Merge pull request #14660 from bangerth/array

Merge pull request #14659 from bangerth/vtu-1

Merge pull request #14654 from bangerth/array-view

Merge pull request #14658 from bangerth/vtu-2

Use std::array instead of a C-style array.

Augment documentation of DataOutBase::Patch.

Do not write gratuitous output files into test directories.

I don't think we still need those. If someone needs to look at this test in detail
again at a future time, it's easy enough to add these lines again by hand.

Merge pull request #14653 from bangerth/ref-99

Merge pull request #14655 from bangerth/av-2

Merge pull request #14610 from CodyGirl/lapack-documentation

doc: add documentation for lapack library linking support

Improve grammar in error messages.

Add new test.

Provide overloads of make_array_view() for std::array.

Add a changelog entry.

Add to the documentation of ArrayView.

Get rid of a template argument on an exception.

Merge pull request #14651 from drwells/unhardcode-6s

Merge pull request #14649 from masterleinad/update_clang_tidy

Update clang-tidy checks for recent clang versions

un-hardcode some 6s.

This makes it clear that we want to use the maximum number of faces in 3D.

Merge pull request #14647 from drwells/remove-begin-raw

Avoid using Tensor::begin_raw() et al.

Merge pull request #14604 from drwells/refactor-orientation

Add a dedicated class for orientation information.

Remove cppcoreguidelines-pro-type-cstyle-cast

Revert "Cast MPI_STATUS[ES]_IGNORE"

This reverts commit 0ef0138a68f82cbf1ce759e1b5aaa38a2519df31.

Cast MPI_STATUS[ES]_IGNORE

Update source/lac/sparsity_tools.cc

Co-authored-by: David Wells <drwells@email.unc.edu>

Update clang-tidy checks for recent clang versions

Merge pull request #14594 from jppelteret/scratch_data_interfaces_01

Extend ScratchData to support hp for interfaces

Avoid using Tensor::begin_raw() et al.

These are deprecated and in several cases we have better choices anyway.

Add a dedicated class for orientation information.

Merge pull request #14646 from masterleinad/restrict_p4est_tests

Restrict some tests requiring p4est

Merge pull request #14645 from lethe-cfd/add_metis_to_docker_image

Add METIS to Docker image

Add METIS to Docker image

Merge pull request #14643 from Rombur/adolc

Fix issue when adol-c is enabled

Fix issue when adol-c is enabled

Merge pull request #14640 from tamiko/cmake_fix_kokkos_header_installation

CMake: fix kokkos header installation

Merge pull request #14638 from masterleinad/explicit_docker

Be explicit about enabled and disabled dependencies in the Docker image

Merge pull request #14639 from masterleinad/require_trilinos_12_14_1

Fixes https://github.com/dealii/dealii/issues/14637

CMake: fix kokkos header installation

Be explicit about enabled and disabled dependencies in the Docker image

Drop the requirement for Trilinos+Kokkos rom 13.2 to 12.14.1

Merge pull request #14636 from tjhei/jenkins-disable-old

Merge pull request #14635 from tamiko/silence_warning

Merge pull request #14634 from tamiko/fix_configuration

CMake: Do not set errand DEAL_II_TRILINOS_WITH* if Trilinos gets disabled

Jenkins: delete mark job as well, as it is not needed anymore

This is because invidual jobs report there status without having to

be on a node yet.

delete old Jenkins setup

CMake: Silence bogus Boost warning

Silence the following noisy warning:
```
CMake Warning at /usr/share/cmake/Modules/FindBoost.cmake:1384 (message):
  New Boost version may have incorrect or missing dependencies and imported
  targets
Call Stack (most recent call first):
  /usr/share/cmake/Modules/FindBoost.cmake:1507 (_Boost_COMPONENT_DEPENDENCIES)
  /usr/share/cmake/Modules/FindBoost.cmake:2118 (_Boost_MISSING_DEPENDENCIES)
  cmake/modules/FindDEAL_II_BOOST.cmake:57 (find_package)
  cmake/configure/configure_20_boost.cmake:36 (find_package)
  /scratch/users/testsuite/build-3O4p1Svw/CMakeFiles/CMakeTmp/evaluate_expression.tmp:1 (feature_BOOST_find_external)
  cmake/macros/macro_evaluate_expression.cmake:30 (include)
  cmake/macros/macro_configure_feature.cmake:239 (evaluate_expression)
  cmake/configure/configure_20_boost.cmake:170 (configure_feature)
  cmake/macros/macro_verbose_include.cmake:19 (include)
  CMakeLists.txt:130 (verbose_include)
```

CMake: propagate Trilinos configuration into DEAL_II_ namespace

CMake: do not pollute DEAL_II_* namespace while searching for Trilinos

Merge pull request #14629 from jppelteret/trilinos_nox_01

Address minor issues in NOX wrapper

Merge pull request #14631 from masterleinad/fix_trilinos_kokkos

Fix up Trilinos+Kokos detection

Fix up Trilinos+Kokos detection

Merge pull request #14332 from peterrum/nox

Merge pull request #14626 from masterleinad/require_trilinos_kokkos_13_2

Require Trilinos 13.2 if it includes Kokkos

Merge pull request #14627 from bangerth/vtu-99

Get rid of VtuStream class

Apply suggestions

Merge pull request #14630 from tamiko/silence_kokkos_warning

Fix warnings

Run parallel simplex CI on Ubuntu 22.04 for newer Trilinos

Merge pull request #14623 from jppelteret/compiler_fix_01

Fix compiler error for older version of GCC

CMake: Silence a Kokkos warning about unset OMP_PROC_BIND

We now set the OMP_PROC_BIND variable to false to allow free movement of
the two worker threads and silence a KOKKOS warning (which might insist
on this variable to be defined).

Merge pull request #14568 from tjhei/jenkins-mpi-all

[CI]: test all MPI tests

Add a changelog entry.

Fix a doc reference to a function argument.

Update a comment.

Make if and else branches similar, and move code out of the if-else.

Rename variables.

Move the update of a variable out of if-else branches.

Move an if-condition into the body of a loop, rather than repeating the loop.

Push a variable into inner scopes.

Get rid of the VtuStream class.

Also inline the write_high_order_cell() function into write_vtu_main().

This allows getting rid of the vtu_stream object and associated ostringstream object.

Inline the write_high_order_cells() function into write_vtu_main().

Merge pull request #14622 from bangerth/vtu-77

Remove some duplication; also simplify VTK code.

Merge pull request #14625 from bangerth/assertion

Improve documentation.

Merge pull request #14621 from masterleinad/remove_compiler_cuda_aware

Remove DEAL_II_COMPILER_CUDA_AWARE

Merge pull request #14537 from masterleinad/kokkos_la_d_vector_kokkos

Remove a static assert in symmetric tensor

Merge pull request #14624 from bangerth/ref

Move a function to ReferenceCell

Require Trilinos 13.2 if it includes Kokkos

Add NOX wrapper

Merge pull request #14620 from tjhei/jenkins-random

Jenkins: run tests in random order

Move a function into ReferenceCell.

Adjust return types and function argument names.

Improve documentation.

Fix compiler error for older version of GCC

Merge pull request #14596 from tamiko/fix_step_81_doc

step-81: Fix a typo in external links

Merge remote-tracking branch 'upstream/master' into kokkos_la_d_vector_kokkos

Update examples/step-81/doc/results.dox

Co-authored-by: Marc Fehling <mafehling.git@gmail.com>

Remove some duplication; also simplify VTK code.

The VTK tags are already defined in helper functions in class ReferenceCell; get them from
there. While there, the previous version of a helper function was rather hard to read
because of a long list of if-else cases; make it a bit easier to read.

Use subview

Add label for parallel_reduce

Use subview

Jenkins: run tests in random order

Schedule tests in random order to improve load balance over time and therefor improve speed.

Revert changes to boost

Make doxygen happy

Kokkos::Experimental::abs -> Kokkos::Experimental::fabs