler to be set up...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32107 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement new reinit method to Trilinos sparsity pattern that makes writing into matrices thread-safe.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32106 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve error messages.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32105 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Configure as far as possible if libz or libbz2 can not be found or configured.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32104 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Issue pointed out by Jean Ragusa: Properly parenthesize a formula.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32103 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Issue pointed out by Jean Ragusa: No need to set system_rhs to zero, sicne the reinit() immediately above it already does that.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32102 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Typos

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32101 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

State that these two elements are discontinuous at places where faces meet.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32100 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Improve error message

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32099 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Bugfix: Also change DEAL_II_USE_CXX11 to DEAL_II_WITH_CXX11 in cmake
files and in the bundled folder

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32098 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Organize C++11 support as a toggable feature

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32097 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Add support for bzip2.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32096 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Clean up configure_boost.cmake and simplify detection logic

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32095 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add one.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32094 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert r32092 because it doesn't work on systems that DO have libbz2.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32093 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Configure things so that we only build BOOST.Iostreams if libz and libbz2 are actually available.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32092 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove two dead links in documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32090 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32089 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid the use of std::copy_n -- this is apparently C++11 stuff.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32088 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add cmake configury stuff to also build the boost::iostreams library.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32087 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add library subdirectory, but excluding all the documentation, build, test and example subdirectories.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32086 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Properly call the template arguments 'InputIterator', rather than 'ForwardIterator'.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32085 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Introduce more powerful constructors for the table classes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32084 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add another test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32083 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add new tests.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32082 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Generalize TableBase::fill.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32081 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention a class that now exists.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32080 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Properly qualify references to classes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32079 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention BOOST Iostream.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32078 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add new test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32077 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Qualify references to Table from within namespace internal in preparation for a patch to come next.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32076 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve an error message.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32075 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32074 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove an unused variable.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32073 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New class InterpolatedUniformGridData.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32072 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change the name everywhere.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32070 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change my mind: call the new class InterpolatedTensorProductGridData instead.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32069 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New class InterpolatedTensorProductData.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32068 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Also link with boost::iostreams.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32067 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Detect in ParameterHandler::get_double/integer whenever the text of a parameter is not a number.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32065 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve documentation slightly.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32063 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move to a better place.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32059 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix some xrefs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32057 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Document the presence of step-26.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32054 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Finish documenting step-26.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32053 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix indentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32052 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

move entry from changes.h to 8.0vs8.1 as it is included in 8.1

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32051 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a nasty bug in DerivativeApproximation which simply did not work at all in parallel.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@32049 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d