Fix testcase to use optimization.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19416 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Regenerate.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19415 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check for a compiler bug on Mac OS X.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19414 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use a smarter implementation of a parallel = operator. Work around a problem with the g++ on MacOSX.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19413 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix memory consumption.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19412 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Write documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19411 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Only compute error indicators locally.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19410 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Found a smarter way to set the diagonal.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19409 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add a constructor for a zero polynomial of degree n

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19408 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make sure that destroy_communicator does nothing in case we're using Trilinos without MPI.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19407 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reset to a higher end time.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19406 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Show results.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19405 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement the destroy_communicator() function. Use it for Trilinos objects, and make sure not to destroy the ones for the sparsity pattern since they apparently are still used.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19404 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set file properties.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19403 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Ignore output files.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19402 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Properly set file properties.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19401 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Slightly adjust testcase.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19400 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove debug output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19399 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19398 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add to documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19397 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add to documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19396 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Do less output. Do less mesh refinement.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19395 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Comments cleanup.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19394 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Language fixes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19393 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Correct sample code.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19392 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make formula consistent.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19391 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Properly set the degree of polynomial approximation in the Chebyshev smoother. Damped Jacobi is degree zero, not degree 1.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19390 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

And one more update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19389 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

One more comment update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19388 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Cleaned up code and comments a bit.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19387 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Some more comments updates.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19386 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add declaration of destroy_communicator(); implementation will come tomorrow.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19385 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Regenerate.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19383 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Do not check for a header file that's no longer in Trilinos dev.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19382 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix two typos found by Till Heinemann.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19381 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

A few more edits.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19379 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor proof reading -- very good text already!

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19378 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Write an introduction.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19376 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Comments updated.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19374 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Output only every 20th step. Be prepared to output up to 100,000 steps.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19373 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

List a fix from today.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19371 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

When doing reinit() on a distributed vector, it is not enough to ensure that the local range is the same, but we'd need to make sure that *all* local ranges are the same. We can do so by comparing the Trilinos maps.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19370 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Work around a bug in gcc 4.0 where it injects a friend class
declaration into the wrong namespace.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19369 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Small doc change.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19368 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix compilation problem.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19367 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19366 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert dimension to 2.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19365 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New results.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19364 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Wrote in-code comments. Make matrix-vector product parallel (even though it uses locks right now).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19363 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

On Mac OS X, all symbols referenced in a shared lib must be available. Since we use Vector<T> in a number of places, this means that we also have to have available everything that Vector uses, in particular the symbol internal::Vector::minimum_parallel_grain_size. Move this variable to base into parallel.{h,cc} to make the OS X linker happy. While there, also move internal::SparseMatrix::minimum_parallel_grain_size.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19362 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

The Laplacian is a symmetric operation, so only store the symmetric part of it. Produce even 3D output in results.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19361 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement and document pressure scaling.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19360 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Escape 'internal'.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19359 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Escape 'numbers'.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19358 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Document our approach to scaling the equations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19357 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a section on scaling. Not quite finished yet, though.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19356 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a first version of the step-37 tutorial program that implements a matrix-free method for the Laplace equation and combines it with multigrid.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19355 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix two more typos.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19354 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Allow reinit without setting zeros in TableBase class.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19353 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement two more matrix-matrix multiplications: the case when B is transposed.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19352 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make the initialize function in Chebyshev preconditioner unique.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19351 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Some more tiny comments changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19350 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update some obsolete comments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19349 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Finish implementation of Chebyshev preconditioner.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19348 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add initializers with BlockIndices

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19347 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add functionality to FETools::compute_block_renumbering

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19346 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix one more place.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19345 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use better markup for comp(i) and base(i).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19344 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a few wrong indices, as pointed out by Till Heinemann.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19343 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Escape 'parallel'.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19342 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use a different symbol (U_i) for the expansion coefficients, to
differentiate it from the components u_i of the vector-valued solution u.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19341 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't include header files that aren't present any more in current Trilinos dev.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19340 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve wording.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19339 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide one more instatiation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19338 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide an implemention for a Chebyshev polynomial preconditioner.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19337 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

The method Jacobi_step now uses vmult and other pre-defined functions instead of implementing the sweep by itselfs. This makes sure that the function gets parallelized by threads.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19336 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

The first few operations in the CG algorithm can be written in a more compact form.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19335 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set one more parameter in AMG preconditioner setup.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19334 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Print maximal velocity.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19333 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove a file that is seriously outdated.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19332 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add explicit cast.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19331 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Write a couple of paragraphs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19330 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Choose parameters correctly, at least for 2d.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19329 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19328 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide parallelized versions of some more vector-vector operations like assignments, adds.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19327 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Since TBB 2.2 (which we have just imported), there is no longer a need to create by hand a scheduler object of type tbb::task_scheduler_init in each thread. Rather, the TBB can do that itself whenever necessary. Make use of that feature and get rid of code that was hard to get right in the first place.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19326 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Extend hierarchy.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19325 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Document --with-cpu=native.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19324 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Document --with-cpu=native.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19323 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo in aclocal.m4. Regenerate configure.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19322 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Allow --with-cpu=native.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19321 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Switch to using the newer version of the TBB.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19320 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Take over adjustments to build system from previous versions of the TBB in our directories.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19319 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove examples and tests directories.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19318 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add new release TBB 2.2.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19317 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

already FEFaceValuesBase has an integration dimension

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19316 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Escape 'parallel' in a bunch of places.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19315 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix determination of c_R in the program, and document our value.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19314 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

allow printing to deallog

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19313 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug in a formula.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@19312 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d