On DEC Alpha running OSF1, implicitely instanciated templates are
marked ``local text'', so they are not exported outside of object
files. This prevented that we link to GridOut::write_eps. Therefore,
explicitely instantiate these functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3449 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Hopefully final comment on OSF!

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3448 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More on DEC OSF1.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3447 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Many changes to GridReordering. Will have to clean up and have to test that more, but in a usable state at least.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3446 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make the SparseMatrix(SparsityPattern&) constructor explicit to avoid
nasty bugs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3445 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

cell->point_inside()

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3444 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move reference to IRIX to separate page.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3443 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3442 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Installation instructions for SGI IRIX.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3441 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Micro change.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3440 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Embrace Windows.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3439 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add doc.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3438 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Docs for point_inside, and 1d version.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3437 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change doc.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3436 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New transform_unit_to_real_cell and transform_real_to_unit_cell functions in FiniteElement

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3435 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Replace `make' by `$(MAKE)'

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3434 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New transform_real_to_unit_cell function in FiniteElement

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3433 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

This http: with local path circumvented our validate-xrefs script, so
modify it.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3432 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Externalize OSF docs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3431 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Notes on DEC Alpha OSF1.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3430 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

This http: with local path circumvented our validate-xrefs script, so
modify it.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3429 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New transform_unit_to_real_cell function in FiniteElement

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3428 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

reconstruct old block_write/read format (MT save).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3427 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

On OSF1, the assembler can't handle long symbols, so we have to use
-gstabs instead of -ggdb there.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3426 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3425 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3424 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3423 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3422 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3421 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3420 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3419 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

DEAL_II_CHECK_ASSERT_THROW

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3418 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3417 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3416 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Further change the way AssertThrow works, as the previous approach did
not work as hoped for.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3415 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

check for point in cell

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3414 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc update. Rename NO_THROW, make it a configure parameter and change
the way the exception works in that case.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3413 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add docs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3412 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

This NO_THROW branch in AssertThrow was quite bogus!

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3411 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Dsiable shared libs on Alpha DEC OSF.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3410 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Both QUIET_SUBSCRIPTOR as well as NO_THROW are no more supported.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3409 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

GridRefinement::refine_and_coarsen_optimize

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3408 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3407 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add some doc.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3406 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implementation of 3d boundary data in UCD format and in Triangulation<3>::create_triangulation by Michael Stadler <ms@biomech.tu-graz.ac.at>.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3405 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update author list.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3404 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement some small things for reading 3d grid in UCD, and reorder
cells when reading them in UCD.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3403 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add collect_args functions that do not take pointers but references to
objects. They are only for convenience, as one always forgets that we
need `this', but `&object'.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3402 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add grid refinement with optimization

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3401 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Structure better the list of 3d rotations, if anyone would like to
verify them again (I think they are correct, though).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3400 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Note gcc3.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3399 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid errors about undeclared sqrt and fabs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3398 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid warning about possibly unitialized variable.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3397 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Define (not only declare) static variable.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3396 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Define (not only declare) static variable.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3395 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

And remove duplicate initialization.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3394 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Ups, forgot class spec.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3393 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Define (not only declare) static variable.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3392 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update to configure.in

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3391 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Several changes for newer compiler. Also fix a bug where we checked for GXXVERSION, where GXX_VERSION was meant.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3390 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't compare against empty strings on linux. rather, add an 'x' to both sides, or some such thing.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3389 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid warning for missing math function declarations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3387 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improved breakdown criterion?

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3386 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

transposed SOR

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3385 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

improved version

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3384 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix same problems as with previous two commits, but this time in
another class.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3383 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3382 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid warnings when trying to use doubles as arguments for an int parameter.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3381 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid error with undefined fabs/sin/cos/sqrt with gcc2.97

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3380 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid error with undefined fabs with gcc2.97

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3379 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid some strange error message with gcc snapshot 2.97/20001002

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3378 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid warning for double->int conversion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3377 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

subsume gcc snapshots 2.96 and 2.97 under gcc version 2.95 as well, as
they should support the same compiler flags

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3376 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement the 3d part of grid_reordering.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3375 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

First part of 3d work.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3374 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More post-fixes to strip long path names.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3373 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't use empty class decls {};, but rather put the braces on separate lines. This avoid confusing kdoc which only reads the opening brace and thinks that all that is following in this file is local to the class that was opened.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3370 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3369 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3368 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Some functions can be implemented in a dimension independent way. Do so.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3367 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3366 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix missing forward declarations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3365 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Delete unused vertices. Debug output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3364 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3363 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Additional exception.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3362 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't use a stack any more, but rather a vector, as sometimes we need
random access.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3361 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Write a function that deletes unused vertices.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3360 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement more of the algorithm.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3359 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

In create_triangulations, when we throw hard exceptions (not through
Assert, but AssertThrow), then we call clean() before to bring the
triangulation back into a reasonable state. However, clean() wants
that there be no subscriptions beforehand, so we temporarily disable
them and re-enable them afterwards again.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3358 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Ugh, forgot to escape quotes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3357 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Accept @url{....} as well.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3356 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

DB Mesh format.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3355 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid compiler message in 1d.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3354 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix missing header include in the .h file, omit it in .cc.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3353 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix missing header include.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3352 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a class that implements reordering of grids whenever this is
necessary to fulfill the assumptions of the triangulation class.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3351 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Small clean-ups.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3350 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CellData::rotate.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3349 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clear the triangulation if create_triangulation fails with an
exception. In principle, one could catch the exception and restart
with modified data, e.g. if the failure was caused by wrongly ordered
cells or the like.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3348 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement DBMesh input.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@3347 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d