FGMRES: deprecate AdditionalData constructor, cleanup doc

Merge pull request #7427 from luca-heltai/write-vtk

Read and Write VTK consistently.

Merge pull request #7447 from masterleinad/overflow_pack_integers

Avoid integer overflow in Utilities::pack_integers

Avoid integer overflow in Utilities::pack_integers

Merge pull request #7446 from Rombur/mf_ladv

Template CUDA MatrixFree on VectorType

Add a test using LA::d::Vector<double, MemorySpace::CUDA>

Template CUDA MatrixFree framework on vector

Allow the CUDA MatrixFree framework to use CUDAWrappers::Vector<Number> and
LinearAlgebra::distributed::Vector<Number, MemorySpace::CUDA>.

Merge pull request #7445 from tjhei/tests_timer_bug

tests: timer_04 and _05 bug

tests: timer_04 and _05 bug

These two tests are sometimes randomly failing. Maybe this fixes it?

Changelog.

Github review.

Test for VTK input/output compatibility check.

New GridIn::read_vtk version.

This version works also for dim == 1, and is more robust w.r.t. the VTK
file format.

New GridOut::write_vtk function.

This version generates a grid that can be read back into deal.II

Merge pull request #7444 from masterleinad/indent_expand_instantiations

Indent expand_instantiations

Indent expand_instantiations

Merge pull request #7404 from bangerth/doc-update

Fix some commentary on iterators.

Further evolve the text to describe iterators.

Merge pull request #7439 from tjhei/dox_scalapack_img

doxygen: fix image scaling for scalapack

Merge pull request #7438 from tjhei/fix_foxy_plate_with_hole_img

fix doxygen GridGenerator plate_with_a_hole imgs

Merge pull request #7434 from masterleinad/deprecate_tecplot_binary

Deprecate Tecplot binary output

doxygen: fix image scaling for scalapack

fix doxygen GridGenerator plate_with_a_hole imgs

fixes #7406
fixes #7437

Merge pull request #7436 from masterleinad/use_strings

Prefer std::string over const char * in public interfaces

Merge pull request #7435 from kronbichler/fix_avx512_feeval_read

Fix read with FEEvaluation and AVX-512 support

Prefer std::string interfaces over const char * for public interfaces

Add changelog

Avoid negative index offsets.

Typo and changelog entry

Deprecate Tecplot binary output

Merge pull request #7432 from masterleinad/derandomize_cuda_device_test

Fix init_cuda

Fix init_cuda

Merge pull request #7431 from masterleinad/derandomize_cuda_device_test

Derandomize CUDA devices used in tests

Derandomize CUDA devices used in test

Merge pull request #7430 from masterleinad/fix_zero_length_cuda_array_view

Fix MemorySpace check for zero sized ArrayViews

Fix MemorySpace check for zero sized ArrayViews

Merge pull request #7411 from drwells/update-truncated-cone

Update GridGenerator::truncated_cone.

Merge pull request #7412 from masterleinad/cuda_array_view

MemorySpace template parameter for ArrayView

Unify is_in_correct_memory_space

Merge pull request #7424 from tamiko/fix_cmake_petsc

CMake: Remove a faulty list manipulation

Merge pull request #7370 from masterleinad/force_cuda_host_compiler

Force CUDA host compiler to be the same as the one used as C++ compiler

CMake: Remove a faulty list manipulation

Use cuda_init() in tests

Changelog entry

Restrict access to ArrayView::operator[] to CPU memory

Test correct memory space

Let ArrayView have a MemorySpace template parameter

Merge pull request #7422 from masterleinad/fix_windows_posix_threads

Only declare PosixThreadBarrier if there is POSIX support

Only declare PosixThreadBarrier if there is POSIX support

Merge pull request #7419 from bangerth/step-20

Rewrite the introduction of step-20.

Rewrite the introduction of step-20.

Merge pull request #7414 from masterleinad/support_gmsh_4

Gmsh' MSH file format version 4

Update CUDA information in the documentation for external libraries

Merge pull request #7398 from masterleinad/cuda_init

Introduce init_cuda in tests.h

Merge pull request #7417 from masterleinad/algorithm_header_subscriptor

Add missing header in subscriptor.cc

Add missing header in subscriptor.cc

Merge pull request #7410 from masterleinad/smart_pointer_check_dangling

Update description of Subscriptor and SmartPointer in the tutorials

Be more conservative with respect to the MSH file format version

Update description of the Subscriptor-SmartPointer pair in the examples

Increase thread-safety of Subscriptor

Merge pull request #7415 from davydden/feature/incremental_fix

set components correctly in IncrementalFunction

set components correctly in IncrementalFunction

Update GridGenerator::truncated_cone.

The 3D grid currently uses 4 coarse level cells on circular slices: this
is poorly conditioned since, when refined, some cells will converge to
triangles. This commit uses the five-square (implemented by
GridGenerator::hyper_ball<2>) to get a much better coarse grid.

Changelog entry

Support Gmsh-4

Fix some commentary on iterators.

Merge pull request #7363 from masterleinad/smart_pointer_check_dangling

Make SmartPointer+Subscriptor check for dangling pointers

Changelog entries

Make SmartPointer+Subscriptor check for dangling pointers

Merge pull request #7396 from davydden/feature/interleave

add Utilities:: pack_integers() to pack an array of ints

Merge pull request #7402 from bangerth/sparsity

Fix (Dynamic)?SparsityPattern::begin() for empty sparsity patterns.

Merge pull request #7337 from marcfehling/cell-domination

Introduced 'compare_for_cell_domination'. Refactored 'compare_for_face_domination'.

Merge pull request #7401 from bangerth/abaqus

Add more run-time checks to the ABAQUS reader.

Merge pull request #7405 from bangerth/doc-update-2

Clarify the documentation of GridGenerator::cylinder().

Merge pull request #7406 from tjhei/doc_plate_with_hole

doxygen: scale plate_with_hole images

doxygen: scale plate_with_hole images

the .pngs are about 1500px wide so the display is quite ugly. 600px is
in line with most of the other images on the page.

Clarify the documentation of GridGenerator::cylinder().

Merge pull request #7375 from davydden/feature/incremental_function

Functions::IncrementalFunction

improve documentation

Co-Authored-By: davydden <davydden@gmail.com>

improve documentation

Co-Authored-By: davydden <davydden@gmail.com>

rename and improve documentation

improve documentation

Co-Authored-By: davydden <davydden@gmail.com>

Remove try-catch blocks in tests.

Merge pull request #7400 from bangerth/fix-widening

Ensure a left-shift operation happens in the right data type.

Merge pull request #7381 from davydden/feature/tmmult_dsp

rework DSP::compute_Tmmult_pattern() with iterators

Add a changelog entry.

Add a few tests.

Fix (Dynamic)?SparsityPattern::begin() for empty sparsity patterns.

Add more run-time checks to the ABAQUS reader.

Coverity complains about the use of the unchecked indices 'elid_start'
and 'elid_end' in the loop after reading them from an untrusted file.
Check at least their basic integrity. While there, also check that
commas are really commas.

Ensure a left-shift operation happens in the right data type.

Fix location AssertCuda

Introduce init_cuda

add mutex lock

improve IncrementalFunction

Merge pull request #7397 from tjhei/document_point_value

document VT:point_value better

improve documentation

Co-Authored-By: davydden <davydden@gmail.com>

document VT:point_value better

add Utilities::interleave() to interleave an array of ints into a single integer

Merge pull request #7394 from koecher/doc-doftools-coupling

enhanced documentation for DoFTools::Coupling::nonzero

enhanced documentation for DoFTools::Coupling::nonzero