Merge pull request #13683 from kronbichler/flexible_cg

Implement flexible variant of conjugate gradient method

Merge pull request #13414 from bangerth/ca-free

Changelog

Add test case

Implement flexible variant of conjugate gradient method

Merge pull request #13664 from luca-heltai/cgal-surface-to-tria

Cgal surface to deal.II triangulation

Merge pull request #13690 from peterrum/mf_fenothing_asserts

Improve asserts in MF/FEEval regarding FENothing

Merge pull request #13692 from peterrum/face_to_cell_lines_pyramid_wedge

Implement ReferenceCell::face_to_cell_lines() for pyramids and wedges

Merge pull request #13695 from peterrum/GenericDoFsPerObject_format

Fix format of table

Merge pull request #13697 from kronbichler/add_changelog

Add changelog for MappingQ

Improve asserts in MF/FEEval regarding FENothing

Add changelog for MappingQ

Merge pull request #13688 from peterrum/fe_eval_user_define_batches_gather_evaluate

Fix FEEvaluation::gather_evaluate() for user-defined batches

Merge pull request #13691 from peterrum/mf_face_batch

Rename some face batches

Fix format of table

Implement ReferenceCell::face_to_cell_lines() for pyramids and wedges

Conversion from CGAL surface to deal.II tria

Do not check for orientation in codim-one simplex.

Merge pull request #13661 from luca-heltai/cgal-triangulation

Cgal triangulation

Code review.

Rename some face batches

Fix FEEvaluation::gather_evaluate() for user-defined batches

Added tests.

Support for CGAL::Triangulation_2 and CGAL::Triangulation_3.

Merge pull request #13685 from kronbichler/reduce_instantiations

Reduce number of instantiations of FEEvaluation template factory

Merge pull request #13678 from bangerth/ref-cell

Add ReferenceCell::volume() and ::barycenter().

Merge pull request #13684 from kronbichler/fix_test

Fix a recently added test

Merge pull request #13676 from kronbichler/simplify_set_init

Use simpler initialization of std::set

Reduce number of instantiations of FEEvaluation template factory

Fix a recently added test

Set test output to actual zero.

Simplify tests.

Merge pull request #13682 from kronbichler/variable_names_solver_cg

Merge pull request #13681 from peterrum/set_ghost_state

Add LinearAlgebra::distributed::BlockVector::set_ghost_state()

SolverCG: Switch to more common variable names

Improve name of a variable

Add LinearAlgebra::distributed::BlockVector::set_ghost_state()

Address more appearances.

Merge pull request #13679 from bangerth/fix-tests-2

Fix tests.

Fix tests.

Merge pull request #13599 from marcfehling/nonzeros-64

Use 64-bit integer for `n_nonzero_elements`.

Add a changelog entry.

Add tests.

Add ReferenceCell::volume() and ::barycenter().

Merge pull request #13675 from bangerth/14

Minor edits to the C++ namespace documentation.

Use simpler initialization of std::set

Merge pull request #13648 from bangerth/boundary-ids

Add DataPostprocessors::BoundaryIds.

Add another test.

Add another comment about which element one could use.

Merge pull request #13672 from drwells/improve-tutorial-graph-1

Improve tutorial graph

Merge pull request #13674 from kronbichler/use_renumbering_mf

Use renumbering of DoFs for step-37 benchmark

Minor edits to the C++ namespace documentation.

Merge pull request #13666 from marcfehling/step75-link

step-75: added link to external repository.

Tutorial graph: improve tree structure by adding more fake nodes.

Use renumbering of DoFs for step-37 benchmark

Tutorial graph: do not explicitly depend on grandparent nodes.

Tutorial graph: remove Stokes dependence from step-85.

This step doesn't have anything to do with FSI.

Tutorial graph: Remove multigrid dependence from step-12b.

Tutorial graph: remove circular dependencies.

step-39 depends on step-12b
step-61 depends on step-51

Merge pull request #13669 from luca-heltai/robust-cgal-detection

First try at detecting CGAL more robustly.

Merge pull request #13665 from drwells/modernize-c++-header

Avoid mentioning deprecated code in examples.

Modernize the header documenting our C++11 and newer support.

First try at detecting CGAL more robustly.

Merge pull request #13663 from zjiaqi2018/MGConstrainedDoFs-add-boundary-indices

MGConstrainedDoFs::add_boundary_indices()

Merge pull request #13653 from luca-heltai/cgal-surface-mesh

Add CGAL::Surface_mesh support

Merge pull request #13667 from drwells/fix-obscure-tria-numbering-problems

Fix a DoFRenumbering issue with serial data structures.

Fix the default constructor in NumberCache.

We should just delegate so that this is equivalent to zero DoFs.

Fix a DoFRenumbering issue with p::s::T.

This can happen if some processors don't have any degrees of freedom (e.g., we
run in parallel with only one cell in the triangulation). This crashed in a
spectacular way since this test would ultimately call MPI_Allgather with
different types at the same time.

The correct workaround here is to verify that all processors are doing the same
type of renumbering.

Make sure we use recent versions of CGAL.

step-75: added link to external repository.

Merge pull request #13628 from kronbichler/mf_renumbering

 Add a new renumbering function for data locality with MatrixFree

documentation

Merge pull request #13543 from nfehn/docu_remove_indentation

remove notes on indentation from documentation

Merge pull request #13627 from singima/gloss_edit

Glossary edit for material ids

add_boundary_indices

Merge pull request #13660 from drwells/fesystem-indexing

Implement proper indexing tables in FESystem::compute_fill().

This is about twice as fast as the old version.

Trying to fix FindCGAL.

Renamed function. Added boost header.

Code review.

Get ref_cells by reference

Address some comments

Added CGALWrappers::to_cgal_mesh()

Merge pull request #13644 from luca-heltai/cgal-support

Added support for CGAL library.

Code review.

Merge pull request #13593 from DaneilSun/dev

Installation problem with MPI on Windows

Merge pull request #13659 from drwells/avoid-sacado-warnings

Silence warnings from Sacado in user projects.

Add a test to validate changes to FESystem indexing.

Clean up some whitespace in fe_system.h.

Update cmake/modules/FindCGAL.cmake

Co-authored-by: Jean-Paul Pelteret <jppelteret@gmail.com>

Merge pull request #13654 from gassmoeller/ghost_particle_property_pool_breakage

Ghost particle property pool breakage

Silence warnings from Sacado in user projects.

Merge pull request #13658 from simonsticko/assert_runge_kutta_method_chosen

Assert that a method was choosen in the time stepping methods.

Make indent and improve test documentation.

Make sure also user include dir is set.

Assert that a method was choosen in the time stepping methods.

If one does not pass a runge_kutta_method to the constructor of one
of the TimeStepping::*RungeKutta classes and forgets to call the
initialize(..)-function, the program crashes with a poor error
message. Add asserts to get more descriptive error messages.

Merge pull request #13564 from bangerth/valgrind

Provide a count_cycles() function.

Merge pull request #13625 from elauksap/enable_abort_on_exception

Add enable_abort_on_exception