Use DEAL_II_HOST_DEVICE in CUDA matrix-free framework

Merge pull request #15032 from masterleinad/remove_quick_matrix

Remove QuickMatrix

Merge pull request #15008 from mschreter/add_signed_distance_rectangle

Remove QuickMatrix

Merge pull request #15030 from bangerth/ae

Use American English spelling for 'initialize'.

add signed distance for rectangle

Co-authored-by: Peter Munch <peter.muench@uni-a.de>

Merge pull request #14983 from c-p-schmidt/change-default-compression-level-of-vtu

Change default `compression_level` of vtu output

Use American English spelling for 'initialize'.

Merge pull request #15028 from bangerth/doc-98

Update the documentation of GridGenerator::extrude_triangulation().

Merge pull request #15027 from bangerth/29

Make step-29 marginally easier to understand.

Update the documentation of GridGenerator::extrude_triangulation().

Make step-29 marginally easier to understand.

Merge pull request #15014 from masterleinad/cleanup_cuda

Improve LinearAlgebra::parallel::Vector documentation

Merge pull request #15024 from jh66637/expose_same_types_as_fe_eval

Make FEPointEval expose same types as FEEval

Make FEPointEval expose same types as FEEval

Merge pull request #15015 from peterrum/fep_disconnect

FEPointEvaluation: disconnect from MappingInfo

Merge pull request #15023 from jh66637/instantiate_1d_2d_mapped_quadrature

instantiate mapped quadrature for dim=1 and spacedim=2

instantiate mapped quadrature for dim=1 and spacedim=2

Merge pull request #15005 from bangerth/test

Add a test for GridTools::Cache::get_covering_rtree().

Change default compression_level of vtu output

from best_compression to best_speed, as discussed in pull request #14958.
The compression flags of the tests is set to best_compression to conserve
the current output behavior of the tests.

FEPointEvaluation: disconnect from MappingInfo

Merge pull request #15012 from kronbichler/improve_loops_point_eval

FEPointEvaluation::integrate: Choose better loop layout

Add glossary entry

Replace MemorySpace::CUDA in non-CUDA tests

Merge pull request #15011 from masterleinad/fix_nvcc_compiler_bug

Work around nvcc compiler bug in mg_transfer_global_coarsening.templates.h

Clean up notions of CUDA in the codebase

FEPointEvaluation::integrate: Choose better loop layout

Work around nvcc compiler bug

Add a test for GridTools::Cache::get_covering_rtree().

Merge pull request #14982 from bergbauer/values_of_array_once

Compute values_of_array only once and optimize instructions

Merge pull request #15001 from marcfehling/ci-osx

OSX tester does not pick up /rebuild

Merge pull request #14995 from sebproell/element-activation-fix-ref-const

MatrixFreeTools: fix some refs and const

Merge pull request #14997 from bangerth/cell-id-translator

Explain the purpose of some computations in CellIDTranslator.

Merge pull request #14999 from drwells/fix-nodal-gauss-type-quadrature-0

Fix nodal and Gauss-type quadratures for dim = 0.

Merge pull request #15002 from masterleinad/fix_unused_variable

Fix a unused variable compiler warning in tria.cc

Merge pull request #15006 from tamiko/fix_cmake

CMake: fix variable name

CMake: fix variable name

We had an unfortunate "in flight" renaming conflict: One pull request
renamed the variable to DEAL_II_TARGET_NAME (PR #14993) while another
one (PR #14971) created the dealii::dealii target. Both on their own
passed the CI, but once both were merged we have an issue.

In reference to #14971
In reference to #14993

Merge pull request #14998 from tamiko/cmake_refactoring

CMake: refactor repetitive option handling into two macros

Merge pull request #15000 from masterleinad/update_sundials_link

Update SUNDIALS link in doc/readme.html

Merge pull request #14992 from tamiko/use_cmake_target_properties_2

CMake: prefer CMAKE_CXX_STANDARD and export cxx_std_?? COMPILE_FEATURES target property

Fix a unused variable compiler warning in tria.cc

Update SUNDIALS link in doc/readme.html

Align OSX Jenkinsfile with others.

Fix links for OSX CI status in README.

Fix nodal and Gauss-type quadratures for dim = 0.

Implement connector function and provide reinit function for explicit reinitialization

Add signal

Add test

Compute values_of_array only once

CMake: also record dummy target in detailed.log

CMake: use new macro when setting up dealii::dealii target

CMake: use new macros also in deal_ii_setup_target()

CMake: refactor repetitive option handling into two macros

Merge pull request #14971 from masterleinad/dealii_dealii_target

Create dealii::dealii target and add compile options

Minor performance improvement.

Explain the purpose of some computations.

Create dealii::dealii target and add compile options

MatrixFreeTools: fix some refs and const

Merge pull request #14958 from c-p-schmidt/introduce-compressed-hdf5-output

Merge pull request #14990 from tamiko/refactor_warning_flags

Merge pull request #14993 from tamiko/rename_variable

CMake: Rename DEAL_II_NAMESPACE to DEAL_II_TARGET_NAME

CMake: Rename DEAL_II_NAMESPACE to DEAL_II_TARGET_NAME

CMake: export C++ standard as COMPILE_FEATURE target property

CMake: prefer CMAKE_CXX_STANDARD over -std= compiler flags

Ensure that we handle manually specified CMAKE_CXX_STANDARD variables
correctly.

CMake: Bugfix: do not use std::is_pod in C++11 check

Some gcc versions erroneously warn about std::is_pod being deprecated
even though they are running in C++11 mode.

CMake: enable -pedantic for language feature check

This is a funny one: gcc and clang silently accept the [[deprecated]]
and [[fallthrough]] attributes which are introduced in the C++17
standard - even when the compiler is configured only with C++14 support.

BUT, clang will issue a warning that the attributes are not supported if
compiled with -pedantic. Thus, we have to check for support of the
attributes with -pedantic set.

CMake: use DEAL_II_WARNING_FLAGS variable in bundled/ directory

CMake: Use DEAL_II_WARNING_FLAGS in deal.II internal and user macros

CMake: export warning flags

CMake: separate warning flags into DEAL_II_WARNING_FLAGS variable

Merge pull request #14991 from tamiko/use_cmake_target_properties_1

add a changelog entry

CMake: set POSITION_INDEPENDENT_CODE compiler variable

CMake: do not use -fpic compiler flag

Merge pull request #14989 from bergbauer/fix_fe_point

Fix FEPointEvaluation for different n_q_points with same MappingInfo for different evaluators

Fix FEPointEvaluation for different n_q_points with same MappingInfo for different evaluators

Merge pull request #14597 from kronbichler/clear_variable

Make sure to clear a variable that gets set

Merge pull request #14981 from kronbichler/benchmark_global_coarsening

Add benchmark for multgrid with global coarsening

Merge pull request #14986 from mschreter/step-70_remove_unused_variable

Step-70: remove unused variable

remove unused variable

Enable output of compressed hdf5 files

- Hdf5Flags are introduced to enable setting the desired DataOutBase::CompressionLevel
- HDF5Flags are added to the corresponding write_hdf5_parallel and do_write_hdf5 methods
- if deal.II is build with zlib support, all necessary calls to perform compression using
  zlib (i.e. setting the compression level, setting the chunk size) are shielded behind
  'ifdef DEAL_II_WITH_ZLIB'
- if deal.II is build without zlib support, but compression_level is not set to no_compression
  an exception is raised.

Make sure to clear a variable that gets set

Merge pull request #14948 from peterrum/guess_point_owner

Refactor `internal::guess_point_owner`

Merge pull request #14972 from bergbauer/fixed_loop_bounds

Template loop bounds for flexible evaluate/integrate function

Add benchmark for multgrid with global coarsening

Communicate within guess_point_owner

Merge pull request #14974 from peterrum/bb

Add new functions to BoundingBox

Add new functions to BoundingBox

Merge pull request #14962 from tamiko/fix_keyword_mess

CMake: do not use PUBLIC keyword for target_link_libraries for tests

Template loop bounds for flexible evaluate/integrate function

Merge pull request #14953 from peterrum/si_is_supported

Work on ShapeInfo::is_supported()

Work on ShapeInfo::is_supported()

Merge pull request #14973 from bangerth/doc-gridtools

Add to the documentation of a function in GridTools.

Merge pull request #14940 from fdrmrc/fix_grid_ratio_step_60

Fix .prm file in step-60

Merge pull request #10397 from bangerth/69

[Post-9.4] Use C++14 lambda capture in step-69.

Merge pull request #14975 from bangerth/undepr

Use functionality from ReferenceCell in QProjector.

Merge pull request #14926 from bergbauer/remove_unit_points_member

FEPointEvaluation: Remove unit_points member, access them through MappingInfo instead

Merge pull request #14927 from bergbauer/quadrature_point_range

Introduce quadrature_points_indices() function for FEPointEvaluation

Merge pull request #14959 from peterrum/FEEvaluationImplSelector

Introduce FEEvaluationImplSelector