Merge pull request #16666 from tamiko/relicensing-preliminaries

Relicensing: require all new contributions to be dual licensed

Merge pull request #16691 from mschreter/particle_handler_tolerance_inside_cell

`ParticleHandler`: use tolerance for is_inside_unit_cell() check

add tolerance for inside cell check

Merge pull request #16690 from masterleinad/fix_one_colon

Fix typo one ':' between class names

Fix typo one ':' between class names

Merge pull request #16663 from kinnewig/tpetra_wrappers_conversion_assignment

Declare conversion assignments for Tpetra vectors.

Merge pull request #16641 from MalikScheifinger/fixing_complex_valued

Added complex sparse matrix instantiations.

Declare conversion assignments for Tpetra vectors.

Merge pull request #16687 from masterleinad/fix_boundary_manifold_step_54_docs

Fix OpenCASCADE::*Boundary references to OpenCASCADE::*Manifold in step-54 docs

Fix OpenCASCADE::*Boundary references to OpenCASCADE::*Manifold in step-54 docs

doc: remove outdated license information from readme.html

We summarize all license related information in LICENSE.md

Merge pull request #16685 from tamiko/relicensing-preliminaries-2

Relicensing: update .mailmap

ran indent

Merge pull request #16659 from marcfehling/trilinos_readme

Update Trilinos readme.

Merge pull request #16680 from bangerth/doc

Minor updates to the documentation of a few functions.

Merge pull request #16675 from gassmoeller/writable_reference_particle_location

Add function to retrieve a writable reference to particle locations

Mailmap: add missing entries

Mailmap: sort and compactify

doc: update license information

Relicensing: update CONTRIBUTING.md

Relicensing: update LICENSE.md

Merge pull request #16682 from masterleinad/ci_matrix_free_kokkos

GitHub CI: Also compile matrix_free_kokkos tests in CUDA CI

Merge pull request #16681 from bangerth/efficiency

Minor efficiency improvement.

Merge pull request #16683 from masterleinad/tpetra_complex_solver_direct

Tpetra: Fix instantiations for SolverDirect* with complex number types

GitHub CI: Also compile matrix_free_kokkos tests in CUDA CI

Tpetra: Fix instantiations for SolverDirect* with complex number types

Add test

Make indent

Modify usage and include in tests

Minor efficiency improvement.

Merge pull request #16679 from masterleinad/tpetra_fix_complex

Tpetra: Fix compiling with complex values

Merge pull request #16676 from masterleinad/tpetra_clear_row

Tpetra: Add SparseMatrix::clear_row[s]

Minor updates to the documentation of a few functions.

Merge pull request #16674 from tamiko/fix_cmake_optimized_debug_keywords

CMake: honor `optimized`,`debug`, and `general` keywords in `LIBRARIES` and `TARGETS`

Merge pull request #16670 from bangerth/size-type

Use size_type as return type of SparseMatrix::m().

Merge pull request #16677 from bangerth/t-8

Add Tpetra SparseMatrix::matrix_scalar_product() and matrix_norm_square().

Add a changelog entry.

Fix compiling clear_rows with newer Trilinos versions

Let clear_rows take an ArrayView argument

Tpetra: Fix compiling with complex values

reworked test file and added ouput file

Merge pull request #16673 from mschreter/fix_flux_sparsity_FE_Nothing

Fix `make_flux_sparsity_pattern` for `FENothing`

Add some missing assertions.

Add tests.

Add Tpetra SparseMatrix::matrix_scalar_product() and matrix_norm_square().

Tpetra: Add SparseMatrix::clear_row[s]

Add writeable particle location reference

Merge pull request #16672 from masterleinad/tpetra_is_non_negative

Tpetra: Implement Vector::is_non_negative

CMake: update comment

CMake: bugfix: honor debug,optimized,release keywords in LIBRARIES and TARGETS

fix make_flux_sparsity_pattern for FENothing

Merge pull request #16650 from bangerth/sundials7

Add output variants for SUNDIALS 7.

Merge pull request #16457 from bangerth/assume

[C++23] When using C++23, use [[assume]] attribute.

Tpetra: Implement Vector::is_non_negative

Merge pull request #16651 from bangerth/sundials7-2

Add the remaining SUNDIALS 7 output variants.

Merge pull request #16669 from masterleinad/fix_bundled_boost_unary_function

Fix bundled boost 1.70.0 to avoid using std::unary_function

Use size_type as return type of SparseMatrix::m().

Merge pull request #16668 from kinnewig/tpetra_wrappers_fix

Make LA::TpetraWrappers::SparseMatrix::copy_from compatible with older Trilinos versions.

Fix bundled boost 1.70.0 to avoid using std::unary_function

Make LA::TpetraWrappers::SparseMatrix::copy_from compatible with older Trilinos versions.

Merge pull request #16588 from kinnewig/tpetra_block_system

Add TpetraWrapper::BlockVector and TpetraWrappers::BlockSparseMatrix

Merge pull request #16660 from jpthiele/rm-vout

Remove verbose output from Tpetra direct solver

Merge pull request #16664 from kinnewig/tpetra_wrappers_comparison_operator

Add a comparison operator to LA::TpetraWrappers::Vector

Add a comparison operator to LA::TpetraWrappers::Vector

Add reinit() method to create a LA::TpetraWrappers::SparseMatrix from a dealii::SparseMatrix.

Rework reinit_matrix in LA:TpetraWrappers::SparseMatrix

Make TpetraWrapps::Vector compatible with BlockVectorBase.

Make TpetraWrapps::SparseMatrix compatible with BlockMatrixBase.

Introduce TpetraWrappers::BlockSparseMatrix

Introduce TpetraWrappers::BlockVector

Remove verbose output from direct solver

Merge pull request #16602 from jpthiele/tpetra-solverdirect

Add SolverDirect for Tpetra Wrappers

Add initial support for Amesos2

Update Trilinos readme.

Merge pull request #16657 from drwells/extrude-assert

Assert that we only extrude quadrilateral meshes.

Merge pull request #16654 from bangerth/enable-if

Only enable a function if a template type is right.

Assert that we only extrude quadrilateral meshes.

Extruding mixed or triangle meshes requires wedges: this isn't implemented yet.

Merge pull request #16645 from sebproell/nvector-multi

SUNDIALS N_Vector: implement efficient operations

Remove an unnecessary 'inline'.

Merge pull request #16632 from peterrum/compute_active_cell_halo_layer_pbc

GridTools::compute_active_cell_halo_layer() for periodic meshes

Merge pull request #16633 from kronbichler/fix_empty_comm

MG transfer global coarsening: Avoid sending empty messages

Merge pull request #16647 from bangerth/t-7

Add Tpetra tests that are already working.

Merge pull request #16653 from tamiko/fix_mpi_datatype

Fix segmentation fault when using mpich

Add output variants for SUNDIALS 7.

Add Tpetra tests that are already working.

Add the remaining SUNDIALS 7 output variants.

Only enable a function if a template type is right.

base/mpi.h: mark a template variable to have "const inline" linkage.

base/mpi.cc: remove superfluous explicit instantiations of template variable

The `mpi.h` header already contains:
```
template <typename T>
const MPI_Datatype mpi_type_id_for_type = /* implementation detail */;
```
Meaning, the variable is known fully after including the header.
Furthermore, the `const` qualifier marks the (template) variable as
`static`. I.e., it has internal linkage.

Thus, we must not explicitly instantiate the variables (suggesting
"extern" linkage in all but the `mpi.cc` compilation unit). This
apparently not an issue with OpenMPI because `MPI_Datatype` is a
complex data structure. But it is an issue with mpich where
`MPI_Datatype` is a simple `int` - leading to a segmentation fault when
during program startup.

SUNDIALS N_Vector: implement efficient operations

These operation are only supported by deal.II vectors.

Merge pull request #16648 from masterleinad/tpetra_sparse_matrix_frobenius

Tpetra: Add frobenius_norm to SparseMatrix

Merge pull request #16649 from masterleinad/fix_optional_header_tpetra_vector

Add missing <optional> header for trilinos_tpetra_vector.h

Merge pull request #16646 from jpthiele/testsuite-documentation

Add info for TPLs to testsuite doc.

Add missing <optional> header for trilinos_tpetra_vector.h

Tpetra: Add frobenius_norm to SparseMatrix

Add info for TPLs to testsuite doc.

Merge pull request #16629 from masterleinad/github_ci_trilinos_tpetra

GitHub CI: Test building with Trilinos+Tpetra

Merge pull request #16637 from bangerth/t-5

Fix Tpetra vector element access.

Merge pull request #16640 from bangerth/doc

Clarify the documentation of IndexSet::is_empty().

Use 'auto' instead of declaring a complicated type.