Merge pull request #9792 from dougshidong/vector_adaptor_ghosted

Allow vector_adaptor to work on ghosted vectors.

Merge pull request #9836 from peterrum/tpetra_doxygen

Make TpetraWrappers appear in Doxygen

Make TpetraWrappers appear in Doxygen

Merge pull request #9837 from peterrum/epetra_link_update

Update Epetra link

Update Epetra link

Merge pull request #9834 from tamiko/typos_1

Step-63: Fix two typos

Merge pull request #9803 from kronbichler/fix_hyperball_manifold_2d

Fix oversight in GridGenerator::hyper_ball in 2d

Step-63: Fix two typos

Merge pull request #9825 from peterrum/mpi_fix_warning

Fix warning in Utilities::MPI for serial release build

Fix warning in Utilities::MPI for serial release build

Merge pull request #9795 from peterrum/grid_in_fix

Fix GridIn::read_vtk

Merge pull request #9797 from peterrum/dofaccessor_remove_unused_function

Remove unused functions

Fix GridIn::read_vtk

Remove unused function

Merge pull request #9707 from peterrum/json_reduced_print

Print a reduced parameter tree for XML and JSON

Merge pull request #9739 from nfehn/grid_tools

GridTools/GridGenerator: add some functions to support dim-independent programming

Merge pull request #9799 from bangerth/cleanup

Minor cleanups.

Merge pull request #9808 from peterrum/dof_accessor_simplify_update_cell_dof_indices_cache

Simplify DoFCellAccessorImplementation::update_cell_dof_indices_cache()

Merge pull request #9805 from bangerth/69

Make the spelling of 'add_parameter()' arguments consistent.

Merge pull request #9816 from tjhei/boost_guard2

more boost warning guards

Fix oversight in GridGenerator::hyper_ball in 2d

Merge pull request #9818 from bangerth/doxygen

A few doxygen-related fixes.

A few doxygen-related fixes.

Merge pull request #8824 from rezarastak/discrete_time

The class DiscreteTime implemented.

Use American English spelling.

Also update the .prm file.

Make the spelling of 'add_parameter()' arguments consistent.

Specifically, always capitalize the first letter. Right now, it's inconsistent.

Minor cleanups.

Merge pull request #9811 from peterrum/dofhandler_instantiation

Simplify instantiation of DoFHandler and hp::DoFHandler

more boost warning guards

Merge pull request #9793 from kronbichler/mapping_q_quad_pts

MappingQGeneric: Copy mapping support points to quadrature points

Merge pull request #9813 from bangerth/cleanups-2

Simplify some code by using a range-based for loop.

Merge pull request #9636 from tamiko/reintroduce_aio

Step-69: Introduce asynchronous IO mechanism

Merge pull request #9814 from bangerth/assertion

Add a missing assertion.

The class DiscreteTime implemented.

add functions to support dim-independent programming

Merge pull request #9806 from bangerth/69-2

Use AE spelling 'disk' instead of BE spelling 'disc'.

Simplify DoFCellAccessorImplementation::Implementation::update_cell_dof_indices_cache()

Merge pull request #9810 from peterrum/dofhandler_blockinfo

Add functions accepting hp::DoFHandler to BlockInfo

fix documentation

refactor to use shared pointer

Refactor output thread; only perform IO asynchronously

add an configuration option

Revert "remove asynchronous IO mechanism"

This reverts commit 7980483d1654923c44f67491699b82e6b5ce4e51.

Merge pull request #9796 from kronbichler/improve_quarter_hyper_ball

Improve mesh quality of quarter hyper ball

Use AE spelling 'disk' instead of BE spelling 'disc'.

Merge pull request #9801 from masterleinad/remove_pointer_matrix

Remove PointerMatrix*

Add a missing assertion.

Simplify some code by using a range-based for loop.

Simplify instantiation of DoFHandler and hp::DoFHandler

Add functions accepting hp::DoFHandler to BlockInfo

Merge pull request #9758 from peterrum/parallel_namespace_problem

Explicitly spell dealii::parallel in multiple places

Remove PointerMatrix*

Changelog

Add pictures of new mesh

Improve mesh quality of quarter hyper ball

Merge pull request #9787 from luca-heltai/base64-encode-decode

Encode and decode Base64 format.

Merge pull request #9800 from masterleinad/minimize_boost_geometry

Minimize boost/geometry.h includes

Explicitly spell dealii::parallel in multiple places

Removed old Base64 code from data_out_base.cc

Encode and decode Base64 format.

Minimize boost/geometry.h includes

Merge pull request #9786 from masterleinad/remove_filteredmatrix

Remove deprecated class FilteredMatrix

Merge pull request #9791 from peterrum/DoFAccessor_use_hp_cache

Simplify DoFCellAccessor::distribute_local_to_global()

Simplify DoFCellAccessor::distribute_local_to_global()

Test case

Shortcut tensor product path in case of collocation

Allow vector_adaptor to work on ghosted vectors.

Previous implementation did not work on ghosted vectors since it used
compress().

The test on ghosted vectors did not truly test for ghosted vectors
since it used the copy constructor of LA::distributed::Vector,
which does not fill the ghosted entries.

Merge pull request #9789 from tjhei/point_no_boost_all

remove boost/geometry.hpp from Point

Merge pull request #9783 from peterrum/ph_pattern_segfault

Pass ExcNoMatch the description directly

remove boost/geometry.hpp from Point

We are including point.h in large parts of deal.II and the
boost/geometry/ header is a shortcut to include all of boost geometry.
Instead, only selectively include the parts we actually need. This
should speed up compilation of deal.II.

Merge pull request #9785 from masterleinad/remove_swappable_vector

Remove SwappableVector

Remove SwappableVector

Remove deprecated class FilteredMatrix

Merge pull request #9767 from kronbichler/mapping_info_output_variants

Add output variants for new MF::MappingInfo test

Merge pull request #9784 from masterleinad/constructor_eigenvalueinformation

Implement default initializer for EigenvalueInformation

Pass ExcNoMatch the description directly

Implement default initializer for EigenvalueInformation

Merge pull request #9490 from simonsticko/add_hyper_cube

Add header quadrature_generator.h

Add header quadrature_generator.h

Add a header to be used for implementing a QuadratureGenerator class, which
should generate immersed quadrature rules for the different regions of a cell
intersected by the zero contour of a level set function. Add a hypercube class
in a internal namespace QuadratureGeneratorImplementation, which is needed to
implement the underlying algorithm.

Merge pull request #9781 from kronbichler/bug_mg_ghost_layer_periodic

Fix a bug in mg ghost layer with periodicity and n_levels=1

Merge pull request #9780 from bangerth/26

Output time and time step in step-26.

Merge pull request #9779 from masterleinad/remove_mg_set_debug

Remove Multigrid::set_debug()

Merge pull request #9668 from agrayver/remove_doc_copypaste

Use copydoc for Python wrappers

Changelog

Test case

Make sure periodicity is set before constructing hierarchy

Update a changelog entry.

Output time and time step in step-26.

Change log entry

Update tests

Use signals in Multigrid::level_step()

Merge pull request #9773 from peterrum/paths_fix_order

Fix order of module graphs

Merge pull request #9775 from kronbichler/fix_utilities_pow

Avoid unnecessary integer overflow in Utilities::pow()

Merge pull request #9772 from bangerth/graph

Further try and disentangle the tutorial graph a bit.

Merge pull request #9776 from kronbichler/typo_mapping_info

MappingInfo: Use correct update flags for face quadrature fields

MappingInfo: Use correct update flags for face quadrature fields

Two test cases

Avoid unnecessary integer overflow of Utilities::pow()

Fix order of module graphs