Merge pull request #12324 from bangerth/memory

Use automatic memory management with GSL objects.

Use automatic memory management with GSL objects.

Merge pull request #12328 from peterrum/collective_calls_warning

Add some warnings regarding collective calls

Merge pull request #12322 from marcfehling/patch-spacedim

Introduce `patch_dim` and `patch_spacedim` in DataOut classes.

Merge pull request #12325 from drwells/remove-test-variable

Remove an unused variable in a test.

Add some warnings regarding collective calls

Merge pull request #12321 from bangerth/mpi

Add a missing AssertThrowMPI.

Remove an unused variable in a test.

Merge pull request #12299 from Rombur/clang_13_warnings

Fix warnings using clang 13.0

Make MSVC happy.

Introduce `patch_dim` and `patch_spacedim` in DataOut classes.

Add a missing AssertThrowMPI.

Merge pull request #11221 from marcfehling/deprecate-dofhandlertype-2

Replaced template argument DoFHandlerType by spacedim for classes ...

Merge pull request #12315 from simonsticko/fix_tria_accessor_noexcept

Remove noexcept on TriaAccessor move constructor and assignment operator

Merge pull request #12308 from masterleinad/remove_deprecated_parallel_triangulation

Remove deprecated parallel::Triangulation

Merge pull request #12303 from masterleinad/remove_deprecated_CellDataTransfer_CoarseningStrategies

Remove deprecated parallel::distributed::CellDataTransfer::CoarseningStrategies

Fix warnings using clang 13.0

Remove noexcept on TriaAccessor move constructor and assignment operator

To avoid a compilation error with clang 6.0.0.

Update doc/news/changes/incompatibilities/20210525DanielArndt

Co-authored-by: Marc Fehling <mafehling.git@gmail.com>

Merge pull request #12310 from marcfehling/deprecate-tests

Replace remaining occurences of DoFHandler::locally_owned_dofs_per_processor() in the tests folder.

Merge pull request #12306 from bangerth/arkode

Unify internal names of SUNDIALS ARKODE interfaces.

Merge pull request #12309 from drwells/improve-mpi-checks-4

Add some more AssertThrowMPIs.

Replace remaining occurences of DoFHandler::locally_owned_dofs_per_processor() in the tests folder.

Add some more AssertThrowMPIs.

Merge pull request #12307 from bangerth/arkode-2

Fix a mistake in the ARKODE interface documentation.

Merge pull request #12304 from bangerth/ida

Unify internal names of SUNDIALS IDA interfaces.

Remove deprecated parallel::Triangulation

Unify internal names of SUNDIALS ARKODE interfaces.

As previously done for the KINSOL interfaces, this patch avoids the t_arkode_ prefix
and instead uses _callback as suffix. I don't quite know where the t_ prefix
comes from, but it sounds like jargon that may be present in the SUNDIALS
internal documentation but that a typical reader of our code would not
know about.

Since these are all internal functions of deal.II, we can rename them freely.
In particular, because they are in anonymous namespaces, we can re-use the same
names already in use in the KINSOL interfaces.

Treat `hp::DoFHandler` as alias. Clean up template-arguments.in from `hp::DoFHandler`.

Remove template argument `DoFHandlerType` from tests.

Remove template argument `DoFHandlerType` for classes ...

... SolutionTransfer, FEFieldFunction, DataOut, DataOut_DoFData, DataOutFaces, DataOutRotation.

Deprecate Legacy classes.

Fix a mistake in the ARKODE interface documentation.

Unify internal names of SUNDIALS IDA interfaces.

As previously done for the KINSOL interfaces, this patch avoids the t_dae_ prefix
and instead uses _callback as suffix. I don't quite know where the t_ prefix
comes from, but it sounds like jargon that may be present in the SUNDIALS
internal documentation but that a typical reader of our code would not
know about.

Since these are all internal functions of deal.II, we can rename them freely.
In particular, because they are in anonymous namespaces, we can re-use the same
names already in use in the KINSOL interfaces.

Remove deprecated parallel::distributed::CellDataTransfer::CoarseningStrategies

Merge pull request #12300 from marcfehling/typo-triaaccessor

Fix typo in `TriaAccessor`.

Fix typo.

Merge pull request #12292 from jppelteret/step-79-touchups_01

Some minor changes to the step-79 documentation

Merge pull request #12294 from masterleinad/special_members_tria_accessor

Provide special member functions for TriaAccessor

Mark destructor and move assignment operator as noexcept

Merge pull request #12295 from masterleinad/remove_deprecated_locally_owned_dofs_per_processor

Remove deprecated DoFHandler::locally_owned_dofs_per_processor

Allow copy construction again

Remove deprecated DoFHandler::locally_owned_dofs_per_processor

Fix typos

Provide special member functions for TriaAccessor

Merge pull request #12293 from nicola-giuliani/tria-clear-user-data-bug

added check not to call faces if dim == 1 when clearing user data

Merge pull request #12290 from peterrum/trilinos_vector_local_size

Replace usage of local_size() with locally_owned_size() in trilinos_vector.h

added check not to call faces if dim == 1 when clearing user data

Replace usage of local_size() with locally_owned_size() in trilinos_vector.h

Merge pull request #12270 from bangerth/aligned-4

Rename a few classes to make them easier to understand.

Some minor changes to the step-79 documentation

Merge pull request #12288 from drwells/remove-deprecated-petsc-10.0

Merge pull request #12289 from drwells/promote-early-deprecations

Promote early deprecations.

Promote early deprecations.

Remove a lot of deprecated PETSc things.

Avoid deprecated features in PETSc tests.

Merge pull request #12285 from tamiko/update_version_dependencies

update version requirement

update version requirement in documentation

update version requirement

Merge pull request #12284 from tamiko/master

Update version for release.

update VERSION

Merge pull request #12283 from tamiko/update-doxygen-tag

Update doxygen tags.

Merge pull request #12282 from tamiko/update-changes-file

Replace individual files by one changelog for the whole release.

Update doxygen tags.

Remove now obsolete files.

Update the changelog file for the release.

Update the changelog file for the release.

Update the changelog file for the release.

Merge pull request #12034 from juleoc02/step-79

Step 79: A topology optimization problem

Merge pull request #12246 from mathsen/gcc_11

Fix compilation issues with GCC 11.1

Merge pull request #12273 from drwells/step-78-edits

Step 78 edits

Merge pull request #12278 from jppelteret/symengine-fix_10016

Fix SymEngine tests for SymEngine version 0.7 and greater

Merge pull request #12281 from peterrum/tests_with_simplex_support

Remove remaining .with_simplex_support=on from tests

Merge pull request #12277 from masterleinad/fix_inline

Fix functions that should be inline in *.templates.h files

Remove remaining .with_simplex_support=on from tests

Merge pull request #12279 from peterrum/tria_policy_copy

Clone policy in Triangulation

Fix SymEngine tests

Clone policy in Triangulation

Merge pull request #12276 from marcfehling/clang-tidy

Fix clang-tidy issues with #12246.

Fix functions that should be inline in *.templates.h files

Merge pull request #12261 from bangerth/initlog-2

Use C++11 functionality.

Merge pull request #12262 from bangerth/initlog-3

Pass 'true' instead of '1' for a function that takes a 'bool' argument.

Merge pull request #12272 from luca-heltai/fix-ida

Fixed naming in IDA.

fix indentation

Fix clang-tidy issues with #12246.

fixec preprocessor directive

add preprocessor directive to restrict changes to GCC >= 11 and Intel compilers

step-79: a topology optimization problem.

Merge pull request #12035 from tyand96/step-78

Step 78

step-78: clarify that we have an IMEX method.

step-78: Update results.

step-78: Avoid doing another timestep at the end.

We should finish at 1, not 1 + dt.

step-78: Avoid using singular first-person pronouns.

This change makes this tutorial more in line with the common style of the others.

step-78: Make output a lot quieter.

We don't want to print thousands of lines.

step-78: Fix some minor typos.

Fixed naming in IDA.

Merge pull request #12266 from bangerth/ida

Minor updates to the SUNDIALS/IDA wrappers.

Merge pull request #12254 from luca-heltai/fix-kinsol

Fix kinsol

Merge pull request #12269 from bangerth/aligned-3

Remove a destructor now no longer necessary.

Addressed comments by WB.