Merge pull request #7976 from masterleinad/export_petsc_with_complex

Export DEAL_II_PETSC_WITH_COMPLEX variable

Merge pull request #7977 from masterleinad/improve_docu_read_write

Improve doxygen documentation for ReadWriteVector

Merge pull request #7968 from masterleinad/empty_ranges_cuda_mf_internal_reinit

Deal with empty ranges in CUDAWrappers::MatrixFree::internal_reinit

Improve doxygen documentation For ReadWriteVector

Export DEAL_II_PETSC_WITH_COMPLEX variable

Merge pull request #7961 from jppelteret/sd-map_utilities_01

SD scalar operations: Addition to substitution maps and map merging

Merge pull request #7975 from drwells/improve-parallel-build-doc

Improve the documentation of parallel builds.

Improve the documentation of parallel builds.

Not all users are familiar with the -j or --jobs flags for make and the
current explanation is buried in the middle of several other notes. We
can make this simpler by showing how to parallelize the build
explicitly.

Add test for merging of SD substitution maps

Add test for addition of scalar types to SD substitution maps

Implement function to merge substitution maps

Add functions to create SD subsitution maps from scalar types

Merge pull request #7969 from masterleinad/use_integers_cuda_memset

Use integers in cudaMemset

Merge pull request #7972 from dangars/n_locally_owned_active_cells_step-18

Use the function n_locally_owned_active_cells() in step-18

Merge pull request #7952 from bangerth/61-2

Remove pictures from the repository.

Merge pull request #7958 from bangerth/doc

Augment documentation in class IteratorRange.

Use the function n_locally_owned_active_cells()

Merge pull request #7957 from rezarastak/DerivativeForm_doc_improvement

Mathematical notation of DerivativeForm

Merge pull request #7964 from dangars/destructor-step-40

Remove destructor in step40

Merge pull request #7965 from dangars/vector_swap

Exchange vectors of std::vector::swap() in step-18

Add test

Use integers in cudaMemset

Address row_start

Deal with empty ranges in CUDAWrappers::MatrixFree::internal_reinit

Exchange vectors in std::vector::swap()

Remove destructor

small documentation fix: replaced (*this) with the matrix A

Merge pull request #7962 from rezarastak/generic_la_documentation

Adding documentation for generic LA namespaces

Merge pull request #7960 from bangerth/fix-18

Fix a mistaken assertion that only succeeds by accident.

small fix

Documentation added so that the using statements are properly shown in the manual

Merge pull request #7959 from kronbichler/doc_rotation_matrix_2d

Documentation fix Physics::Transformations::Rotations::rotation_matrix_2d

Merge pull request #7918 from luca-heltai/lambda-function

FunctionFromFunctionObjects class: wraps a vector of std::function objects into a Function object

asterisk removed from notation in DerivativeForm

Merge pull request #7932 from luca-heltai/dirac-delta-cutoff

Enrich CutOffFunctionBase, and provide also CutOffFunctionC1

Fix a mistaken assertion that only succeeds by accident.

Specifically, it succeeds because we get a pointer to the first of a block of
elements where the size of the block is greater than one. If one had a 1-point
quadrature formula, the assertion would fail.

Documentation fix in Physics::Transformations::Rotations::rotation_matrix_2d

Augment documentation in class IteratorRange.

Apply suggestions from code review

Co-Authored-By: rezarastak <rezarastak@users.noreply.github.com>

Merge pull request #7956 from tjhei/step-40-cmake-complex

step-40 disable logic with complex PETSc

Merge pull request #7955 from Rombur/cuda_size

Reduce chunk_size used in CUDA kernels from 8 to 1

Merge pull request #7944 from jppelteret/sd-tensor_operations_02

SD tensor operations: Add functions to perform symbolic tensor differentation

Added static_assert.

Mathematical explanation for the functions within DerivativeForm is improved

step-40 disable logic with complex PETSc

Having PETSC_WITH_COMPLEX would stop step-40 from being able to
configure/build. Now we fall back to trilinos as described in the error
message.

part of #7946

Merge pull request #7953 from bangerth/61-3

Break long lines in step-61/doc/results.dox.

Break long lines in step-61/doc/results.dox.

Merge pull request #7950 from bangerth/61

Avoid latex formulas in section headings.

Merge pull request #7951 from bangerth/grammar

Fix a grammar mistake in a comment.

Remove pictures from the repository.

Instead, they are now stored in the repo of the website, where they
are also referenced in the program's documentation itself. In
other words, they are no longer necessary in the deal.II git repo
itself.

Fix a grammar mistake in a comment.

Avoid latex formulas in section headings.

Merge pull request #7948 from masterleinad/fix_symengine_test

Fix SymEngine test

Merge pull request #7949 from rezarastak/patch-1

Documentation fix for DerivativeForm

Merge pull request #7947 from luca-heltai/fix-spelling

Fix documentation of extend + spelling.

Documentation fix for DerivativeForm

Reduce chunk_size used in CUDA kernels from 8 to 1

Add two changelog entries

Add a test for SD tensor differentiation

AD: Add test for 4 component scalar function

Add functions to perform SD tensor differentation

Alter the wording describing the input parameter and output of a function

Fix SymEngine test

Merge pull request #7926 from tamiko/fix_dynamic_sparsity_pattern_exists

SparsityPattern: Fix copy_from a DynamicSparsityPattern

FunctionFromFunctionObjects.

Merge pull request #7931 from jppelteret/sd-tensor_operations_01

SD tensor operations: Symbol and symbolic function creation

Added implementation of CutOffFunctionC1

Added FunctionCutOffTensorProduct.

Deprecate new_* in favour of set_*

Modify FunctionCutOff to support integration to one.

Improved documentation.

Fix documentation of extend + spelling.

improve error message

avoid a segmentation fault

add a test

SparsityPattern: Fix copy from DynamicSparsityPattern

Merge pull request #7936 from BenBrands/instantiations_shared_triangulation

add explicit instantiations for shared::Triangulation

Merge pull request #7945 from bangerth/doc-2

Clarify a piece of documentation.

Merge pull request #7942 from bangerth/doc

Mark two function references better.

Clarify a piece of documentation.

Mark two function references better.

Merge pull request #7920 from jppelteret/sd-scalar_operations_01

SD scalar operations: Symbol and symbolic function creation

Add test for operations using symbolic and expressional tensors

Add a test to check std::copy and std::swap with vector of Expressions

Add some SD-related convenience functions for tensor operations.

Specifically, these can be used to create a tensor symbol and symbolic
function.

Specialize some functions in the numbers namespace for SD::Expression.

Also required for support of SD::Expression within the Tensor and
SymmetricTensor classes.

Add ProductType for SD::Expression class.

This is the first step towards support of SD::Expression within the
Tensor and SymmetricTensor classes.

Add template arguments for symmetric tensor ranks

Add some SD-related convenience functions for scalar operations.

Specifically, a non-member function for scalar differentiation of an
Expression has been added.

Add some SD-related convenience functions for scalar operations.

Specifically, these can be used to create a scalar symbol and symbolic
function.

Add some SD-related utility functions

Merge pull request #7938 from isuruf/cmake

CMake: Clear CMAKE_REQUIRED_FLAGS before calling FindLAPACK

Merge pull request #7935 from masterleinad/fix_boost_1_70

Fix configuring with external Boost-1.70.0

CMake: Clear CMAKE_REQUIRED_FLAGS before calling FindLAPACK

CMAKE_REQUIRED_FLAGS is populated by dealii with CXXFLAGS and this
should be cleared before calling any function that calls try_compile
on a C file. FindLAPACK calls FindTHREADS.cmake which uses try_compile
on a C file.

add explicit instantiations for shared::Triangulation

Add links

Fix configuring with external Boost-1.70.0

Merge pull request #7914 from luca-heltai/enlarge-bounding-box

BoundingBox::extend()

Merge pull request #7915 from luca-heltai/rtree-with-mapped-vertices

Make sure rtree works with mappings that do not preserve vertices.

Merge pull request #7927 from Rombur/cuda_fix

Cuda: small fixes