Merge pull request #914 from bangerth/doc-update-26

Extend the error message for ExcIndexRange.

Extend the error message for ExcIndexRange.

I must have had half a dozen students this semester who were unable to
decipher what this error message really means:

An error occurred in line <1183> of file
<../include/deal.II/lac/vector.h> in function
    Number &dealii::Vector<double>::operator()(const size_type) [number
= double]
The violated condition was:
    i<vec_size
The name and call sequence of the exception was:
    ExcIndexRangeType<size_type>(i,0,vec_size)
Additional Information:
Index 0 is not in [0,0[

This commit simply provides them with some more information.

Merge pull request #913 from bangerth/cleanups-2

A couple of minor code cleanups

Merge pull request #912 from bangerth/doc-update-25

Fix wrong HTML markup.

Merge pull request #911 from bangerth/doc-update-24

Update documentation for a recent commit.

Make a couple of tolerances relative to the size of the object.

Remove a few #ifdefs by just moving a variable into the Assertion.

Fix wrong HTML markup.

Update documentation for a recent commit.

Merge pull request #910 from fsonner/paramloopfix

Remove unused function from MultipleParameterLoop::UserClass

Remove unused function from param loop UserClass

Merge pull request #907 from tamiko/fix_condition

Bugfix: Fix misplaced brackets in condition

Merge pull request #908 from tamiko/fix_warnings

silence a warning, part 2

silence a warning, part 2

Merge pull request #906 from tamiko/fix_warnings

silence a warning

Bugfix: Fix misplaced brackets in condition

silence a warning

Merge pull request #883 from Rombur/serial_vector

[RFC] deprecate Trilinos and PETSc wrappers of serial vectors

Don't throw an exception recommanding to use mpirun -np 1 in the tutorials.

Fix double entry in changes.h

Deprecate TrilinosWrappers constructors instead of the whole class to silence warnings.

Deprecate the serial TrilinosWrappers and PETScWrappers classes instead of the constructor. Use complete_set_index in the tutorials.

Throw an exception when one tries to use in parallel tutorials that are serial. Consistently use MPI_COMM_WORLD with reinit(IndesSet, MPI_Comm) in the tutorials.

Replace PETScWrappers::Vector by PETScWrappers::MPI::Vector in step-36.

Fix a conflict in step-17.

Update changes.h

Deprecate PETScWrappers::Vector and PETScWrappers::BlockVector and update the tutorials.

Deprecate TrilinosWrappers::Vector and TrilinosWrappers::BlockVector and update the tutorials.

Merge pull request #904 from nicolacavallini/master

multiple polynomials_bernstein instantiation, in polynomials_bernstein.c...

multiple polynomials_bernstein instantiation, in polynomials_bernstein.cc and fe_bernstein.cc

Merge pull request #900 from masterleinad/branch_fix_half_hyper_shell

Fixed colorization for GridGenerator::half_hyper_shell

Fixed colorization for GridGenerator::half_hyper_shell

Merge pull request #901 from luca-heltai/fix-dyn-sparsity

Fix Dynamic Sparsity Pattern bug on Macs

Closes #889

Merge pull request #896 from masterleinad/branch_add_point_gradient

Implement point_gradient similarly to point_value

Merge pull request #899 from tamiko/add_two_small_comments

add two comments

add two comments

Merge pull request #897 from tamiko/move_constructors

A bunch of bugfixes for move operators

Remove move operators and constructors from PETSc variants

fixup

Bugfix: Do not reinitialize in move operator

Bugfix: Implement BlockIndices::swap correctly

Bugfix: Implement PETScWrappers::BlockVector::swap for different block sizes

Bugfix: Correctly set up object in move constructor

Bugfix: Implement TrilinosWrappers::BlockVector::swap for different block sizes

Bugfix: Correctly set up object in move constructor

Bugfix: Implement BlockVector<number>::swap for different block sizes

Bugfix: Correctly set up object in move constructor

Bugfix: Correctly set up object in move constructor

Add an entry to changes.h and reduce the number of actual implementations for point_value and point_gradient

Implement point_gradient similarly to point_value

Merge pull request #893 from tamiko/move_semantic

Add move constructor and operator to Vector and BlockVector

reindent

Do not clear vectors in move operators/constructors for distributed data structures

Add tests for native deal variants and TrilinosWrappers::MPI

add a changes.h entry

Add move constructor and operator to PETScWrappers::MPI::Vector and PETScWrappers::MPI::BlockVector

Add move constructor and operator to TrilinosWrappers::MPI::Vector and TrilinosWrappers::MPI::BlockVector

Add move constructor and operator to Vector and BlockVector

Merge pull request #890 from tjhei/blockwise-mg

multigrid block_wise renumbering

add changelog entry

extend test

add serial test for DoFRenumbering::block_wise for MG

Remove is_active check in dof renumbering

Condense locally-owned conditions for renumbering

Add spacedim parameter to renumbering function

Fix block-wise dof renumbering for multigrid

Re-adds a version of DoFRenumbering::block_wise working on a single
multigrid level. For this an internal helper function is changed to
work with non-active cells.

Merge pull request #887 from drwells/consistent-logical-operators

Consistent logical operators

Update to match the current style guide.

Add a style guideline for "&&", "||", and "!".

Merge pull request #886 from fsonner/gmresfix

Remove duplicate memory freeing in GMRES

Add test for double memory freeing bug in GMRES

Remove duplicate memory freeing in GMRES

Merge pull request #884 from Rombur/muelu_periodicity_64bit

The muelu_periodicity tests should not be run with 64bit indices.

Merge pull request #880 from tamiko/update_documentation

Documentation update, minor fixes Changes:

The muelu_periodicity tests should not be run with 64bit indices.

Merge pull request #881 from bangerth/fix-warning

Fix a warning about an unused variable.

Fix a warning about an unused variable.

Provide template default arguments

Update documentation

Add operator*=(number) variant to LinearOperator

Merge pull request #878 from drwells/remove-stl-references

Remove STL references

Update copyright years.

Update the estimated memory consumption comment.
This one had a sentence fragment and mentioned the STL.

Remove compatability with EGCS 1.1.
Chances are GCC has been patched in the last sixteen years to fix this
issue.

Remove references to the STL.
These comments should refer to the C++ standard instead, which now
includes the STL (standard template library).

Merge pull request #867 from bangerth/remove-deprecated-row-iterators

Remove deprecated row iterators

Merge pull request #877 from tamiko/silence_warnings

Silence extra diagnostics in the testsuite

Silence extra diagnostics in the testsuite

Merge pull request #864 from ian-r-rose/new_mpi_sum_utilities

Add collective MPI sums for tensorial objects

Add collective MPI sums to tensorial objects

Fix indentation

indentation

Move functions to mpi.h, address other comments

Try to avoid variable length array declaration

Add entry to changelog

Fix slash

Merge pull request #873 from mtezzele/fe_tools-with-fe_bernstein

Added FE_Bernstein in fe_tools.cc.

added FE_Bernstein in tests/fe/fe_tools_01.cc

Added fe_bernstein in fe_tools.cc. Now get_fe_from_name works.

Merge pull request #874 from tjhei/doxygen_fixes

doxygen fixes

remove @tref

doxygen fixes

- Looks like \footnotesize is not valid in MathJax
- escape _ in linear_operator.h

Merge pull request #869 from bangerth/doc-update-24

Update documentation in one of the examples.

Don't compare floating point numbers directly, but via std::fabs.

Update documentation in one of the examples.

I tripped over this place the other day because we were setting
boundary indicators without checking that the face is actually
at the boundary. One of my students used the code as the
template to build his own and promptly proceeded to set the
boundary indicator of an internal face.