Merge pull request #13644 from luca-heltai/cgal-support

Added support for CGAL library.

Code review.

Merge pull request #13593 from DaneilSun/dev

Installation problem with MPI on Windows

Merge pull request #13659 from drwells/avoid-sacado-warnings

Silence warnings from Sacado in user projects.

Update cmake/modules/FindCGAL.cmake

Co-authored-by: Jean-Paul Pelteret <jppelteret@gmail.com>

Merge pull request #13654 from gassmoeller/ghost_particle_property_pool_breakage

Ghost particle property pool breakage

Silence warnings from Sacado in user projects.

Merge pull request #13658 from simonsticko/assert_runge_kutta_method_chosen

Assert that a method was choosen in the time stepping methods.

Make indent and improve test documentation.

Make sure also user include dir is set.

Assert that a method was choosen in the time stepping methods.

If one does not pass a runge_kutta_method to the constructor of one
of the TimeStepping::*RungeKutta classes and forgets to call the
initialize(..)-function, the program crashes with a poor error
message. Add asserts to get more descriptive error messages.

Merge pull request #13564 from bangerth/valgrind

Provide a count_cycles() function.

Merge pull request #13625 from elauksap/enable_abort_on_exception

Add enable_abort_on_exception

Merge pull request #13655 from bangerth/doc-77

Update documentation in DataOutFaces.

Make sure we test cgal support in Github CI.

Added CGAL in html docs.

Update documentation in DataOutFaces.

Merge pull request #13652 from kronbichler/instantiate_periodicity

Instantiate make_periodicity_constraints for all scalar numbers

Added support for CGAL library.

Co-authored-by: Luca Heltai <luca.heltai@gmail.com>

Fix bug in particle list sort

Instantiate make_periodicity_constraints for all scalar numbers

Merge pull request #13650 from bangerth/tests-2

Remove unnecessary include.

Merge pull request #13645 from jppelteret/step-44_fe_space_01

step-44: Change the FE space used for p,J

Remove unnecessary include.

step-44: Change the FE space used for p,J

Merge pull request #13647 from luca-heltai/fix-doc

Add function to simplex docs.

Add function to simplex docs.

Add simple test that breaks property pool in debug

Merge pull request #13636 from peterrum/MGTransferBlockMatrixFreeBase_copy_to_mg

Simplify MGTransferBlockMatrixFreeBase::copy_to_mg()

Merge pull request #13591 from NiklasWik/RT_matrix_free

Matrixfree evaluation with `FE_RaviartThomasNodal`

Merge pull request #13641 from peterrum/mg_level_object_back

Implement MGLevelObject::back()

fix: building problem with MPI on Windows system

Matrix-free evaluation of FE_RaviartThomasNodal

Test added for matrix-free RT
Split of evaluation_template_factory.templates.h
Decrease FE_EVAL_FACTORY_DEGREE_MAX to 2 for windows vm

Implement MGLevelObject::back()

Merge pull request #13626 from singima/xdmf

Changes to XDMFEntry to use uint64_t data types

Merge pull request #13634 from peterrum/use_fast_hanging_node_algorithm_remove

Remove parameter use_fast_hanging_node_algorithm from MF

Merge pull request #13610 from zjiaqi2018/get-function-jumps-etc

FEInterfaceValues::get_jump/average_*_function_values

Simplify MGTransferBlockMatrixFreeBase::copy_to_mg()

Remove parameter use_fast_hanging_node_algorithm from MF

Merge pull request #13630 from drwells/cleanup-includes

Cleanup includes

Merge pull request #13632 from simonsticko/discrete_quadrature_generator_triangulation_cell

Change cell type passed to DiscreteQuadratureGenerator::generate()

Add a documentation note to the generate()-function.

Delete some not-needed objects from test of DiscreteQuadratureGenerator.

Change cell type passed to DiscreteQuadratureGenerator::generate()

The cell passed to the generate()-functions does not need to have
dofs associated with it. The cell will be cast to an iterator of
the correct type internally. Change the parameter type of the
generate function to Triangulation::active_cell_iterator.

Merge pull request #13615 from bergbauer/quadrature_generator_with_discrete_levelset

Quadrature generator with discrete levelset

Merge pull request #13624 from cdev911/fixing_typo

fixing typo of the type 'the the'

Merge pull request #13573 from peterrum/mg_tools_new_functions

Add functions to MGTools

Merge pull request #13341 from peterrum/feeval_range

Add iota views to FEEval

Add functions to MGTools

Avoid including the iterator header.

We don't ever use it and its deprecated.

Clean up header inclusions.

Most of this was from cleaning up tensor.h and then also cleaning up
where we include utilities.h.

Merge pull request #13629 from kronbichler/fix_typos

Fix typo in variable name

QuadratureGenerator with discrete levelset

Fix typo in variable name

Make FEEval more consistent with FEValues

reverting changes in bundled folder

XDMFEntry commit

Changed the constructors of XDMFEntry to allow for uint64_t datatypes
that we need for large data.  Changed some things in create_xdmf_entry
to match.

Merge pull request #13617 from singima/64bit_change

Using uint64_t as node variables for hdf5 output

Add enable_abort_on_exception

fixing typo of the type 'the the'

Merge pull request #13621 from drwells/improve-renumber-support-points

Make DoFRenumbering::support_point_wise() about twice as fast.

Make DoFRenumbering::support_point_wise() about twice as fast.

1. There must be an equal number of DoFs per component, so they do not need to
   be calculated.
2. IndexSet::add_indices() works best when indices are sorted, so provide them
   one component at a time.
3. Clean up the output files to match assertions.

Changing data types for more storage

Merge pull request #13604 from peterrum/rpe_refactor_all_points_found

RPE: refactor determination of unique mapping and all points found

rm unused variables

address comments

Merge pull request #13581 from drwells/update-muparser

Update bundled muParser to 2.3.3

RPE: refactor determination of unique mapping and all points found

Merge pull request #13608 from peterrum/MGTransferBlockMatrixFreeBase

Introduce MGTransferBlockMatrixFreeBase

Merge pull request #13605 from peterrum/IsBlockVector

Generalize IsBlockVector

Merge pull request #13612 from tjhei/warn_copy_data

fix a release mode warning

Merge pull request #13614 from tjhei/assert_bug

fix bug in Assert() macro

fix bug in Assert() macro

fix a release mode warning

Merge pull request #13609 from marcfehling/doi-75

Added Zenodo DOI for step-75.

Merge pull request #13603 from peterrum/gc_interpolate_to_mg_fix

Fix MGTransferGlobalCoarsening::interpolate_to_mg()

changelog

update step-74

add a test

feiv::get_*_function_values

Merge pull request #13606 from peterrum/mf_block_vector

Simplify check for BlockVector

Merge pull request #13607 from peterrum/ldv_sm_test

Test LA::d::V's shared-memory capability on a Cartesian virtual topology

Fix MGTransferGlobalCoarsening::interpolate_to_mg()

Introduce MGTransferBlockMatrixFreeBase

Test LA::d::V's shared-memory capability on a Cartesian virtual topology

Merge pull request #13597 from simonsticko/face_quadrature_generator_1D

Specialize NonMatching::FaceQuadratureGenerator in 1D

Generalize IsBlockVector

Simplify check for BlockVector

Added Zenodo DOI for step-75.

Merge pull request #13601 from nfehn/fix_rpe_point_found

bug in RemotePointEvaluation::point_found(i) for i=0

now implement correct version

found bug in RemotePointEvaluation::point_found(i) for i=0

Specialize NonMatching::FaceQuadratureGenerator in 1D

This class must be specialized in 1D, because the general
FaceQuadratureGenerator<dim> class uses the QuadratureGenerator<dim-1>
class internally, which does not make sense when dim-1 = 0.

Template class ImmersedSurfaceQuadrature<0, 1>

Exclude a specialized constructor of Quadrature<0> from doxygen.

To supress a doxygen warning.

Merge pull request #13600 from simonsticko/subquadrature_0D

Define Quadrature<0>::SubQuadrature as Quadrature<0>

Before this, the SubQuadrature of Quadrature<0> was defined as
Quadrature<-1>. This can lead to problems with some compilers because
Quadrature<-1> should never be instantiated. Avoid this by redefining
SubQuadrature of Quadrature<0>.

Merge pull request #13594 from marcfehling/author-wiki

Update link to wiki in `indent_common.sh`.

Update link to wiki in `indent_common.sh`.

Merge pull request #13586 from NiklasWik/rt_nodal_renumber_aniso

Bug fix - renumbering points for FERaviartThomasNodal