Merge pull request #13140 from luca-heltai/docker-root-4

Make sure HOME, WORKDIR, and MPI env vars are set correctly.

Merge pull request #13128 from bangerth/flatten

More minor changes to GridGenerator::flatten_triangulation().

Merge pull request #13118 from bangerth/povray

Merge pull request #13134 from jppelteret/sd-batch_optimiser-03

Fix a bug in SD::BatchOptimizer::extract()

Avoid a warning about an unused variable.

Merge pull request #13111 from bangerth/47

Link from step-47 to step-82.

Merge pull request #13139 from jppelteret/sd-batch_optimiser-06

Small cleanup in SD::BatchOptimizer

Merge pull request #13135 from jppelteret/sd-batch_optimiser-04

Add SD::BatchOptimizer::copy_from() function

Add second variable.

Merge pull request #13133 from jppelteret/sd-batch_optimiser-02

SD::BatchOptimizer: Corrected location for a set of assertions.

Merge pull request #13130 from bangerth/flatten-3

Merge pull request #13138 from marcfehling/cache

Merge pull request #13132 from bangerth/flatten-4

Add an assertion to GridGenerator::flatten_triangulation().

Make sure HOME, WORKDIR, and mpi work correctly on root image.

Add a test

Merge pull request #13137 from marcfehling/docker

fix docker.yml - try 3

Add SD::BatchOptimizer::copy_from() function

Small cleanup in SD::BatchOptimizer

Merge pull request #13129 from tamiko/fix_quick_tests

CMake: use portable "rm" in quick_tests

Cache Intel workflow.

fix docker.yml

Update documentation of GridGenerator::flatten_triangulation().

Merge pull request #13125 from luca-heltai/docker-root-2

fix docker.yml - try 2.

CMake: use portable "cmake -E remove" in quick_tests

Closes: https://github.com/dealii/dealii/issues/13122

FIx a bug in SD::BatchOptimizer::extract()

Corrected location for a set of assertions.

When the SD::BatchOptimizer is provided with a cache from which the evaluated functions are to be extracted, then it is not actually necessary for the optimiser instance that is performing this operation to have had any values substituted.

Add an assertion to GridGenerator::flatten_triangulation().

More minor changes to GridGenerator::flatten_triangulation().

Merge pull request #13121 from marcfehling/cylindrical

Calculate cross product once.

fix docker.yml.

Merge pull request #13120 from luca-heltai/docker-root

Add docker image with root user.

Added endline.

Merge pull request #13093 from drwells/fix-xargs-warning

Remove a redundant argument to xargs.

Calculate cross product once.

Merge pull request #13119 from bangerth/cxx20

Minor doc update in the cmake system.

Merge pull request #13117 from bangerth/flatten

Minor rework of the GridGenerator::flatten_triangulation() function.

Merge pull request #13109 from bangerth/simplify

Simplify initialization of block objects in the tutorial.

Merge pull request #13108 from bangerth/19

Omit unnecessary template argument.

Merge pull request #13116 from bangerth/deprecate

Deprecate the new_thread() functions.

Add docker image with root user.

Minor doc update in the cmake system.

Separate 2d povray output from the general case.

Minor rework of the GridGenerator::flatten_triangulation() function.

Add a changelog entry.

Deprecate the new_thread() functions.

Merge pull request #13112 from bangerth/unique_lock

Add a necessary include file.

Merge pull request #13080 from bangerth/doc-66

Minor doc changes to the consensus algorithms

Better document what consensus algorithms actually are.

Add a necessary include file.

Link from step-47 to step-82.

Simplify initialization of block objects in the tutorial.

Omit unnecessary template argument.

Remove a redundant argument to xargs.

On GNU, '-I {}' implies '-L 1', i.e., provide one line to each invocation. Since
we are using '-0' (NUL-delimited input) we already implicitly get one item per
line, so the -n 1 is redundant (and also raises a warning).

A simple example: running

    ls --zero | xargs -0 -I {} echo 'aa {}'

prints 'aa ' followed by each item in the current directory - i.e.,
NUL-delimited input really is represented as one line per item.

Merge pull request #13099 from peterrum/gc_weighting

Global coarsening: compress weights

Merge pull request #13107 from luca-heltai/fix-non-matching-doxygen

Make sure doxygen does not format all combinations of NonMatching::coupling_*.

Merge pull request #13101 from kronbichler/fix_face_orientation

Bug fix of MF face eval for hanging nodes and non-standard orientation

Global coarsening: compress weights

Make sure doxygen does not format all combinations of couplings.

Changelog

New test cases to cover more orientation issues

Bug fix of MF face eval for hanging nodes and non-standard orientation

Merge pull request #13012 from kronbichler/simplify_mg

Start from zero vector for MG coarse solver

Merge pull request #13096 from kronbichler/use_alias_fe

Boundary values: Use alias fe instead of cell->get_fe()

Boundary values: Use alias fe instead of cell->get_fe()

Merge pull request #13094 from bangerth/period

Fix a comment's grammar.

Merge pull request #13091 from bangerth/warning-2

Alternative way to avoid warnings.

Alternative way to avoid warnings.

Merge pull request #13088 from bangerth/cons

Avoid the need for empty lambda functions in ConsensusAlgorithms::AnonymousProcess.

Merge pull request #13065 from peterrum/gc_feq

Global coarsening: specialize code for FE_Q

Merge pull request #13086 from bangerth/filter-3

Rename 'filter' to 'filter.pl'.

Merge pull request #13087 from bangerth/message

Minor fix to an error message.

Avoid the need for empty lambda functions in ConsensusAlgorithms::AnonymousProcess.

Minor fix to an error message.

Merge pull request #13081 from gfcas/update_citation

Update step-66

Rename 'filter' to 'filter.pl'.

Minor doc changes.

Global coarsening: specialize code for FE_Q

Merge pull request #13071 from bangerth/filter-2

Use one instead of two regexes.

Avoid wrong doxygen linking

Update citation in step-66

Update citation

Merge pull request #13076 from peterrum/gather_evaluate_mixed

MatrixFree::gather_evalute(): allow mixed numbers

Merge pull request #13069 from bangerth/filter-1

Update a link.

Merge pull request #13077 from kronbichler/eval_detect_vectorized_gather

Evaluation kernels: Make sure to pick vectorized gather function

Merge pull request #13078 from peterrum/fe_eval_all

Eliminate FEEvaluationData::get_all_face_numbers () and get_all_face_orientations ()

MatrixFree::gather_evalute(): allow mixed numbers

Fix tidy warning

Eliminate FEEvaluationData::get_all_face_numbers () and get_all_face_orientations ()

Merge pull request #13072 from bangerth/typo

Fix the spelling of a function name.

Merge pull request #13038 from peterrum/pft_repartition

p::f::T: allow repartitioning

Merge pull request #13075 from bangerth/semi

Remove an unnecessary semicolon.

Evaluation kernels: Make sure to pick vectorized gather function

Remove an unnecessary semicolon.

Fix the spelling of a function name.

Merge pull request #13056 from kronbichler/simplify_evaluation_kernel_calls

Simplify calls to FEEvaluation kernels

Merge pull request #13061 from bangerth/fix

Fix pyramid output in DataOutBase::write_gnuplot().

Merge pull request #13060 from bangerth/write-gnuplot-wedges

Also support wedges and pyramids in GridOut::write_gnuplot()

Merge pull request #13057 from marcfehling/support_tbb

Make many variable names more consistent