Integrate hessians on cells

Merge pull request #12632 from peterrum/step-47

Step-47: unify code

Merge pull request #12593 from bergbauer/evaluate_and_integrate_hessians

Evaluate and integrate hessians

Step-47: unify code

Evaluate and integrate hessians on faces

Merge pull request #12631 from peterrum/feeval_doc

Small modifications of FEEvaluation documentation

Small modifications of FEEvaluation documentation

Merge pull request #12630 from jppelteret/fe_values_functions_01

Add face and cell queries to FEFaceValuesBase and FEInterfaceValues

Merge pull request #12614 from marcfehling/hp-indexset

Standardized output for many `mpi/hp_unify_dof_indices_X` tests.

Merge pull request #12615 from peterrum/rpe_test

Extend test

Merge pull request #12616 from peterrum/ConstraintTypes

Switch from unsigned int to ConstraintTypes

Merge pull request #12627 from masterleinad/update_cuda_output

Update test output for CUDA

Add a changelog entry

Update a test

Add FEInterfaceValues::get_cell() and FEInterfaceValues::get_face_number()

Add FEFaceValuesBase::get_face_number()

Merge pull request #12628 from jppelteret/fe_interface_values_03

Add dof_indices() to FEInterfaceValues

Merge pull request #12629 from peterrum/signals_residual_step_fix

Fix signal residual_step

Fix signal residual_step

Add dof_indices() to FEInterfaceValues

Update test putput for CUDA

Merge pull request #12411 from jppelteret/fe_interface_values_02

FEInterfaceValues: Make class interfaces consistent with FEValues and its views

Merge pull request #12623 from marcfehling/identity-constraints

Added diagnostic functions for `AffineConstraints`.

Merge pull request #12618 from peterrum/TriangulationDescription_examples

Extend documentation of TriangulationDescription

Added tests for AffineConstraints diagnostics.

Added diagnostic functions for AffineConstraints.

Add a changelog entry

Update tests

Update examples

Extend documention of TriangulationDescription

Continue

Work on GPU

Rename

Introduce enum class

Merge pull request #12610 from drwells/add-more-wv-rules

Add more Witherden-Vincent rules

Merge pull request #12619 from drwells/fix-parenthesis

Fix a parenthesis.

Fix a parenthesis.

I see a bunch of warnings of the form

/Users/runner/work/dealii/dealii/include/deal.II/matrix_free/tools.h:497:35:
error: taking the absolute value of unsigned type 'bool' has no effect [-Werror,-Wabsolute-value]
854
                                  std::abs(values_dofs[j][0] &&

on the CI tester.

Add a lot more Witherden-Vincent rules.

This includes most of the even-degree rules.

For posterity: here's the script I used to print quadpy rules rather than
copying numbers individually:

import quadpy as qp

def format_16(x):
    return '{:.16e}'.format(float(x))

def print_scheme(scheme):
    sym_data = scheme.symmetry_data
    print("// WV-{}, {}D".format(scheme.degree, scheme.dim))
    for key in sym_data.keys():
        if key == 'centroid' or key == 's4':
            print("b_point_permutations.push_back({centroid});")
            print("b_weights.push_back({});".format(format_16(sym_data[key][0][0])))
        elif key == 'd3_aa' or key == 's31':
            weights = [format_16(w) for w in sym_data[key][0]]
            points = [format_16(p) for p in sym_data[key][1]]
            assert len(weights) == len(points)
            for i in range(len(weights)):
                print("process_point_1({}, {});".format(points[i], weights[i]))
        elif key == 'd3_ab' or key == 's211':
            weights = [format_16(w) for w in sym_data[key][0]]
            points1 = [format_16(p) for p in sym_data[key][1]]
            points2 = [format_16(p) for p in sym_data[key][2]]
            assert len(weights) == len(points1)
            assert len(points2) == len(points1)
            for i in range(len(weights)):
                print(("process_point_3({},"
                       "\n                {},"
                       "\n                {});")
                      .format(points1[i], points2[i], weights[i]))
        elif key == 's22':
            assert scheme.dim == 3
            weights = [format_16(w) for w in sym_data[key][0]]
            points = [format_16(p) for p in sym_data[key][1]]
            assert len(weights) == len(points)
            for i in range(len(weights)):
                print(("process_point_2({},"
                       "\n                {});")
                      .format(points[i], weights[i]))
        else:
            assert False

Merge pull request #12613 from drwells/fix-structdim-comments

Fix two comments in TriaAccessor.

Merge pull request #12559 from tamiko/modernize_step_69

Step-69: Use SolutionTransfer instead of low-level boost archive

Step-69: Apply review suggestion

Step-69: Use SolutionTransfer instead of low-level boost archive

Swith from unsigned int to ConstraintTypes

Extend test

Standardized output for many mpi/hp_unify_dof_indices_X tests.

Added new test for parallel-hp-paper.

Merge pull request #12560 from peterrum/mf_hn

Optimize hanging-node constraints in MatrixFree

Merge pull request #12611 from drwells/boundary-to-manifold

Convert some (mislabeled) boundary ids to manifold ids.

Fix two comments in TriaAccessor.

We have a 'cell' when the structural dimension matches the topological
dimension.

Merge pull request #12607 from bangerth/type

Fix a few type mistakes in AlignedVector.

Convert some (mislabeled) boundary ids to manifold ids.

Use a switch statement.

Less indentation makes this easier to read.

Remove an extra namespace qualification.

This isn't necessary now that we moved Simplex::QGauss to QGaussSimplex.

Fix a few type mistakes in AlignedVector.

Merge pull request #12556 from bangerth/units

Merge pull request #12605 from tjhei/doc_typo_rtree

doc: fix typo in rtree.h

Generalize HangingNodes

Try a different syntax.

doc: fix typo

Merge pull request #12602 from peterrum/rpe_unique_fix

Fix tolerances in GridTools::internal::distributed_compute_point_locations()

Fix tolerances in GridTools::internal::distributed_compute_point_locations()

Merge pull request #11108 from masterleinad/clang-tidy-11

Apply clang-format

Delete indent step in CI

add Darwin Intel binaries

Attempt to suppress clang-tidy warning

add Darwin Intel binaries

update clang-format download script to version 11

Update infrastructure some more

update clang-format infrastructure to version 11

Require the correct version in contrib/utilities/indent_common.sh

Update to clang-tidy-11

Merge pull request #12600 from peterrum/convert_map_pattern

Fix Convert for map

Merge pull request #12578 from agrayver/python_mapping_rename

Rename MappingQGeneric to MappingQ in python interface

Merge pull request #12599 from peterrum/find_active_cell_around_point_end

Let find_active_cell_around_point() return mesh.end() if point is not found in BBs

Rename MappingQGeneric to MappingQ in python

Merge pull request #12598 from peterrum/project_docu

Fix documentation of VT::project()

Fix Convert for map

Let find_active_cell_around_point() return mesh.end() if point is not found in BBs

Fix documentation of VT::project()

Merge pull request #12595 from bangerth/doc

Update documentation in a couple of places.

Update documentation in a couple of places.

Merge pull request #12588 from zjiaqi2018/table_clear

Add clear() to the Table class

Merge pull request #12592 from peterrum/compute_diagonal_util_tolerance_float

Reduce tolerance in test

Merge pull request #12591 from marcfehling/intel18

Intel 18 does not like assertions in nested lambdas.

Reduce tolerance in test

Intel18 does not like assertions in nested lambdas.

Merge pull request #12554 from marcfehling/ci-oneapi

Add Intel oneAPI to github-actions.

Merge pull request #12590 from Rombur/fix_warnings

Fix unused-but-set-variable warnings

Merge pull request #12589 from bangerth/include

Add a missing include file.

minor fix and changelog

Add a missing include file.

Fix unused-but-set-variable warnings

add table.clear()

Merge pull request #12585 from peterrum/compute_diagonal_ref

Add new compute_diagonal() test

Add new compute_diagonal() test

Merge pull request #12577 from peterrum/hn_generalize

Generalize HangingNodes

Generalize HangingNodes

Merge pull request #12583 from drwells/mapping-fe-field-face-simplices

Mapping fe field face simplices

Merge pull request #12582 from peterrum/ConstraintTypes_enum

Make internal::MatrixFreeFunctions::ConstraintTypes enum

Add a test for both features.