Merge pull request #6408 from bangerth/step-51

Minor edits to the step-51 introduction.

Minor edits to the step-51 introduction.

Specifically, make sure 'FE_DGPMonomial' is spelled correctly. While there,
also address a couple of other things.

Merge pull request #6426 from drwells/fix-clang-6-warnings

Fix clang 6 warnings

Merge pull request #6420 from masterleinad/update_base_assign_subscriptor

Update test output for base/assign_subscriptor without threads

Removed an unused typedef.

Use nullptr instead of 0.

Merge pull request #6424 from tamiko/fix_mpi_version_variables_2

CMake: Fix MPI version detection, round two

CMake: Fix MPI version detection, round two

Merge pull request #6421 from tamiko/fix_mpi_version_variables

CMake: Fix MPI version detection for newer cmake

Merge pull request #6390 from masterleinad/new_fixes_4

Provide alternative output for the *vector_add_and_dot_complex tests without threads

Merge pull request #6418 from masterleinad/update_lac_vector_memory

Update alternative test output for lac/vector_memory

Merge pull request #6417 from kkormann/fix_6300

Fix matrix-free commits (comments by Bruno Turcksin).

CMake: Fix MPI version detection for newer cmake

CMake: Remove OpenMPI specific version detection

Update test output for base/assign_subscriptor without threads

Merge pull request #6419 from masterleinad/update_base_reference

Update test output for base/reference without threads

Update test output for base/reference without threads

Update alternative test output for lac/vector_memory

Merge pull request #6405 from masterleinad/undefined_4

Avoid accessing elements of a zero size vector in ParticleHandler

Fix matrix-free commits (comments by Bruno Turcksin).

Merge pull request #6414 from kronbichler/issue_6403

Use std::vector::data+offset() rather than [] access

Merge pull request #6413 from masterleinad/undefined_8

Avoid creating pointer to invalid memory in get_dof_indices

Merge pull request #6409 from bangerth/add-include

Add a necessary #include file.

Remove unnecessary const_cast.

Merge pull request #6412 from masterleinad/initialize_sun

Initialize SUN* objects

Merge pull request #6381 from drwells/update-step-6

Update step 6.

Use vector::data() + offset in a few places. Add assertion.

Do not dereference pointers as we might be at the end of the array.

Simplify the last AssertThrow

Avoid accessing elements of a zero size vector in ParticleHandler

Avoid creating pointer to invalid memory in get_dof_indices

Initialize SUN* objects

Merge pull request #6404 from masterleinad/undefined_3

Guard accessing values in Vector<Number>::zero_out_ghosts

Add a necessary #include file.

We now reference the 'free' function in the .h file. We need to '#include' the necessary
header file.

Merge pull request #6401 from masterleinad/undefined_1

Only invert bits up to the maximum possible in ~CacheUpdateFlags

Merge pull request #6406 from masterleinad/undefined_5

Avoid signed overflow in test

Merge pull request #6402 from masterleinad/undefined_2

Avoid signed overflow in Testing::rand

Merge pull request #6387 from masterleinad/correct_deleter_readwritevector_values

Call the correct deleter for ReadWriteVector::values

Change style of array access

Fix some documentation regarding exception handling.

Avoid signed overflow in test

Merge pull request #6371 from jppelteret/follow_up_to_6335-2

CMake: Make Adol-C check for boost pool more specific.

Merge pull request #6398 from davydden/tests/zoltan

zoltan: run with mpirun annotation to avoid race condition

Merge pull request #6263 from mathgirl/assert_in_do_integrate_difference

Add missing assert in do_integrate_difference

Merge pull request #6391 from masterleinad/new_fixes_3

Avoid accessing invalid memory in base/utilities_pack_unpack_04

Merge pull request #6399 from GivAlz/NonMatchDocu

Fix documentation for NonMatching

Merge pull request #6392 from masterleinad/new_fixes_2

Clarify that base/reference causes stack-use-after-scope

Merge pull request #6375 from masterleinad/fix_scalapack_create_group

Fix scalapack create group

Guard accessing values in Vector<Number>::zero_out_ghosts

Add documentation to nonoverflow_add

Added documentation for NonMatching namespace

Avoid signed overflow in Testing::rand

Only invert bits up to the maximum possible in ~CacheUpdateFlags

Merge pull request #6400 from drwells/remove-double-stars

Avoid using '**/' at the end of comments.

Avoid using '**/' at the end of comments.

zoltan: run with mpirun annotation to avoid race condition

Merge pull request #6395 from kronbichler/test_fixes_avx512

Test fixes with AVX-512

Merge pull request #6296 from luca-heltai/failing-test

Fix bug in MappingFEField

Merge pull request #6389 from masterleinad/fix_memory_leak_kinsol

Fix memory leak in KINSOL wrapper

Test fixes with AVX-512.

Clarify that base/reference causes stack-use-after-scope

Avoid accessing invalid memory in base/utilities_pack_unpack_04

Provide alternative output for the *vector_add_and_dot_complex tests without threads

Fix memory leak in KINSOL wrapper

Use initializer list instead of default initializer

Merge pull request #6388 from kronbichler/documentation_matrix_free

Improve documentation of new matrix free data structures

Merge pull request #6385 from masterleinad/fix_warning_nonconst_comparator

Fix warning for non-const comparator

Merge pull request #6386 from kronbichler/mf_face_emplace_back

Prefer emplace_back over push_back in a few places

Document new parameters.

Fix doxygen appearance of MatrixFree::Loop.

Fix copydoc in FEEvaluationBase.

Call the correct deleter for ReadWriteVector::values

Merge pull request #6368 from drwells/fix-assert-nothrow-slicing

Fix assert nothrow slicing

Prefer emplace_back over push_back in a few places.

Fix warning for non-const comparator

Merge pull request #6384 from kronbichler/fix_changelog

Break lines before author names in changelog

Break lines before author names in changelog.

Link p4est issue in

Changelog entry

Add test

Use Utilities::MPI::MPI_Comm_create_group

Add Utilities::MPI::MPI_Comm_create_group

Add MPI version check

Merge pull request #6377 from kronbichler/matrix_free_fixes

Matrix free DG test fixes

Merge pull request #6382 from drwells/remove-more-c++11-references

Remove some references to C++11 support.

Merge pull request #6383 from drwells/fix-doc-typos-9

Fix more typos.

Merge pull request #6380 from masterleinad/disable_sc_init

Disable sc_init

Fix more typos.

Work was done by codespell and the (newly fixed) double_word_typos.py script.

Remove some references to C++11 support.

Merge pull request #6379 from drwells/no-subscripers-noexcept

Mark Subscriptor::check_no_subscribers as noexcept.

Edit some documentation in step-6 for clarity.

Clean up the headers in step-6.

Remove trailing spaces in step-6.

Update images in step-6.

Fix the remaining tests

Redo the SmartPointer description in step-6.

The old version doesn't make sense anymore since a Triangulation does not store
a SmartPointer pointing to a manifold.

Remove explicit manifold usage from step-6.

Merge pull request #6378 from kronbichler/fix_vectorized_scatter

Fix vectorized scatter for AVX-512

Disable sc_init

Mark Subscriptor::check_no_subscribers as noexcept.

Follow-up to a029a7f7acb7fe1a9bd30672b23da577af3c1932: since this function
should never throw we can mark it as noexcept.

This commit also updates relevant documentation explaining the present
behavior.