Bugfix: Clear DataTransfer after all data has been unpacked.

apply fixes

add test

fix variable transfer as well

Merge pull request #12867 from bangerth/read-1

Make code a bit more readable.

Merge pull request #12868 from bangerth/read-2

Make code a bit more readable.

Merge pull request #12865 from bangerth/dif-5

Avoid generation of expensive FE objects.

Merge pull request #12864 from peterrum/petsc_vector_reinit

PETScWrappers::MPI::Vector: add new reinit()

Make code a bit more readable.

Make code a bit more readable.

Avoid generation of expensive FE objects.

Merge pull request #12861 from vachan-potluri/changelog

Add a changelog entry for pr12787

PETScWrappers::MPI::Vector: add new reinit()

Merge pull request #12825 from marcfehling/pd-debug

Add a changelog entry for pr12787

Merge pull request #12858 from peterrum/interpolate_to_mg_without_dofhandler

Add MGTransferGlobalCoarsening::interpolate_to_mg() that does not take DoFHandler

Merge pull request #12847 from peterrum/data_out_pyramids

DataOut for pyramids: reorder at the end

Add MGTransferGlobalCoarsening::interpolate_to_mg() that does not take DoFHandler

DataOut for pyramids: reorder at the end

Merge pull request #12857 from gfcas/doc_dof_tools

Update doc make_flux_sparsity_pattern

Merge pull request #12856 from gfcas/typo

Fix typo

Merge pull request #12851 from peterrum/wedge_pyramid_test

DataOut: add wedge/pyramid test

Update doc make_flux_sparsity_pattern

Fix typo

Merge pull request #12849 from bangerth/duplication

Reduce duplication of information.

Merge pull request #12787 from vachan-potluri/read_unv

Ignore any sections before 2411 in `GridIn::read_unv()`

Ignore any sections before 2411 in `GridIn::read_unv()`

Merge pull request #12822 from bangerth/49

Minor text updates to the step-49 gmsh discussion.

DataOut: add wedge/pyramid test

Merge pull request #12853 from peterrum/convert_generalized_support_point_values_to_dof_values_wedges_pyramids

Implement convert_generalized_support_point_values_to_dof_values for wedges/pyramids

Reduce duplication of information.

Instead, use ReferenceCell as the one normative place to draw vertex orders from.

Implement convert_generalized_support_point_values_to_dof_values for wedges/pyramids

Merge pull request #12850 from kronbichler/followup-chebyshev

PreconditionChebyshev: Update documentation

Merge pull request #12816 from marcfehling/rotate

Merge pull request #12852 from marcfehling/magic-pi

No more magic number Pi.

Merge pull request #12846 from peterrum/distance_function

Rename Functions::LevelSet -> Functions::SignedDistance

Merge pull request #12848 from bangerth/refcell-3

PreconditionChebyshev: Update documentation

Merge pull request #12844 from bangerth/refcell-2

Replace uses of GeometryInfo.

Merge pull request #12819 from kronbichler/chebyshev_locality

Enable PreconditionChebyshev to update a sub-range of vector entries

Systematize construction of vertices for wedges.

Update and unify interface for `Physics` and `GridTools` rotations.

Generalize `GridTools::rotate` for arbitrary rotation axes.

Merge pull request #12845 from peterrum/wedge_fix_order_vertices

Fix order of vertices of wedges in ReferenceCell::vertex

Replace uses of GeometryInfo.

Extend documentation

Changelog entry

New test case

Enable PreconditionChebyshev to update a sub-range of vector entries

Rename Functions::LevelSet -> Functions::SignedDistance

Fix order of vertices of wedges in ReferenceCell::vertex

Merge pull request #12843 from bangerth/refcell

Systematize vertex construction.

Merge pull request #12841 from bangerth/dif2

Simplify some code by using std::any_of().

Systematize vertex construction.

Merge pull request #12811 from gfcas/doc_step_72

Correction of comments in step-72

Simplify some code by using std::any_of().

Also move the variables so initialized out of the if-branch in this
function because I want to use them also in the else-branch in a follow-up.

Merge pull request #12837 from peterrum/QIterated_varying_subdivisions

QIterated: varying subdivisions

QIterated: varying subdivisions

Merge pull request #12840 from peterrum/hp_create_laplace_matrix

Fix MatrixCreator::create_mass/laplace_matrix for hp

Fix MatrixCreator::create_mass/laplace_matrix for hp

Merge pull request #12839 from drwells/use-more-std-array

Use some more std::arrays.

Merge pull request #12830 from tjhei/large-tria-checkpoint

fix checkpointing for >4GB files

Use some more std::arrays.

Incredibly, on my machine with max optimizations, valgrind complains about
unknown instructions with std::vector but does not with std::array.

Merge pull request #12836 from peterrum/mg_transfer_global_coarsening_identity

Fix determination of identity in MGTwoLevelTransfer

Fix determination of identity in MGTwoLevelTransfer

Merge pull request #12829 from peterrum/celldata_assert

Add assert to check the definition of CellData

Merge pull request #12833 from bangerth/simplify

Simplify a piece of code.

Merge pull request #12834 from bangerth/assert

Add one, fix another assertion.

Merge pull request #12835 from peterrum/mg_transfer_global_coarsening_include

Add include to mg_transfer_global_coarsening.h

Add include to mg_transfer_global_coarsening.h

Add one, fix another assertion.

Simplify a piece of code.

Add assert to check the definition of CellData

Minor text updates to the step-49 gmsh discussion.

adjust variable name

Fix tests.

Do not communicate vertices automatically to p4est in debug mode.

Merge pull request #12341 from konsim83/feature_p4est_find_partition

Feature p4est find partition - Find MPI ranks of point owners in distributed meshes

fix checkpointing for >4GB files

We incorrectly compute MPI_Offset for MPI IO for checkpointing using
SolutionTransfer using 32 bit indices, which means that files larger
than 4GB end up being corrupted.
This manifests in errors like

n error occurred in line <749> of file
<../source/distributed/tria_base.cc> in function
void dealii::parallel::DistributedTriangulationBase<dim,
spacedim>::load_attached_data(unsigned int, unsigned int, unsigned int,
const string&, unsigned int, unsigned int) [with int dim = 3; int
spacedim = 3; std::string = std::__cxx11::basic_string<char>]
The violated condition was:
(cell_rel.second == parallel::DistributedTriangulationBase<dim,
spacedim>::CELL_PERSIST)

part of #12752

Merge pull request #12827 from bangerth/reference-cell

Implement ReferenceCell::vertex().

Add a changelog entry.

Use ReferenceCell::vertex() in two places.

Implement ReferenceCell::vertex().

Merge pull request #12828 from bangerth/nvector

Implement functions within instead of outside a namespace.

Merge pull request #12824 from bangerth/data-out-faces

Make DataOutFaces work with simplex meshes.

Implement functions within instead of outside a namespace.

Add a changelog entry.

Add test.

Avoid assertions on simplex meshes.

Implement communication-free owner rank search (p4est interface).

Merge pull request #12797 from gfcas/hp_kelly_1d_assert

hp Version of KellyErrorEstimator<1,spacedim>

Merge pull request #12818 from kronbichler/remove_quadrature_formula_attribute

step-70: Remove quadrature_formula class attributes

Merge pull request #12820 from gfcas/typos

Fix typos

Update include/deal.II/hp/refinement.h

Co-authored-by: Daniel Arndt <arndtd@ornl.gov>

Fix typo

Fix typos

step-70: Remove quadrature_formula class attributes

Merge pull request #12803 from peterrum/va_initializer_list

VectorizedArray: accept std::initializer_list

Merge pull request #12812 from gfcas/step72-quadrature

step-72: Remove double quadrature_formula definition