Add program for goal-oriented Maxwell eigenvalue hp-refinement

Merge pull request #116 from drwells/update-cdr

Update cdr

Merge pull request #109 from bangerth/filter

Update DataOut filter interface usage.

Run clang-format on everything

Clean up readme

Merge pull request #113 from bangerth/information

Add a new code gallery program.

Merge pull request #115 from bangerth/grammar

Fix a grammar mistake.

Fix a grammar mistake.

Merge pull request #110 from bangerth/fixes-2

Fix the remaining compiler errors.

Merge pull request #114 from fdrmrc/clean_adv_reaction_estimator

Clean a little advection_reaction_estimator program

Clean a little and fix indentation

Merge pull request #111 from bangerth/doc-3

Improve mark-up.

Improve mark-up.

Merge pull request #105 from bangerth/doc-2

Fix formula mark-up.

Merge pull request #108 from bangerth/version-2

Bump required version of deal.II to 9.4.

Fix the remaining compiler errors.

I live under no illusion that everything will just work as expected,
but being able to compile is a good first step :-)

Update DataOut filter interface usage.

As far as I can see, all these filters in this code gallery program do
is select the locally owned cells. But this is what DataOut has been
doing automatically for a long time already, so the filters are no longer
necessary.

The face filter class was not even used :-)

Also update the deal.II version in the CI infrastructure.

Merge pull request #104 from bangerth/version

Do not specify a deal.II version number in the top-level README.

Merge pull request #107 from bangerth/fixes-1

Fix some code gallery programs.

Bump required version of deal.II to 9.4.

Fix some code gallery programs.

This is not enough to make all of them compile, much less compile without
warning. But it is a step.

Also update a reference.

Co-authored-by: Marc Fehling <mafehling.git@gmail.com>

Fix formula mark-up.

Merge pull request #103 from bangerth/doc

Fix some formatting issues.

Merge pull request #106 from bangerth/cmake-version

Set minimum cmake version to 3.3.

This is also the version we use for deal.II 9.4 itself.

Fix formula mark-up.

Do not specify a deal.II version number in the top-level README.

Fix some formatting issues.

Merge pull request #91 from fdrmrc/advection_reaction_estimator

Advection-Reaction Error estimator

Merge pull request #102 from GiuseppeOrlando878776/NS_TRBDF2_DG

Adjusted README.md and applied small 'coding design' modifications (using EvaluationFlags, modified template parameters...)

Update NavierStokes_TRBDF2_DG/README.md

Co-authored-by: Marc Fehling <mafehling.git@gmail.com>

Adjusted README.md, implemented a 'compute diagonal' function and performed small 'coding design' modifications (using EvaluationFlags, modified template parameters...)

Merge pull request #101 from GiuseppeOrlando878776/NS_TRBDF2_DG

Solver for incompressible NS based on Discontinuous Galerkin TR-BDF2 implemented with MatrixFree

Fix some warnings

Solver for incompressible NS based on Discontinuous Galerkin TR-BDF2 implemented with MatrixFree

Merge pull request #100 from bangerth/comment

Remove an outdated comment.

Remove an outdated comment.

Merge pull request #99 from bangerth/umfpack

UMFPACK is no longer required.

Merge pull request #97 from bangerth/python

Add Python version of the benchmark.

UMFPACK is no longer required.

Adjust for the remaining review comments.

Import the updated version from David's repository.

Also add the Matlab version.

Update the Readme file for the alternative implementations.

Add the Python version of the forward solver.

Merge pull request #98 from bangerth/ilu

Use CG+ILU instead of UMFPACK as solver.

Merge pull request #94 from bangerth/prefix

Use prefix ++ over postfix.

Use CG+ILU instead of UMFPACK as solver.

Merge pull request #96 from bangerth/testing

Add a section on testing this program to the readme file.

Merge pull request #95 from bangerth/updates

Minor updates to the MCMC-Laplace benchmark readme file.

Add a section on testing this program to the readme file.

Minor updates to the MCMC-Laplace benchmark readme file.

Use prefix ++ over postfix.

first version of adv reaction estimator

Merge pull request #90 from Lianxiali/fix_boundary_id_handling

Some fixes for functions of make_grid, make_constraints, and print_ve…

Update Cook membrane problem

- Further corrections for running in 3d
- Correct evaluation point such that it corresponds to the reference text (Miehe 1994)
- Set the default case to be the 3d one, which implements the plane strain condition in the reference text
- Updates for newer versions of deal.II

Some fixes for functions of make_grid, make_constraints, and print_vertical_tip_displacement

Merge pull request #85 from DavidSCN/fix-typo

Fix README typos

Fix README typos

Merge pull request #84 from DavidSCN/precice_tutorial

Add a deal.II-preCICE example

Add a deal.II-preCICE example

Merge pull request #83 from ecomellas/porovisco_code_updates

Format update for Nonlinear poro-viscoelasticity code

Update readme.md

Fix formatting of lists. Changed from markdown to html.

Merge pull request #82 from krishnakumarg1984/fix_redundant_edge

Removes a redundant edge from Nonlinear_PoroViscoelasticity tutorial dependencies

removes a redundant edge from Nonlinear_PoroViscoelasticity tutorial dependencies

Merge pull request #81 from bangerth/filenames

Fix the spelling of code gallery programs in a builds-on file.

Remove unnecessary comma.

Fix a missing endline.

Merge pull request #79 from bangerth/filenames

Use the normalized file names in doc/.

Merge pull request #80 from bangerth/newline

Provide a newline where a newline is required.

Provide a newline where a newline is required.

Use the normalized file names in doc/.

The script that looks for code gallery programs wants files without .txt ending,
but this directory had them with a file ending. Fix this.

Merge pull request #72 from ecomellas/my-code-gallery-project

Initial source code and documentation for nonlinear poro-viscoelasticity

Documentation and code improvements

Initial source code and documentation

Merge pull request #49 from jcc242/parallel_in_time

Parallel in time

Fix test warnings and output

Tweak source files

Standardisation of includes; Remove some compilation warnings

Update Readme.md

Update CMakeLists.txt

Merge pull request #77 from jppelteret/update_deal_II_9_1

Update to deal.II 9.1: two_phase_flow

Update to deal.II 9.1: time_dependent_navier_stokes

Update to deal.II 9.1: Quasi_static_Finite_strain_Quasi_incompressible_ViscoElasticity

Update to deal.II 9.1: Quasi_static_Finite_strain_Compressible_Elasticity

Update to deal.II 9.1: MultipointFluxMixedFiniteElementMethods

Update to deal.II 9.1: Linear_Elastic_Active_Skeletal_Muscle_Model

Update to deal.II 9.1: goal_oriented_elastoplasticity

Update to deal.II 9.1: ElastoplasticTorsion

Update to deal.II 9.1: Distributed_LDG_Method

Add IDE related files to .gitignore

Update to deal.II 9.1: Ceres

Add build folders to .gitignore

Update to deal.II 9.1: cdr

Document code maintenance procedure

Merge pull request #75 from drwells/headers-2

Fix some #includes on noncompiled source files