Regenerate

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7065 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention boost.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7064 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Test the threading subsystem

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7063 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

threads.cc is auto-generated.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7062 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Merge the new threading scheme.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7060 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7056 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Next round of boost.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7055 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add second part of boost.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7054 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add first part of boost.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7053 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Function::operator=

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7052 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7046 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7045 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Indent prepro statements

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7043 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

# in general, when linking shared libraries, we will want to link with
# the underlying libs as well. AIX even requires this. on the other
# hand, on DEC OSF with CXX this will fail with duplicate symbols, so
# make sure that it doesn't happen on that system and that compiler

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7042 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

don't make memory_consumption inlined.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7041 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7030 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7029 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

reinit functions fixed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7026 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid 'if (a=b)' warning. Cleaning up the functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7025 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add note for Borland C++.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7024 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Give second argument of ::DataOutBase::Patch as well.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7022 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix explicit instantiation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7021 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add an include file that we use.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7020 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove duplicated specialization declarations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7019 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add forgotten std::

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7018 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mini change that makes Borland C++ compile this file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7017 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fixed some "for" loops with bad conditionals

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7016 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

added scaling parameter, which is currently set to 1.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7015 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

base classes renamed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7014 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix and make it compile: PointerMatrix has no clear function. Set pointers to zero manually.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7013 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc fix.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7012 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use this-> to disambiguate.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7008 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix two doc problems.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7007 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix bug: namespaces can end in } without a semicolon. Elements after such a closing brace were spuriously added to that namespace before.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7006 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Filter out classes in namespaces named 'internal' from the class overview, to keep it short.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7005 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make the print_vectors function usable when MG_DEBUG is defined. Implementation of print_vectors for Vector<double>.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7003 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New compute_* functions, that compute and return the renumbering vectors, but do not perform the actual renumbering on the dof_handler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7002 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix Ralf's omission of std::

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7001 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New SolverGMRES::AdditionalData::use_default_residual flag.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@7000 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New use_default_residual flag. Is set true by default. If set false: uses unprec. res. instead of the prec. res. for the left-prec. GMRes and visa versa for the right-prec. GMRes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6999 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix step-14 math.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6998 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix math pointed out by Roy.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6997 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mini change.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6996 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix maths.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6991 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Umpf.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6978 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement scoped locking. Use it throughout the library.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6977 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

The check against multiple simultaneous runs of this function with a
local variable as mutex is of course bogus: this needs to be a
_static_ local variable!

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6976 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Only run recursive $(MAKE) if the cd before it succeeded. This avoid
infinite loops if a subdir does not exist.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6974 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Micro nit-picking

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6973 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Detect Borland C++, which, however, fails blatantly.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6972 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use preprocessor 'defined' instead of relying on the preprocessor doing this automatically.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6971 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

caveat added

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6965 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added comments about the changes in the DoFAccessor classes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6964 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Ug, fix obvious problem.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6963 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Note that deal.II now also works on AIX.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6961 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

On some systems, we need to link liblac.so against libbase.so, and libdeal_II* against both of them (notably, this system is AIX). On other systems, this shouldn't hurt either. For this, we also have to serialize creation of libraries.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6960 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention support for aix with gcc3.2

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6959 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Support detection of CPUs on AIX.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6958 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Introduce an abbreviation. Work around a problem on AIX by a really unnecessary hack, which, however, also doesn't hurt on other systems.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6957 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use right linker for shared libs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6956 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add f77 libs to linker line

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6955 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Enable shared libs on AIX 5.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6954 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6953 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Can use shared libs on AIX 5.1

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6952 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add some missing explicit instantiations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6951 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add some missing explicit instantiations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6950 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

On AIX, the linker is unhappy about some missing symbols. They should be there, but some explicit instantiations don't harm either.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6949 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move definition of static member variables to .cc file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6948 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check for only partly bracketed mutex initializers, and use -Wno-missing-braces if necessary.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6947 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6946 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

mention ibm xlc 6.0

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6945 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Documentation of coefficients alpha and beta

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6944 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Qualify name loopup.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6943 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Likewise at other places.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6942 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Qualify lookup of Vector.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6941 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Things declared inside an anonymous namespace should also be define
inside it, to preserve the internal linkage.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6940 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Initial changes to the hp branch.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6937 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't use get_face. Previous use may have been honorable, but that
function is now gone and we can either add another parameter to the
functions that use this, or leave out the check. Since the functions
that use this are called in only one place, it seems acceptable to
remove the check, although this is arguably not the best way...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6936 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

verbosity reduced

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6935 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

wrong tag for nodata

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6934 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mention Brian's work.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6933 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Get rid of FEValues::get_cell and get_face.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6932 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

no data questions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6931 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new title file without Javascript

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6930 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

files created by make

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6929 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

invert_diagblocks not necessary anymore

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6928 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remark on invert_diagblocks

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6927 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix one problem.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6926 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix pbl. with variable modifiers const and volatile.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6925 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a problem with calling pthread_join on the same threads more than once.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6924 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Regenerate.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6923 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Better detect ecc6.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6922 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Keep to the yes/no output convention.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6921 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

cleanup before filling

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6920 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Detect the version of the IA64 Intel compiler in the same way as that for x86. Use the same code to set the flags.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6919 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6918 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

We had a lot of cruft in our files from an attempt to support IBM xlC 5.0. We never made it really work with this compiler, so this is all dead code. Get rid of it.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6917 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make thread startup rely less on non-POSIX features: we were acquiring a mutex on one thread, and releasing it on another one. While this is documented to work on Linux, it is not necessarily so on other systems, since POSIX does not standardize this behavior. So use a condition variable instead to avoid the problem. While at it, also remove support for ACE.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6916 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make the counter variable volatile in MT mode, by using some template magic.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6915 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix wording.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@6914 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d