Merge pull request #9267 from bangerth/doc-4

Minor updates to the consensus algorithm class documentation.

Minor updates to the consensus algorithm class documentation.

Merge pull request #9261 from simonsticko/typos_doc_fe_interface_values

Fix two typos in documentation of FEInterfaceValues.

Fix two typos in documentation of FEInterfaceValues.

Merge pull request #9255 from bangerth/doc-3

Update documentation of class Partitioner.

Merge pull request #9262 from krishnakumarg1984/step5_krishna_fix1

In Step-5 tutorial, updates name of function being removed (make_grid _and_dofs -> make_grid)

Minor edits to the documentation of CommunicationPatternBase.

Update documentation of class Partitioner.

in step-5, updates another instance of make_grid_and_dofs to make_grid

In Step-5 tutorial, updates name of function being removed (make_grid_and_dofs -> make_grid)

Merge pull request #9257 from bangerth/inst

Simplify dof_tools.inst.in

Merge pull request #9253 from bangerth/test

Adjust precision with which we output results in hp/crash_17.

Merge pull request #9242 from rezarastak/replace_mutex

replace some instances of Threads::Mutex with std::mutex

Merge pull request #9235 from bangerth/doc

Augment the UMFPACK error message.

Simplify the instantiations of DoFTools::get/count_dofs_on_patch().

Merge pull request #9256 from krishnakumarg1984/step4_krishna_fix_3

fixes a redundant paragraph in Step-4 tutorial (since vtk format was already introduced in step-3)

Simplify the instantiations of DoFTools::extract_dofs().

Simplify the instantiations of DoFTools::count_dofs_per_block().

Further simplify instantiations of DoFTools::count_dofs_per_component().

Simplify the instantiations of DoFTools::extract_level_dofs().

Simplify the instantiations of DoFTools::count_dofs_per_component().

fixes a redundant paragraph in Step-4 tutorial (since vtk format was already introduced in step-3)

Merge pull request #9149 from bangerth/18

Fix a mistake in the introduction of step-18.

Merge pull request #9251 from krishnakumarg1984/step4_krishna_fix_2

fixes a typo in step-4 incorrectly quoting the tutorial wherein the ZeroFunction as first introduced

Merge pull request #9248 from bangerth/possibilities

Mark 'Possibilities for extensions' as <h3>.

Adjust precision with which we output results in hp/crash_17.

Merge pull request #9073 from luca-heltai/particle-generators-dofs

Generate particles on support or quadrature points on other grid

add mailmap entry

fixes a typo incorrectly quoting a section wherein the ZeroFunction was first introduced

Merge pull request #9206 from bangerth/tasks

Provide TaskGroup::size().

Merge pull request #9247 from bangerth/fix

Fix description of a test.

Mark 'Possibilities for extensions' as <h3>.

Otherwise, our scripts don't pick these headings up and it won't show
in the table of contents.

Fix description of a test.

Merge pull request #9245 from bangerth/readme

Document out of memory issues with 'make -jN'.

Document out of memory issues with 'make -jN'.

Merge pull request #9244 from tjhei/jenkins-osx-increase-timeout

jenkins: increase OSX timeout

jenkins: increase OSX timeout

It turns out that builds take longer after updating the machine to a
newer xcode and we regularly encounter a timeout.

Augment the UMFPACK error message.

Generate particles on support or quadrature points on other grid

Functions that generates particles at the location of the support points of a
possibly non-matching grid or at the quadrature points of a possibly non-matching grid

The total number of particles that is added to the particle_handler
object is the number of dofs of the DoFHandler that is passed that are
within the triangulation and whose components are within the
ComponentMask.

Co-authored-by: Bruno Blais <blais.bruno@gmail.com>
Co-authored-by: Luca Heltai <luca.heltai@sissa.it>

Merge pull request #9238 from bangerth/ia64

Remove reference to the IA64 architecture.

Merge pull request #9239 from tjhei/config_h_p4est_old

config.h: remove old p4est version logic

Merge pull request #9241 from bangerth/doftools

Mark some input arguments as 'const'.

replace some instances of Threads::Mutex with std::mutex

Add a changelog entry.

Fix a mistake in the introduction of step-18.

The description of the problem is due to Ming Yang <ykevin09@gmail.com>.

Mark some input arguments as 'const'.

This requires to also make a 'std::vector' argument a reference. Incidentally,
this also matches our usual style.

config.h: remove old p4est version logic

Remove reference to the IA64 architecture.

IA64 was an interesting historical experiment that I enjoyed working on
and even more thinking about. But the architecture has not been updated
since 2012, and so there is no real danger in removing a piece of
code related to it from actually breaking anything for anyone.

Add a changelog entry.

Add a test.

Provide TaskGroup::size().

Merge pull request #9204 from rezarastak/mu_parser_random

mu_parser functions modified to use std random number generators

Merge pull request #9236 from bangerth/doc-2

Augment the documentation of GridGenerator::simplex().

Augment the documentation of GridGenerator::simplex().

Merge pull request #9234 from tjhei/doc_grid_gen_simplex

doc: minor GridGenerator changes

doc: minor GridGenerator changes

Merge pull request #9229 from masterleinad/return_correct_indentation_error_code

Return error code from indent-all in check_indentation.sh

Return error code from indent-all in check_indentation.sh

tests updated to be independent of RNG details

Merge pull request #9233 from masterleinad/remove_cryptic_comment

Remove cryptic comment

Remove cryptic comment

Merge pull request #9106 from peterrum/pft_without_p4est

Make pft independent of p4est

Merge pull request #9230 from kronbichler/fix_mf_code

Fix two bugs in matrix-free code

Make pft tests independent of p4est

Merge pull request #9219 from tjhei/output_table_deprecate

deprecate members in TimerOutput

Fix two bugs in matrix-free code

Merge pull request #9224 from peterrum/dofhandlerpolicy_p4estfree_macros

Replace some DEAL_II_WITH_P4EST with DEAL_II_WITH_MPI

Replace some DEAL_II_WITH_P4EST with DEAL_II_WITH_MPI

Merge pull request #9223 from peterrum/ecl-mapping-fix

Bug fix in PR #9155

Merge pull request #9225 from tjhei/doxygen_fix_citation

fix a doxygen citation

Merge pull request #9190 from bangerth/doc

Annotate a few function arguments in doxygen.

fix a doxygen citation

might be related to #9222

Fix check of neigboring cells

Merge pull request #9218 from peterrum/get_projection_matrix_for_float

Instantiate FETools::get_projection_matrix for float

Merge pull request #9215 from peterrum/dofhandlerpolicy_p4estfree

Make DoFHandlerPolicy independent of p4est

Merge pull request #9155 from peterrum/ecl-mapping

ECL: make mapping of neighbor available

Use CellId::binary_type for communication

Fix labels

Fix serial compilation

Make internal::DoFHandlerImplementation::Policy::ParallelDistributed independent from p4est

Merge pull request #9214 from peterrum/cellid_ancestorof

Add CellId::is_ancestor_of

deprecate members in TimerOutput

It looks like these identical functions have been around for a long
time. While I prefer enter/exit_section(), we use the others in most
places.

Merge pull request #9217 from peterrum/fix_date

Fix date in header

Instantiate FETools::get_projection_matrix for float

Fix date in header

Add CellId::is_ancestor_of

Merge pull request #9211 from bangerth/instantiate

Instantiate DoFTools::map_dofs_to_support_points() also for <1,3>.

Merge pull request #9209 from drwells/fix-using-namespace-links

Keep the 'dealii::' in 'using namespace dealii::'.

Merge pull request #9208 from drwells/fix-tbb-version-check

Fix our TBB version check.

Instantiate DoFTools::map_dofs_to_support_points() also for <1,3>.

Merge pull request #9205 from bangerth/fix

Use a range-based for loop.

Fix our TBB version check.

Since the regular expression we used was eager it matched the 202 in 2020,
yielding a version number of 0.0. Note that this worked with older versions of
TBB since we would get, e.g., version 8.0 instead of version 2018.0.

Keep the 'dealii::' in 'using namespace dealii::'.

Some of our example code on the website (e.g., step-40) doesn't work since we
get rid of the preceding dealii and print

    using namespace ::LinearAlgebraPETSc;

when it should be

    using namespace dealii::LinearAlgebraPETSc;

instead. This change keeps the 'dealii::' only in this case, which currently
only occurs in step-40.cc, step-50.cc, step-55.cc, and local_integrators.h.

Annotate a few function arguments in doxygen.

Plus minor other fixes.

Use a range-based for loop.

Merge pull request #9200 from bangerth/fix-1

Fix what looks like an obvious typo in the UMFPACK source files.

Merge pull request #9201 from bangerth/fix-3

Minor doc updates.

Merge pull request #9203 from bangerth/fix-2

Simplify the code in a test a bit.

Merge pull request #9202 from bangerth/fix-4

Mark a bunch of input arguments as 'const'.

mu_parser functions modified to use std random number generators