Update ginkgo html docs, clang-format.

Add all solvers supported by Ginkgo. Format with clang-format. Update docs.

Hide creation of ginkgo executor from the user.

Add preconditioner support.

Merge pull request #7960 from bangerth/fix-18

Fix a mistaken assertion that only succeeds by accident.

Merge pull request #7959 from kronbichler/doc_rotation_matrix_2d

Documentation fix Physics::Transformations::Rotations::rotation_matrix_2d

Merge pull request #7918 from luca-heltai/lambda-function

FunctionFromFunctionObjects class: wraps a vector of std::function objects into a Function object

Merge pull request #7932 from luca-heltai/dirac-delta-cutoff

Enrich CutOffFunctionBase, and provide also CutOffFunctionC1

Fix a mistaken assertion that only succeeds by accident.

Specifically, it succeeds because we get a pointer to the first of a block of
elements where the size of the block is greater than one. If one had a 1-point
quadrature formula, the assertion would fail.

Documentation fix in Physics::Transformations::Rotations::rotation_matrix_2d

Merge pull request #7956 from tjhei/step-40-cmake-complex

step-40 disable logic with complex PETSc

Merge pull request #7955 from Rombur/cuda_size

Reduce chunk_size used in CUDA kernels from 8 to 1

Merge pull request #7944 from jppelteret/sd-tensor_operations_02

SD tensor operations: Add functions to perform symbolic tensor differentation

Added static_assert.

step-40 disable logic with complex PETSc

Having PETSC_WITH_COMPLEX would stop step-40 from being able to
configure/build. Now we fall back to trilinos as described in the error
message.

part of #7946

Merge pull request #7953 from bangerth/61-3

Break long lines in step-61/doc/results.dox.

Break long lines in step-61/doc/results.dox.

Merge pull request #7950 from bangerth/61

Avoid latex formulas in section headings.

Merge pull request #7951 from bangerth/grammar

Fix a grammar mistake in a comment.

Fix a grammar mistake in a comment.

Avoid latex formulas in section headings.

Merge pull request #7948 from masterleinad/fix_symengine_test

Fix SymEngine test

Merge pull request #7949 from rezarastak/patch-1

Documentation fix for DerivativeForm

Merge pull request #7947 from luca-heltai/fix-spelling

Fix documentation of extend + spelling.

Documentation fix for DerivativeForm

Reduce chunk_size used in CUDA kernels from 8 to 1

Add two changelog entries

Add a test for SD tensor differentiation

AD: Add test for 4 component scalar function

Add functions to perform SD tensor differentation

Alter the wording describing the input parameter and output of a function

Fix SymEngine test

Merge pull request #7926 from tamiko/fix_dynamic_sparsity_pattern_exists

SparsityPattern: Fix copy_from a DynamicSparsityPattern

FunctionFromFunctionObjects.

Merge pull request #7931 from jppelteret/sd-tensor_operations_01

SD tensor operations: Symbol and symbolic function creation

Added implementation of CutOffFunctionC1

Added FunctionCutOffTensorProduct.

Deprecate new_* in favour of set_*

Modify FunctionCutOff to support integration to one.

Improved documentation.

Fix documentation of extend + spelling.

improve error message

avoid a segmentation fault

add a test

SparsityPattern: Fix copy from DynamicSparsityPattern

Merge pull request #7936 from BenBrands/instantiations_shared_triangulation

add explicit instantiations for shared::Triangulation

Merge pull request #7945 from bangerth/doc-2

Clarify a piece of documentation.

Merge pull request #7942 from bangerth/doc

Mark two function references better.

Clarify a piece of documentation.

Mark two function references better.

Merge pull request #7920 from jppelteret/sd-scalar_operations_01

SD scalar operations: Symbol and symbolic function creation

Add test for operations using symbolic and expressional tensors

Add a test to check std::copy and std::swap with vector of Expressions

Add some SD-related convenience functions for tensor operations.

Specifically, these can be used to create a tensor symbol and symbolic
function.

Specialize some functions in the numbers namespace for SD::Expression.

Also required for support of SD::Expression within the Tensor and
SymmetricTensor classes.

Add ProductType for SD::Expression class.

This is the first step towards support of SD::Expression within the
Tensor and SymmetricTensor classes.

Add template arguments for symmetric tensor ranks

Add some SD-related convenience functions for scalar operations.

Specifically, a non-member function for scalar differentiation of an
Expression has been added.

Add some SD-related convenience functions for scalar operations.

Specifically, these can be used to create a scalar symbol and symbolic
function.

Add some SD-related utility functions

Merge pull request #7938 from isuruf/cmake

CMake: Clear CMAKE_REQUIRED_FLAGS before calling FindLAPACK

Merge pull request #7935 from masterleinad/fix_boost_1_70

Fix configuring with external Boost-1.70.0

CMake: Clear CMAKE_REQUIRED_FLAGS before calling FindLAPACK

CMAKE_REQUIRED_FLAGS is populated by dealii with CXXFLAGS and this
should be cleared before calling any function that calls try_compile
on a C file. FindLAPACK calls FindTHREADS.cmake which uses try_compile
on a C file.

add explicit instantiations for shared::Triangulation

Add links

Fix configuring with external Boost-1.70.0

Merge pull request #7914 from luca-heltai/enlarge-bounding-box

BoundingBox::extend()

Merge pull request #7915 from luca-heltai/rtree-with-mapped-vertices

Make sure rtree works with mappings that do not preserve vertices.

Merge pull request #7927 from Rombur/cuda_fix

Cuda: small fixes

Merge pull request #7923 from bangerth/61

Enclose everything in step-61 into its own namespace.

Merge pull request #7925 from masterleinad/avoid_fpe

Fix symengine_number_type_01 in Release mode

Add missing instantiations

Remove unused variables

Fix symengine_number_type_01 in Release mode

Merge pull request #7924 from bangerth/61-2

Update requirements for step-61.

Update requirements for step-61.

Enclose everything in step-61 into its own namespace.

Merge pull request #7917 from masterleinad/avoid_fpe

Avoid floating point exception in symengine_number_type_01

Merge pull request #7919 from drwells/add-missing-ingroup-functions

Add missing '@ingroup functions' annotations.

Add missing '@ingroup functions' annotations.

Merge pull request #7876 from jppelteret/sd-expression-math

SD: Logical operators + math operations for expression class

Avoid floating point exception in symengine_number_type_01

Merge pull request #7916 from tjhei/tidy_debug_only

clang-tidy: only debug mode

Enlarge BoundingBox

clang-tidy: only debug mode

I don't think it makes sense to also compile in release mode for the
tidy checks. This change should speed up the CI tester as well.

Merge pull request #7901 from masterleinad/smart_pointer_std_string

Use std::string in SmartPointer and Subscriptor interface

Make sure rtree works with mappings that do not preserve vertices.

Merge pull request #7910 from masterleinad/replace_std_make_unique

Replace std::make_unique by std_cxx14::make_unique

Use references and clean up a bit

Replace empty string comparison

Use std::string in SmartPointer and Subscriptor interface

Replace std::make_unique by std_cxx14::make_unique

Merge pull request #7806 from luca-heltai/scratch_and_copy

"Reasonable" ScratchData and CopyData

defgroup -> name

Comments.

Merge pull request #7906 from rezarastak/filtered_iterator_doc_fix

Fixed documentation error in filtered_iterator.h

Fixed documentation error in filtered_iterator.h

ChangeLog

ScratchData + Sacado FD+RD applied to energies

Merge pull request #7898 from tjhei/ci_quicktests

[CI]: catch failures and run quicktests