.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4934 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Dont generate Makefiles any more by configure, but rather externalize the only variable line to a file on its own. This makes it easier to add new tests, since we dont have to call ./configure then any more, and we dont have to change two files then.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4933 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove backupu files.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4932 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

thesis added to publication-list

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4931 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix forgotten change in 1d.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4930 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove function FE_Q::get_renumber. Slight changes necessary elsewhere.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4929 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

FETools::lexicographic_to_hierarchic and other way round.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4928 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove obviously unnecessary variable.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4927 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Slightly simplify the build_renumbering function.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4926 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4925 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Dont throw an exception any more if we call close and the matrix is
already close.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4924 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Dont throw an exception any more of we enter ConstraintMatrix::close and the matrix is closed already. Simply return then.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4923 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

ConstraintMatrix::is_identity_constrained

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4922 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix assertion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4921 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change the create_boundary_mass_matrix function to match the behaviour of the create_mass_matrix and create_laplace_matrix functions as follows: for system finite elements scalar coefficient functions and a vector-valued coefficient functions are supported.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4920 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Extend the create_mass_matrix and create_laplace_matrix functions to use vector valued coefficient functions for system elements.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4919 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Replace global MappingQ1 object by the static function FEValuesBase<dim>::get_default_mapping that returns reference to the default MappingQ1 object.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4918 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

WB want's to do the build_renumbering TODO.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4917 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add WBs comment

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4916 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix wrongly rendered output where a trailing space is also underlined
in a cross reference.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4915 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Include doc for power function.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4914 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add implementation of new 2d-geometry.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4913 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change output of some exception.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4912 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

reverse_grey_scale_color_function

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4911 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a rather rare race condition in MT mode: we checked that we did
not yet visit a face by looking at a value that is written when
visiting this face. We double checked later when writing into it. In
some rare conditions, it could happen that another process was working
on it, but only wrote between the two checks, making the latter fail.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4910 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add another safety check.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4909 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a rather rare race condition in MT mode: we checked that we did
not yet visit a face by looking at a value that is written when
visiting this face. We double checked later when writing into it. In
some rare conditions, it could happen that another process was working
on it, but only wrote between the two checks, making the latter fail.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4908 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Output file was created on linux, so regenerate it on Sun for comparability. Test should now no longer fail.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4907 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

QProjector::project_to_child

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4906 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a missing std::, as pointed out by Benjamin Kirk (benkirk@cfdlab.ae.utexas.edu)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4905 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check pivot size relative to other matrix entries.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4904 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add optional options to matrix output class.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4903 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

BlockMatrix now has function el()

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4902 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove some commented-out functions. Reindent.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4901 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Let file conform to coding standards.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4900 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add new class MatrixOut and corresponding testcase.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4899 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove an assertion for corner cases, which is not strictly necessary
and was rather thought as an aid in finding programming errors. After
discussion it was thought that it is more difficult to maintain it
than to remove it.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4898 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

TODO update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4897 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a class that provides algorithms working on triangulations. New test case.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4896 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

spawn wrappers for member functions with 7 args.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4895 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Well, revert patch as does not help...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4894 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add path to Sun F77 libs to linker line.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4893 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Previously, the preconditioners using matrices, derived privately from
PreconditionRelaxation, but introduced the only function of the base
class later on explicitely into the public area. Since private
inheritance interferes with the use of the Subscriptor class in the
base class (we can't cast to it any more), change the inheritance to
public and remove the explicit "using" declarations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4892 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add comment about a case where we had a TODO previously.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4891 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Derive solvers publicly from Solver, and remove derivation from Subscriptor since the base class already inherits it.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4890 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reinsert an assertion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4889 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

It was decided that FEValues should no longer support support_points.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4888 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Why should we want to merge them?

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4887 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

The good reason to have the classes distinct is probably that we want
to have the == operator in the base class not compare all the
complicated and long fields, but just the simple ones.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4886 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Derive Solver and Preconditioners from Subscriptor. Let PreconditionLACSolver use SmartPointers instead of C style pointers.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4885 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Think about using global std::vector objects in the value_list
function, in order to avoid repeated memory allocation for these
objects. However, no way springs to mind as apparent, basically
because the length of these vectors depends on the number of points at
which the derivative is to be computed, which may vary between
successive calls to the function and we don't want to grow the vectors
beyond all bounds if once many points are required and usually only a
few.

Nevertheless, clean up some things...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4884 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

TODO

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4883 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove the template argument from the MatrixTools and MatrixCreator classes. This also requires to make the IteratorRange arguments to the threaded functions be passed by value rather than by reference since they are generated as a temporary now.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4882 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add some docs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4881 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check the requirements on vectors and matrices in the linear solvers. Minor clean-ups.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4880 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

operator*= for vector and block vector.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4879 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement operator*= for vectors and block vectors.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4878 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix leading underscores as nobody else seems to have an interest in doing it...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4877 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add some assertions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4876 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add precondition_Jacobi to FullMatrix.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4875 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Just reindent.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4874 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve the ConstraintMatrix::merge function for the case that objects are already sorted. Write a test for this function.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4873 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide BlockVector with a new constructor that initializes the vector from an iterator range.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4872 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New constructor for Vector<...> that takes two iterators the range of which is then copied.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4871 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Has finally appeared.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4870 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove the kludge that the QProjector happened to become a real class derived from Quadrature. Rather, make the respective constructor call two functions in their own that return a Quadrature object.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4869 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

density of Naca flow. M=2. alpha=5 degree.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4868 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Include naca picture. Set size of picture to 100, explicitly.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4867 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clarify docs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4866 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

ConstraintMatrix::merge

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4865 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Extend ConstraintMatrix::merge.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4864 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve docs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4863 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add colorized column indicating how many test cases failed today.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4862 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check reduced residual for equality as well.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4861 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify computation of laplace vector.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4860 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add target libo as in the base subdir.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4859 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use of appropriate quadrature rule for MappingQ4 leads to small change in output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4858 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New namespacing of functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4857 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New namespacing of functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4856 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New namespacing of functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4855 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New namespacing of functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4854 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

FourierSineSum and FourierCosineSum

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4853 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

TODO more explicit

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4852 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

obsolete TODO removed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4851 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Wrap all instances of conceret functions into a namespace of their own.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4850 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

FourierSine and FourierCosineFunction

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4849 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Assembling of the laplace matrix is performed using a quadrature that now depends on the degree of mapping employed.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4848 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4847 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Include additional assertion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4846 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use relative error rather than absolute error for checking for an internal error.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4845 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check for rand_r/rand

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4844 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix missing include. Dont know why this was not found before... :-(

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4843 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

bug fixed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4842 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix some TODOs. Add memory_consumption functions in several places.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4841 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix use of private typedef by using the original type.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4840 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Derive all PreconditionBlock* class virtually from Subscriptor. This allows also PreconditionBlockSSOR to be derived from Subscriptor. Use of virtual derivation to avoid ambiguity.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4839 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix missing typename.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4838 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4837 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a missing std::

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4836 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Detect some things for Sun's WorkShop compiler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@4835 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d