Use a more robust version of denoting the null pointer in this context.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23894 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Be more careful accessing the data array of a Table object if said Table
object is empty. Also add an assertion in one other place.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23893 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Compare iterators from the same container.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23892 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix another such place.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23891 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't compute stuff we never use. In particular, don't create variables then
access beyond their end.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23890 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Compute the size of a std::vector without dereferencing the end iterator.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23889 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Only define preprocessor symbol if not already defined.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23888 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Verify that the output that changed with yesterday's fix is correct.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23887 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Replace two naked 'throw ExcInternalError()' by the corresponding AssertThrow so that we get location information printed in the output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23886 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use proper syntax in compile test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23885 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Work around an awkward problem: when using mappings of degree 4, we have enough roundoff accumulating that we get into trouble with constraints that are cyclic. Fix this by introducing a normalization step in the computation of normal vectors when sorting out normal fluxes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23884 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Detect common problem with Sacado_cmath.hpp and link to a solution.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23883 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update one.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23882 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Better doxygen markup.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23881 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a note to a comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23880 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Only the 3d case is affected.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23879 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reduce test to the minimum.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23878 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Auto-detect the Trilinos sub-libs we need to link with and their order.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23877 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove obsolete keyword

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23876 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Header

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23875 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Augment documentation. Add a guarantee about the first shape function that is also tested in the new fe/dgp_01 testcase.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23874 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23873 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Work around compiler warnings in boost library.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23872 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix memory consumption of std::vector<T> with more than 4G.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23871 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo in documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23870 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Omit unused variables.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23869 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Test ConstraintMatrix::merge() for constraint matrices localized by an IndexSet (same IndexSet on both CM).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23868 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement ConstraintMatrix::merge() for constraint matrices localized by an IndexSet (same IndexSet on both CM).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23867 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add failing testcase for no_normal_flux constraints in 3d with higher order mapping failing.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23866 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test that currently fails.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23865 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make test compile and run. It does abort now, though...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23864 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

One more test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23863 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve error message.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23862 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Test works after all -- the deadlock was due to the fact that I called x.l2_norm() only for some processors.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23861 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Also set SERVER_BASED_SEARCH to NO.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23860 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set TEMPLATE_RELATIONS to YES.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23859 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add another one.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23858 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a new test. This one segfaults on my laptop, let's see what it does on the autotester.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23857 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove static_casts that are now no longer necessary since parallel::distributed::DoFHandler has been merged into the global ::DoFHandler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23856 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use '-Wl,-rpath,' instead of '-Wl,-rpath ' (note the comma instead of the space). It's quite mysterious how this worked in the first place for so long.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23855 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make our lives a bit easier in counting how many variables we output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23854 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add more details to the Refinement During Timesteps section

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23853 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added instantiation of PETScWrappers::MPI:Vector in MappingQEulerian

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23852 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Experiment with adding a search engine to the doxygen pages. It
doesn't quite work on my local machine, so see how it comes out on the
server.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23851 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update documentation in a number of places.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23850 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add something to the documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23849 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove wrong comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23848 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Augment documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23847 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

One more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23846 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a master's thesis.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23845 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove obsolete constructor

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23844 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

undo erroneous commit

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23843 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test permutation in RelaxationBlock

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23842 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix order in SSOR

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23841 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

implement ADI, awaits testing

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23840 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

stop copying BlockList

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23839 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

push block list into AdditionalData

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23838 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

change order of initialization

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23837 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test for correct size of permutation vector and add documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23836 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New function GridGenerator::merge_triangulations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23835 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New function GridGenerator::merge_triangulations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23834 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add Timo's PhD thesis.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23833 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix spelling of name.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23832 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Augment documentation for a case that two students have independently gotten wrong in the last two days.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23831 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add one.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23830 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check for a couple more C++11 features.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23829 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23828 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix typo in doc.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23827 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add one.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23826 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

One more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23825 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix year.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23824 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update one.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23823 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

step-32: fix error resulting in some settings being ignored in parameter file (conservative pressure, element order).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23822 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change suggested by Max Jensen: make clean shouldn't remove the TBB libraries. That's what make distclean is there for.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23821 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a typo pointed out by Max Jensen.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23820 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make compile with older compilers.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23819 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove accidentally included file :-(

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23818 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement serialization of DoFHandler objects.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23817 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make things work with objects that aren't copyable.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23816 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Yet one more test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23815 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust one test. Add another.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23814 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23813 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename one test. Create another.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23812 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor adjustment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23811 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Two new tests.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23810 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Compare pointers for equality by the object pointed to.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23809 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23808 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve test a bit.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23807 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reindent some parts.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23806 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added instantiations for boundary extraction in codim one

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23805 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix seeking boundary dofs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23804 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Undo previous patch: the flag was used after all (in the .cc file, which I
forgot existed) but not initialized. Initialize it now.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23803 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove a variable that isn't used and that, as noted by the triangulation
serialization test, wasn't initialized.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23802 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove two fields that are apparently not necessary any more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23801 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update after I apparently broke things with my last checkin by including more stuff...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23800 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement serialization functions for triangulations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23799 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Work around a problem in make 3.82: We define a rule in Makefile.rules how to generate the %/output files, but we define a different rule in mpi/Makefile for the same pattern. This appears to have worked with gmake 3.81, but doesn't any longer with 3.82. Fix this by disabling the first definition if Makefile.rules is included from mpi/Makefile.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23798 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Paper is accepted.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23797 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Re-indent parts.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23796 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

One more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@23795 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d