XDMF changes

Revert "Remove deprecated XDMFEntry::get_xdmf_content"

This reverts commit d9fad9fa023d2702df1677b8522f17536c74b5e7.

Merge pull request #14067 from kronbichler/improve_reference_cell

Speed up ReferenceCell::standard_vs_true_line_orientation

Merge pull request #13930 from kronbichler/speedup_cell_vertex_indices_cache

Speed up computation of cell vertex indices cache

Merge pull request #14064 from masterleinad/remove_xdmf_content

Remove deprecated XDMFEntry::get_xdmf_content

Merge pull request #14062 from kronbichler/improve_assert

Simplify assertion by AssertIndexRange

Merge pull request #14048 from masterleinad/remove_unqualified_functions

Remove unqualified ContantFunction and ZeroFunction

Merge pull request #14061 from sebproell/fe-eval-no-vectorization

Fix some VectorizedArrayTypes for non-default vectorization

Speed up ReferenceCell::standard_vs_true_line_orientation

Remove deprecated XDMFEntry::get_xdmf_content

Fix some VectorizedArrayTypes for non-default vectorization

Simplify assertion by AssertIndexRange

Merge pull request #14060 from masterleinad/remove_deprecated_lac_parallel_block_vector

Remove deprecated header file lac/parallel_block_vector.h

Merge pull request #14052 from kronbichler/index_set_improve

Small improvement for IndexSet::add_ranges_internal

Fix the reamaining occurrences

Merge pull request #14050 from tamiko/fix_cuda_tests

User projects: Make sure that CMAKE_CUDA_HOST_COMPILER is set.

Merge pull request #14049 from tamiko/fix_cuda_warnings

fix a warning when compiling with cuda support

Merge pull request #14058 from kronbichler/fix_tests

Fix a few MatrixFree tests

Fix a few tests

Merge pull request #14014 from peterrum/mg_dg_hp_test

Add test (MF+DG+hp)

Merge pull request #13842 from peterrum/build_interface_constraints_wedges

FESystem::build_interface_constraints() for wedges/pyramids

Merge pull request #14054 from peterrum/traling_const

Remove trailing const

Remove traling const

Add test (MG+DG+hp)

FESystem::build_interface_constraints() for wedges/pyramids

Small improvement for IndexSet::add_ranges_internal

User projects: Make sure that CMAKE_CUDA_HOST_COMPILER is set.

fix a warning when compiling with cuda support

dealii/include/deal.II/matrix_free/cuda_matrix_free.templates.h:1027:17:
    warning: loop variable ‘cell’ creates a copy from type ‘const
    dealii::TriaActiveIterator<dealii::CellAccessor<3, 3> >’
    [-Wrange-loop-construct]
dealii/include/deal.II/matrix_free/cuda_matrix_free.templates.h:1027:17:
    note: use reference type to prevent copying
 1027 |                 for (const auto cell :
      |                 ^~~~
      |                 &

Merge pull request #14037 from masterleinad/deprecate_matrixfree

Remove deprecated MatrixFree functionalities

Merge pull request #14043 from masterleinad/remove_deprecated_qprojector

Remove deprecated QProjector member functions

Merge pull request #14044 from tamiko/step_81_tutorial_fixes

step-81: Mention example step in the tutorial lists

Merge pull request #14045 from drwells/indexset-test-header

Include index_set.h in two more tests.

Merge pull request #14047 from masterleinad/remove_deprecated_dof_handler

Remove DoFHandler's initialize and set_fe

Merge pull request #14040 from masterleinad/deprecate_dof_tools

Remove deprecated DoFTools functions

Also add specialization for quadrilaterals

Speed up computation of cell vertex indices cache

Merge pull request #14046 from drwells/point-value-p4est

Mark two tests that depend on p4est as such.

Remove unqualified ContantFunction and ZeroFunction

Remove deprecated MatrixFree functionalities

Merge pull request #14042 from drwells/reword-data-out-resample

Slightly reword DataOutResample's documentation.

Remove DoFHandler's initialize and set_fe

Mark two tests that depend on p4est as such.

Include index_set.h in two more tests.

This was changed in f4c1cf9c6b.

Merge pull request #14024 from kronbichler/setup_indices_global_coarsening

Do not add locally owned dofs to ghost set during construction

step-81: Mention example step in the tutorial lists

Remove deprecated QProjector member functions

Remove deprecated DoFTools functions

Merge pull request #13947 from kronbichler/limit_run_to_needs

DoFAccessor: Run process_dof_indices only on FE entities with DoFs

Merge pull request #13853 from kronbichler/avoid_user_flag

Avoid some uses of Triangulation::user_flags

Merge pull request #14022 from kronbichler/reduce_header_inclusions

Reduce header inclusions of index_set.h in evaluation_kernels

Add extra check for index range.

Co-authored-by: David Wells <drwells@email.unc.edu>

Merge pull request #14021 from kronbichler/restructure_index_set

Restructure inline functions of IndexSet

Merge pull request #13931 from kronbichler/clean_up_access_dofs

Use pre-compiled structdim for access to TriaObjects in Accessor

Merge pull request #13922 from kronbichler/speed_up_reference_cell

Speed up evaluation of some ReferenceCell operations

Merge pull request #13921 from kronbichler/simplify_refinement_cases

Use shortcut when determining isotropic refinement cases

Slightly reword DataOutResample's documentation.

It is better to start with what a class does than what it does not.

Merge pull request #13808 from marcfehling/remove-hpdofhandler

Removed hp::DoFHandler.

Merge pull request #14038 from gfcas/fix_dof_tools_doc

DoFTools fix doc typo

DoFTools fix doc typo

Merge pull request #13991 from NiklasWik/update_jacobian_grads

Auto-detect update_jacobian_grads

Merge pull request #14035 from drwells/suppress-new-thread-deprecation-warning

Get rid of some warnings from defining Threads::new_thread().

Merge pull request #14032 from drwells/petsc-tvmult-test

Disable HYPRE in the Tvmult test.

Merge pull request #14034 from masterleinad/remove_sparsavanks_ctor

Remove deprecated SparseVanka constructors

Get rid of some warnings from defining Threads::new_thread().

This function calls a deprecated constructor but it itself is deprecated, so
this isn't all that helpful of a message. We presently see this warning printed
out whenever we compile examples that include this header on Debian 11.

Remove deprecated SparseVanka constructors

Merge pull request #14031 from masterleinad/remove_atomicadd_wrapper

Remove deprecated atomicAdd_wrapper

Disable HYPRE in the Tvmult test.

This is probably a bug in HYPRE - if we call this function then we abort with a
floating-point exception. If we disable the floating-point exception we get a
vector of all zeros, which is definitely wrong.

For now just disable this test.

Remove deprecated atomicAdd_wrapper

Merge pull request #14025 from kronbichler/partitioner_small_improvement

Merge pull request #14029 from drwells/gcc12-array-warning

Work around a GCC-12 warning about array accesses.

This only occurs at higher optimization levels with -Warray-bounds.

Merge pull request #14026 from kronbichler/fix_gather_warning

Fix warning of gcc-12 with gather_pd/ps instructions

Fix warning of gcc-12 with gather_pd/ps instructions

Merge pull request #14023 from kronbichler/remove_header

Query ghost index set only once in Partitioner::global_to_local

Merge pull request #14013 from peterrum/mf_categorize_ghost

MatrixFree: allow categorization of ghost cells

Update matrix_free.templates.h

Update include/deal.II/matrix_free/mapping_info.h

Co-authored-by: Peter Munch <peterrmuench@gmail.com>

Do not locally owned dofs to ghost set during construction

Reduce header inclusions of index_set.h in evaluation_kernels

Merge pull request #14015 from peterrum/get_cell_range_category_max

Make get_cell_range_category() more consistent with get_cell_category()

Remove obsolete header file

Merge pull request #14018 from bangerth/full

Better describe what FullMatrix is and does.

Restructure inline functions of IndexSet

Merge pull request #14019 from zjiaqi2018/clear-user-constraints

MGConstrainedDoFs::clear_user_constraints

MatrixFree: allow categorization of ghost cells

Make get_cell_range_category() more consistent with get_cell_category()

Better describe what FullMatrix is and does.

Merge pull request #14016 from peterrum/reference_hn_gc

Add reference to fast hanging-node algo and global coarsening

clear user constraints

Merge pull request #14017 from bangerth/23

Minor text improvements in a tutorial documentation.

Minor text improvements in a tutorial documentation.

Add reference to fast hanging-node algo and global coarsening

Merge pull request #14011 from bangerth/constexpr-2

Can't use ReferenceCells in switch-case.

Merge pull request #14010 from bangerth/constexpr

Can't use ReferenceCells in switch-case.

Merge pull request #14007 from peterrum/cell_vectorization_category_docu

Improve documentation of MF::AD::cell_vectorization_category

Can't use ReferenceCells in switch-case.

Can't use ReferenceCells in switch-case.

Merge pull request #14005 from peterrum/mf_ghost_categories

MatrixFree: improve assert