revision of projection_active_set ()

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24652 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix bug with empty table.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24650 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Changing output_result

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24649 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add to a documentation text based on a question just received.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24648 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

make step-41 work

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24647 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix step-41 when using mpi

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24645 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Using Trilinos vectors and sparse-matrices

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24644 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

undo r24637

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24643 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Using Trilinos vectors and sparse-matrices

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24642 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Switch off auto fill mode before computing convergence rates.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24639 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Active-Set-method works with constraints

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24637 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make serialization work again.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24633 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make the behavior of the previous patch optional to keep the ConvergenceTable function happy.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24632 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Pay attention to the flags set for the stream.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24631 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fill partially filled columns with padding.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24625 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move a template function to the .h file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24624 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Print "" in empty entries of a table.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24623 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check in forgotten file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24622 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24621 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Allow serialization of the TableHandler class.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24620 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reindent.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24619 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reindent a line.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24618 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix configuring with Trilinos on Debian.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24617 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change the inner workings of the TableHandler and derived ConvergenceTable class.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24616 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24613 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a couple sentences to the documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24612 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Convince myself that the FE_DGQArbitraryNodes does what it suggests.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24611 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add the necessary glue.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24607 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix makefile and edit svn:ignores

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24606 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

first version of step-41, does not compile yet

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24605 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

reserve step-41

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24604 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

udpate test and make it pass

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24603 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix bug in Triangulation::load() and improve documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24602 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update svn:ignore

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24601 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new test for Triangulation::load()/save() that fails

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24600 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix search in html doxygen documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24599 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Indent.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24598 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24597 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add tests for distributed::Triangulation::load()/save()

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24596 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New: parallel::distributed::Triangulation::save()/load() to store
the refinement information to disk. Also supports saving solution vectors
using the SolutionTransfer class.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24595 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Only allow using p4est if we also have MPI.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24594 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

First patch post 7.1.0: Make DataOut_DoFData::merge_patches compile with new enough gcc versions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24593 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Undo accidental changes on step-1, step-6 and step-34

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24592 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Removed unfinished step-41

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24591 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix formatting problem.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24587 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't use PETSC and TRILINOS.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24586 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix misspelling.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24583 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

List compilers.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24580 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

A better description (and correct syntax).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24576 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change version number in the output files.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24573 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Commit forgotten change.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24570 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Re-establish link to file of changes after 7.1.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24567 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust version number to 7.2.pre.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24565 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Go through points 1&2 of the release task list.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24563 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Get it right this time.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24562 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Silence a warning in icc and provide a default path for switches over
'dim'.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24561 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make code better readable.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24560 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use numbers::invalid_unsigned_int instead of -1 to indicate invalid
default arguments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24559 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

support clang as CC compiler

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24558 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Suppress output from all but processor 0.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24557 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Only produce output from the head node.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24556 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make compile.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24555 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid warnings with ICC.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24554 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid warnings with ICC.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24553 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Omit a pointless const qualifier and thereby avoid a warning by Intel's icc.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24552 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Whoops, yet another latex problem.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24551 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More latex fixes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24550 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More latex fixes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24549 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix latex markup.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24548 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

List step-32.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24547 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

List step-32.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24546 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use the table layout that was in fact originally intended. Minor rewording.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24545 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix grammar fail.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24544 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Finalize.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24543 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bump time only at the very end of the time step. This makes sure that the timer output appears only *after* each 100th time step, not before.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24542 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set parameters for 2d simulations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24541 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Default to graphical output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24540 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add 3d results. Add another point to the suggestions for future enhancements.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24539 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Default to 2d for speed's sake.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24538 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Blacklist 10.8.[01].

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24537 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24536 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

mention bugs in Trilinos 10.8.0 and 10.8.1

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24535 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

small clarification in workstream description in multithreading module

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24533 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix an actual bug: we were taking a completely meaningless temperature
field to evaluate the density in computing the rhs of the temperature
equation. Use the correctly extrapolated field.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24532 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename a variable to avoid some potential for confusion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24531 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clean up code somewhat.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24530 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clean up code somewhat.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24529 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Switch back to the same matrix terms in the Stokes preconditioner we
have been using in step-31. The formula yields the same terms up to
roundoff anyway.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24528 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Finish going through the documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24526 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Document down to the output_results section.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24525 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add another point.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24524 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Link to the publication we're writing.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24523 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a link to step-32.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24522 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add missing argument to implementation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24521 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

eliminate interior boundaries

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24520 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use the new IteratorFilters::LocallyOwnedCell predicate and document using it.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24519 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New class IteratorFilters::LocallyOwnedCell.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24518 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Finish going over the setup functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24517 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bring most of the results section up to date.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24516 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Slight updates.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24515 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d