extend text output and comments

fix Trilinos sparsity test output

Merge pull request #7814 from masterleinad/fix_test_target_msvc

Fix 'test' target for MSVC

Merge pull request #7850 from bangerth/docs

Revamp the layout of the main 'index.html' file.

Merge pull request #7833 from tjhei/trilinos_sp_error

add Trilinos error checks and fix nonlocal sparsity graph entry

Merge pull request #7847 from masterleinad/fix_vector_memory_cuda

Fix problem with GrowingVectorMemory for LinearAlgebra::distributed::Vector<Number, MemorySpace::CUDA>

Merge pull request #7861 from loganharbour/l2_doco

Additional doco LocalIntegrators::L2

Additional doco for L2 integrators

Merge pull request #7862 from jppelteret/trilinos_amg_doc_01

Add documentation for initialising Trilinos AMG constant modes

Add documentation for initialising Trilinos AMG constant modes

Fix problem with GrowingVectorMemory for LinearAlgebra::distributed::Vector<Number, MemorySpace::CUDA>

Merge pull request #7764 from masterleinad/detect_cuda_compute_capability

Detect CUDA compute capability

Merge pull request #7840 from luca-heltai/propagate-manifold

New assign_co_dimensional_manifold_indicators function.

Update include/deal.II/grid/grid_tools.h

Co-Authored-By: luca-heltai <luca.heltai@sissa.it>

add Trilinos error checks and fix nonlocal sparsity graph entry

- Bugfix: Use GID64(0) instead of MyGID(0) which is a bool
- add more checks to other function calls
- add comments
- fix for rectangular patterns

Merge pull request #7843 from davydden/feature/dsp_nonempty_cols_rows

add DynamicSparsityPattern::nonempty_cols() and nonempty_rows()

Merge pull request #7793 from jppelteret/trilinos_ml_parameter_list

Add useful methods to TrilinosWrappers::PreconditionAMG::AdditionalData

add DynamicSparsityPattern::nonempty_cols() and nonempty_rows()

Merge pull request #7828 from davydden/feature/dsp_gather_mpi

Add SparsityTools::gather_sparsity_pattern()

Merge pull request #7841 from luca-heltai/fevalues-views-traits

FEValuesViews output traits

Merge pull request #7845 from masterleinad/remove_index_set_overloads_dataout

Remove IndexSet overloads in DataOut and FEValues

Merge pull request #7801 from masterleinad/msvc_cxx17

Allow CXX14/17 autodetection for MSVC

Merge pull request #7857 from masterleinad/rename_generated_changes_file

Rename file generated by doc/news/changes/header

Merge pull request #7858 from tamiko/fix_symengine

CMake: Also filter SYMENGINE_CXX_FLAGS

CMake: Also filter SYMENGINE_CXX_FLAGS

Rename file generated by doc/news/changes/header

Merge pull request #7856 from luca-heltai/mesh_loop_with_class

New variant of mesh_loop.

Merge pull request #7855 from jppelteret/sd-doc_01

Add SymEngine to the readme file in the documentation

Fixed indent.

More descriptive name.

Make sure we only change manifold ids once per face/edge.

Added flag to control overwriting of non flat manifold ids.

Update include/deal.II/grid/grid_tools.h

Co-Authored-By: luca-heltai <luca.heltai@sissa.it>

Added flat to control overwriting of non flat manifold ids.

New assign_co_dimensional_manifold_indicators function.

Pass queue_length and chunk_size to inner call to mesh_loop()

Improve example in new mesh_loop function

Fixed typos.

Remove a helper function for DataOut_DoFData

Range-based for loop

Create local variables in output_results

FEValuesViews::View<dim,spacedim,Extractor>

New variant of mesh_loop.

Merge pull request #7854 from jppelteret/ad-rename_helper_classes

Rename the helper classes in the Differentiation::AD namespace

Merge pull request #7834 from luca-heltai/extractor-names

Added get_names to Extractors.

add SparsityTools::gather_sparsity_pattern()

Merge pull request #7838 from davydden/feature/ascending_partitioning

add Utilities::MPI::create_ascending_partitioning()

Added Tensor<0> instantiation

Add SymEngine to the readme file in the documentation

Merge pull request #7853 from masterleinad/fix_scalapack

Also link with LAPACK libraries in SCALAPCK symbol test

Rename the helper classes in the Differentiation::AD namespace

add Utilities::MPI::create_ascending_partitioning()

make MPILogInitAll work without MPI

Merge pull request #6981 from jppelteret/ad-helpers_07

AD Helpers: Add helper for vector functions (QP-level)

Merge pull request #7836 from tjhei/fix_tbb_64bit

fix tbb range size type

Added get_names to Extractors, and moved implementation to cc file.

Merge pull request #7766 from davydden/feature/refactor_sparsity_pattern

split SparsityPattern into a base class and derived class with a spec…

Also link with LAPACK libraries

Merge pull request #7831 from davydden/feature/dsp_distribute_modernize

use Utilities::MPI::some_to_some() in SparsityTools::distribute_spars…

Revamp the layout of the main 'index.html' file.

Merge pull request #7839 from tamiko/fix_cmake_summary

CMake: also update BASE_LINKER_FLAGS* when dropping -fuse-ld=...

Add a changelog entry for ADHelperVectorFunction

AD Helpers: Add helper for vector functions (QP-level)

Mark some member functions of ADHelperScalarFunction as static

Improve documentation of ADHelperScalarFunction

Merge pull request #7846 from masterleinad/fix_data_out_13

Fix data_out_13 in case there is no ZLIB support

Merge pull request #7813 from jppelteret/sd-basic_tests

Add some basic tests for SymEngine

Merge pull request #7837 from masterleinad/check_scalapack_symbols

Fix SCALAPACK symbol check

use 64 bit tbb range

split SparsityPattern into a base class and derived class with a special treatment for diagonal matrices

further cleanup of distribute_sparsity_pattern()

Fix data_out_13 in case there is no ZLIB support

Remove IndexSet overloads in DataOut

use range loop in SparsityTools::distribute_sparsity_pattern()

Merge pull request #7807 from masterleinad/fix_msvc_cxx17_boost

Fix compiling bundled boost with MSVC and C++17

Merge pull request #7832 from tjhei/step-15-doc

step-15: small doc update

CMake: also update BASE_LINKER_FLAGS* when dropping -fuse-ld=...

Fix SCALAPACK symbol check

fix tbb range size type

step-15: doc update

use Utilities::MPI::some_to_some() in SparsityTools::distribute_sparsity_pattern(), improve const-correctness

Merge pull request #7792 from drwells/fix-doc-frame-link

Fix link targets in frames.

Merge pull request #7827 from masterleinad/fix_tpetra_fabs_complex

Fix Tpetra test for std::fabs without std::complex overload

Merge pull request #7816 from tamiko/workaround_for_ldlld

CMake: Reorganize MPI sanity check

Add quick test for SymEngine

Update CMake configuration of SymEngine libraries.

Merge pull request #7763 from drwells/fix-dual-dof-handler-sparsity

Fix dual dof handler sparsity

Fix Tpetra test for std::fabs without std::complex overload

Merge pull request #7818 from masterleinad/apply_all_indicators_ucd_cell

Set cell manifold ids when the apply_all_indicators_to_manifold flag is used.

Merge pull request #7820 from masterleinad/check_scalapack_symbols

Check SCALAPACK symbols

Merge pull request #7825 from Rombur/fix_no_threads

Add missing #ifdef DEAL_II_WITH_THREADS around tbb calls

Unify two symbol checks

Add missing #ifdef DEAL_II_WITH_THREADS around tbb calls

CMake: Refactor MPI sanity check into setup_finalize.cmake

Revert "Only permit use of ld.lld linker when the Clang compiler is used."

This reverts commit 7ca10c52d89ec0e201320acaa9b34822d47779df.

CMake: Reorganize MPI sanity check

Fix a bug in make_sparsity_pattern(dh, dh, sp).

This function relied GridTools::get_finest_common_cells which was
written before any of the parallel triangulations were implemented and
thus assumed that all cells without children were active. This commit
modifies that function to only return active cells that are also locally
owned, which fixes the sparsity pattern function.

Reflow comments.

Simplify setting of CMake SymEngine version variable

Merge pull request #7808 from Rombur/tbb

Encapsulate the calls to tbb::parallel_for