Break postprocessing the velocity out of the function that computes errors.

The step-61 program now has a separate function
'compute_postprocessed_velocity' that computes the velocity field as
a postprocessing step after computing the pressure variable. The
resulting velocity field is used in both computing errors and when
creating graphical output.

There is really no functional change, it just rearranges the code
and makes it a bit simpler to read. The only functional simplification
is that we don't compute the velocity at quadrature points from shape
function times coefficient, but use FEValues::get_function_values()
instead.

Merge pull request #9110 from masterleinad/serial_tria_particle_handler

Allow using serial triangulations with ParticleHandler

Merge pull request #9119 from masterleinad/disable_warning_python_wrappers

Disable warning in python-wrappers only for newer clang

Merge pull request #9118 from peterrum/get_size_info

Remove MF::get_size_info()

Disable warning in python-wrappers only for newer clang

Do not use MF::get_size_info()

Remove restriction from Particles::Generators tests

Remove p4est restriction in Particles::DataOut

Fix numbering in ParticleHandler::insert_particles()

Allow using serial triangulations with ParticleHandler

Merge pull request #9072 from luca-heltai/output-particles

Add simple output for particles.

Merge pull request #8963 from peterrum/gridout_vtu_pvtu

Update tutorials to use write_vtu_with_pvtu_record

Merge pull request #8661 from tjhei/fe_interface_values_2

FEInterfaceValues: replace step-12

Fix compiler warnings

Merge pull request #9097 from kronbichler/fix_mf_setup

Fix MatrixFree::reinit() with FE_Q with face integration facilities

Merge pull request #9113 from rezarastak/mpi_min_arrayview

explicit instanciation is provided for Utilities::MPI::min

Merge pull request #8774 from jpthiele/hdf5_documentation

Hdf5 documentation

explicit instanciation is provided for Utilities::MPI::min and max with ArrayView

Merge pull request #9103 from peterrum/partition_triangulation_zorder_nonblocked

Relax assumpitions in GridTools::partition_triangulation_zorder

Merge pull request #9105 from masterleinad/simplify_free

Simplify CUDAWrappers::MatrixFree::free

Merge pull request #9108 from simonsticko/doc_fix_get_active_neighbors

Add note on template parameter in doc of GridTools::get_active_neighbors

Add note on template parameter to GridTools::get_active_neighbors.

Simplify CUDAWrappers::MatrixFree::free

Relax assumpitions in GridTools::partition_triangulation_zorder

Added include guards in the source file

Added P4est guard to ensure consistency with the reste of the particle library

Fixed indentation

Fixed according to comments

- Added description for the patches member of the data out class
- Added lines in  between the functions
- Added forward declaration of the particle handler in the data out
class
- Removed non-useful headers

Merge pull request #9101 from kronbichler/reduce_mapping_q_memory

Only allocate some MappingQGeneric internal data if necessary

Changelog

Only allocating mapping internal data if necessary

Fixed data out according to comments

- Removed now useless comments
- Pruned out includes that were not needed
- Added documentation for constructor and destructor
- Removed useless line in the test documentation

Add python wrappers for MappingQGeneric (#9055)

Add python wrappers for MappingQGeneric

Merge pull request #9088 from masterleinad/suppress_warning_python_bindings

Suppress warning in python-bindings

Changelog

New test case

Fix bug in access of dof indices without resolving constraints

Use range-based for loop

Merge pull request #9091 from tjhei/readme_build_status

README.md: display build status

Merge pull request #9094 from kronbichler/tolerance_find_all_active_cells_around_point

Relax default tolerance for find_all_active_cells_around_point

Merge pull request #9095 from tjhei/jenkins_allow_master

jenkins: allow testing master

jenkins: allow testing master

update

Add test case

Relax default tolerance for find_all_active_cells_around_point

Merge pull request #9090 from tjhei/doc_report_where

make target documentation report location

Merge pull request #9092 from drwells/fix-typo

Fix typo (Genreal -> General)

Merge pull request #9089 from tjhei/doc_cite_step_55

step-55: doc update, add citation

Fix typo (Genreal -> General)

README.md: display build status

Merge pull request #8999 from sophy1029/step-61

Step-61 Use FE_DGRT instead of FE_RT

Merge pull request #9086 from masterleinad/minor_improvements_2

Minor consistency improvements in tensor.h

Merge pull request #9087 from masterleinad/restrict_mpi_tests

Restrict some MPI tests requiring p4est

Add comment

Merge pull request #9032 from peterrum/dict_generalize

Generalize ComputeIndexOwner::Dictionary

make target documentation report location

I am repeatedly struggling to find the correct .html file to open after
running "make documentation". Fix this by printing the absolute path to
the index.html to the screen.

step-55: doc update, add citation

Merge pull request #9085 from masterleinad/minor_improvements_1

Avoid C-style workaround in DataOutBase

Suppress warning in python-bindings

Restrict some MPI tests requiring p4est

Minor consistency improvements in tensor.h

Avoid C-style workaround in DataOutBase

Merge pull request #9082 from rezarastak/generic_block_sparse_matrix

typedef LinearAlgebraDealII::BlockSparseMatrix is defined

Merge pull request #9081 from masterleinad/document_msvc_2019_failure

Comment MSVC 2019 DEAL_II_HAVE_CXX14_CONSTEXPR_CAN_CALL_NONCONSTEXPR failure

typedef LinearAlgebraDealII::BlockSparseMatrix is defined

Comment MSVC 2019 DEAL_II_HAVE_CXX14_CONSTEXPR_CAN_CALL_NONCONSTEXPR failure

Merge pull request #9080 from masterleinad/fix_msvc

Fix compiling with MSVC

Make ddet_F_dC constexpr conditionally

Undefault Tensor constructor for MSVC

Disable DEAL_II_HAVE_CXX14_CONSTEXPR_CAN_CALL_NONCONSTEXPR for MSVC

Add appveyor.yml

Fixed indentation

Improvements to the Particle::DataOut

Moved the definition of the class to a new file
Moved function definition into .cc file
Reshaped the code following comments (all hopefully)

Extension of step-3 using HDF5 and R for plotting scripts

Add mapping wrappers

Merge pull request #9079 from masterleinad/avoid_python-bindings-warnings

Avoid warnings in python-bindings

Merge pull request #9066 from masterleinad/fix_adolc_test

Fix ADOL-C tests

Avoid warnings in python-bindings

Add simple output for particles.

This class manages the DataOut of a Particle Handler
It currently only supports witing the particle position
and their ID

Co-authored-by: Bruno Blais <blais.bruno@gmail.com>

Use FE_DGRT instead of FE_RT

Forward declare SymmetricTensor specializations

Add header

Merge pull request #9063 from masterleinad/fix_msvc_2

Avoid workaround for zero-dimensional C-style arrays

Merge pull request #9057 from masterleinad/fix_adolc_warnings

Fix ADOL-C warnings

Use overloads again

Merge pull request #9058 from masterleinad/fix_compiling_python_bindings

Fix compiling python-bindings

Merge pull request #9062 from masterleinad/fix_msvc_1

Avoid ambiguous unrolled_to_component_indices call

Avoid workaround for zero-dimensional C-style arrays

Merge pull request #9051 from masterleinad/fix_compiling_clang_3_7_1

Fix compiling with clang-3.7.1

Avoid ambiguous unrolled_to_component_indices call

Generalize ComputeIndexOwner::Dictionary so that it can handle gaps in the local index set

Merge pull request #9061 from marcfehling/doc-hprefinement

Doc: Minor changes to hp::Refinement.

Merge pull request #9059 from masterleinad/fix_hp_cell_weights_034

Fix hp_cell_weights_03/04

Doc: Minor changes to hp::Refinement.

Use explicit instantiations instead of forward declarations

Fix compiling python-bindings

Fix hp_cell_weights_03/04

Fix ADOL-C warnings

Merge pull request #9054 from masterleinad/defaulted_function_copy_constructor

Defaulted copy constructor for Function

Merge pull request #9056 from bangerth/doc

Clarify documentation.