Patch by Felgru: Fix a bunch of documentation typos.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26543 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Generate output in GMV format instead of VTK. GMV has long been dead.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26542 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix last commit

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26537 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix last commit

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26536 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

benchmark: tweak script

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26535 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

benchmark: update script and ignores

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26534 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

work on benchmark script

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26533 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

performance benchmark: move to a more reasonable starting revision

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26531 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add a second performance test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26530 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

performance benchmark: clean the tests and write to different output files

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26529 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Updated benchmark test script

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26528 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update benchmark code to not require umfpack

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26526 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update svn:ignores

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26525 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

edit script

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26522 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Link to DoFTools::make_periodicity_constraints().

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26507 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix missing include file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26477 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26476 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make compile with current gcc mainline.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26474 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a crash in TimerOutput when MPI hasn't been initialized.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26473 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a book.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26464 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a crash under rare circumstances at the end of a program.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26463 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update Makefile

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26450 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update ignores

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26448 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add timing stuff

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26447 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add failing test for TimerOutput

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26446 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update script

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26445 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add first skeleton for performance benchmark

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26442 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust output after the recent fixes to TableHandler. The new output is correct as verified by base/table_handler_12.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26437 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26436 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add script for regression tester

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26435 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

move old benchmark tests away

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26434 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New tests.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26425 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26423 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix serialization of TableHandler

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26422 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

simplify test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26420 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26419 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26418 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26411 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26410 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix output of captions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26409 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26407 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update test and output for treating super-columns

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26406 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

consistent output of super-columns in TableHandler::write_text()

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26405 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add test for supercolumn output in TableHandler

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26404 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix output of captions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26403 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26396 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

speed up TableHandler::write_text by caching the formatted lines.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26394 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add failing test for deallog

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26388 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26387 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

disable auto-detection of hdf5 in configure

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26386 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add test for table handler

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26385 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Step 4: Remove the original monster testcase. Hurray.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26379 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Step 3: Also break out the computation of the prolongation matrices.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26378 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Step 2: break the restriction matrices out of the 'internals' test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26377 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Step one in breaking apart our monster testcase 'internals'. That testcase had an output of over 6MB with more than 12000 lines, a good fraction of which is susceptible to round-off errors. It is time to split this testcase by finite element to be able to tell more easily what is going on. These new testcases take over the part where we test support points.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26376 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Explicitly say so if a gmsh file being read contains triangles or tetrahedra.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26375 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add news

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26372 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add a simplified interface for MeshWorker::loop()

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26371 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Wait for processor 0 to be done with data files before deleting them.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26355 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Only delete tmp files created on the current processor.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26346 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Delete tmp files again.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26333 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust whitespace change related to r26325.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26332 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor edits related to using '\n' instead of std::endl.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26325 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove specializations in TriaObjects

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26313 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

only base class is required for initialization

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26311 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

introduce Hermite interpolation polynomials

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26310 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update one.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26304 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make project_boundary_values_curl_conforming work for distributed grids.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26303 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test Hermite interpolation polynomials

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26300 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

avoid specializations

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26297 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

avoid specializations

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26296 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Assume that std::numeric_limits is available. This has been the case for a very long time already.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26283 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Compilers have had std::i/ostringstream for a long time. Remove alternative.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26281 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

std::iterator has been in compilers for a long time, so remove the #ifdefs that provide alternate solutions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26280 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

move parts from numbers.h into types.h to fix circular inclusion of types, numbers, and config.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26269 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test TextOutputFormat::simple_table_with_separate_column_description

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26267 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new TextOutputFormat::simple_table_with_separate_column_description

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26266 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Do not even make petscall if not needed (PETSc>3.0.0).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26260 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add -Wno-unused-local-typedefs to the list of compiler flags as necessary.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26259 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove some commented out code that is apparently no longer necessary.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26258 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid a number of warnings about unused function arguments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26257 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Disambiguate call to vector::push_back to make gcc 4.8 happy.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26256 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove unused local typedefs along with lengthy documentation that is no longer accurate.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26255 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust whitespace in output file to account for r26251.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26254 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Yet another test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26253 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26252 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

make diffs not ignore whitespace for all tests.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26251 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use '\n' instead of std::endl and add a std::flush at the end.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26249 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Increase precision even more. There are still numbers that are printed as 0.xxxx7 or 0.xxxx8 as they are 0.xxxx75.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26246 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Document the Clang fix for Threads::Task when accessing the return value. The corresponding patch accidentally got committed as part of r26233.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26245 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make clang++ happy by ensuring that operator== is actually declared in the same namespace as its arguments (namely, namespace dealii).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26244 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Throw away small entries rather than printing them as 0.000 (or as a blank space) if they are truly zero.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26242 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Throw away small entries rather than printing them as 0.000 (or as a blank space) if they are truly zero.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26241 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Throw away entries in the matrix with a more generous threshold. This test is rather instable at a tolerance of 1e-16 and doesn't allow for good comparisons.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26237 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

start simplification of DoFHandler; remove dimension-dependent names in DoFLevels

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26236 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add and document the new make report+summary in the testsuite

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26235 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make code the same in debug and optimized mode. Otherwise this is a
prescription for subtle bugs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26234 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug where we try to access elements in a matrix that are beyond the end.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26233 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix assertion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26231 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement advection operators in weak form

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@26230 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d