update python tools scripts

- also check for empty lines in html tables
- improve one of the error messages

Merge pull request #8315 from kronbichler/fix_changelog_typo

Fix typo and language inaccuracy in 9.1 changelog

Fix typo and language inaccuracy in 9.1 changelog

Merge pull request #8302 from mathsen/extract_dofs_parallel

Changed extract_dofs so that it works in parallel

Fixed regression with older compilers

Merge pull request #8311 from kronbichler/fixup_pr8298

Avoid unused variable in dof_handler_policy.cc

Merge pull request #8310 from adam4130/step-63-shuffle

Use std::shuffle

Avoid unused variable

Make incompatibility more clear

Include the algorithm library

Merge pull request #8304 from marcfehling/soltrans-dominate

Apply FEDomination algorithm on non-distributed SolutionTransfer.

Use std::shuffle

Merge pull request #8298 from kronbichler/mpi_exscan

Replace MPI_Allgather by MPI_Exscan

fixed typo in include guard

added mpirun=1 so that test 12a just runs with MPI

Use new compute_... functions in tutorial steps

Use new compute_locally_owned_dofs_per_processor

Add changelog

Adapt tests to the new compute_..._per_processor() functions

Backwards compatibility for locally_owned_dofs_per_processor

Update tests with respect to locally_owned_dofs_per_processor

Replace MPI_Allgather by MPI_Exscan

Do not store the index sets of all processors on each processor.
Fill them on demand.

Forgot to push dof_tools_common_fake_hp.h in last commit

Renamed dof_tools_fake.inst.in, added changelog entry

Indendation...

Update so that extract_dofs() doesn't depend on dim or spacedim template parameters anymore. Unifying test suite, with the hope to make things easier in the future.

united extract_dofs() for DoFHandler and hp::DoFHandler, drawback: auto deduction not working anymore in some other places

Apply FEDomination algorithm on non-distributed SolutionTransfer.

explained in more detail the behaviour of extract_dofs

Added more detailed explanation about the output of the test

Fixed indentation

Changed dof_tools_12a to include more complicated FE systems and output all locally owned components (not mapped to global DoFs)

Added small test for extract_dofs() with DoFHandler and hp::DoFHandler in parallel

Merge pull request #8197 from kronbichler/fix_torus

Improve GridGenerator::torus, volume case (dim=3)

Merge pull request #8301 from kronbichler/typo_step_17

Fix typo in link for the step-17 introduction

Add picture of torus mesh on the coarsest level

changed extract_dofs so that it works in parallel

Fix typo in link for the step-17 introduction

Merge pull request #8294 from bangerth/interpolate

Add InterpolatedUniformGridData::gradient().

Fix typo in test

Improve in-code documentation

Add changelog

Update the torus grid and its test case

Merge pull request #8277 from masterleinad/fix_trilinos_sp_empty_col_map

Fix compressing TrilinosWrappers::SparsityPattern with empty column map

Merge pull request #8296 from bangerth/sort

Sort implementations of GridTools::cell_measure by dimension.

Sort implementations of GridTools::cell_measure by dimension.

Merge pull request #8278 from rezarastak/table_accessor_conversion_operator

conversion operator is written for table accessor

Merge pull request #8226 from bangerth/63.2

Updates to the step-63 program.

Introduce the term GMG.

Updates to the step-63 program.

Add a changelog entry.

Add a test.

Add InterpolatedUniformGridData::gradient().

Apply suggestions from code review

Small fixes from PR review

Co-Authored-By: Daniel Arndt <arndtd@ornl.gov>

Check for the numer of global values instead

Add tests

Merge pull request #8288 from bangerth/comment

Update a couple of comments for DataOutFaces.

Merge pull request #8285 from tamiko/fix_a_test_2

fix test concurrency

conversion operator is written for table accessor

tests created for packing and unpacking a matrix

changelog added

Merge pull request #8287 from tamiko/update_changes-2

[master] Take over changes and news from 9.1 branch

Update a couple of comments for DataOutFaces.

Take over changes and news from 9.1 branch

fix test concurrency

Merge pull request #8269 from masterleinad/gmsh_mesh_format_4_1

Add tests for gmsh-4.3

Add tests for gmsh-4.3

Merge pull request #8281 from tamiko/fix_a_test

mpi/solution_transfer_03: fix test concurrency

mpi/solution_transfer_03: fix test concurrency

Merge pull request #8279 from masterleinad/fix_gridin_read_mesh

Fix GridIn::read_msh

Fix GridIn::read_msh

Fix compressing TrilinosWrappers::SparsityPattern with empty column map

Merge pull request #8272 from GivAlz/FixDoiStep60

Fixed doi for step-60

Fixed doi for step-60

Merge pull request #8265 from masterleinad/gmsh_mesh_format_4_1

Allow for gmsh mesh format 4.1

doc: move news entry

Update doc/news/changes/minor/20190521DanielArndt

Co-Authored-By: Martin Kronbichler <kronbichler@lnm.mw.tum.de>

Allow for gmsh mesh format 4.1

Merge pull request #8263 from tamiko/fix_test_concurrency

sacado: fix test concurrency

sacado: fix test concurrency

Merge pull request #8261 from tamiko/pr_8260

[master] Take over #8260

Cleanup documentation: find_common_subspace()

Merge pull request #8257 from drwells/add-class-doc-stubs

Add two brief class descriptions.

Merge pull request #8256 from drwells/update-91-changes

Update 9.1 changes

Add two brief class descriptions.

These are mentioned in other files and we need at least a stub here to
make the classes show up in doxygen.

Improve a few 9.1 changelog entries.

1. Add a link to GinkgoWrappers::SolverBase
2. Fix description of Subscriptor changes
3. delete some duplicate changelog entries
4. Use %Function where appropriate
5. Minor grammar fixes

Fix doxygen links in the 9.1 changelog.

Merge pull request #8230 from tamiko/disable_two_tests

Disable two ADOL-C tests in release configuration

Merge pull request #8242 from bangerth/64.2

Rework the first part of step-64.

Merge pull request #8237 from bangerth/64

Update the introduction to step-64.

Merge pull request #8244 from bangerth/64.4

Step-64 also depends on step-40.

Merge pull request #8247 from bangerth/dep

Fix a dependency between tutorial programs.

Merge pull request #8238 from bangerth/51

Mention step-61 in the introduction of step-51.

Fix a dependency between tutorial programs.

The format in which this was previously stated was just wrong.

Step-64 also depends on step-40.

More updates of examples/step-64/step-64.cu

Co-Authored-By: Daniel Arndt <arndtd@ornl.gov>

Update the introduction to step-64.

While there also adjust the dependencies.

Merge pull request #8236 from bangerth/61

Fix the dependencies of step-61.

Merge pull request #8246 from masterleinad/change_cudawrappers_mf_point_type

Change CUDAWrappers::MatrixFree::point_type to Point

Clarify size of coef

Merge pull request #8243 from bangerth/64.3

Update the results section of step-64.

Change CUDAWrappers::MatrixFree::point_type to Point