Merge pull request #8218 from kronbichler/adjust_documentation

Move changelog entry to proper file

Move changelog entry into proper place

Merge pull request #8189 from adam4130/update-boost

Updated boost::unordered_map/set to std library

Merge pull request #8212 from tjhei/doc_colon_eq

doxygen: use coloneq in tutorials

Merge pull request #8191 from kronbichler/transfinite_manifold_robustness

Make TransfiniteInterpolationManifold more robust

doxygen: use coloneq in tutorials

Merge pull request #8209 from masterleinad/trilinos_12_14_vector_adaptor

Add vector_adaptor_02 Trilinos-12.14.1 variant

Merge pull request #8208 from tjhei/add_some_tutorial_keywords

step-63 typo and add some tutorial keywords

Merge pull request #8207 from tjhei/step63changelog_into_release

move changelog entry for step-63

Merge pull request #8200 from tamiko/adolc_guard

CMake: Add a safeguard that disables ADOL-C in case SEACASChaco is enabled

Adjust tolerance in push_forward

Add vector_adaptor_02 Trilinos-12.14.1 variant

Merge pull request #8205 from jppelteret/sd-doc_03

Remove doxygen format from a comment block

Add changelog

Three new test cases to verify the transfinite manifold

step-63 typo and add some tutorial keywords

9.1: move changelog entry for step-63

Remove doxygen format from a comment block

Merge pull request #8202 from tjhei/fix_at_name_tags

fix doxygen @name tags

fix name

fix doxygen @name tags

Merge pull request #8201 from tjhei/doc_remove_at_name_hack

clang-format: do not break @name lines

clang-format: do not break @name lines

remove hack in scratch_data and add @name to the list of items not to
break automatically.

note: I hate having to fight clang-format.

CMake: Add a safeguard that disables ADOL-C in case SEACASChaco is enabled

Merge pull request #8195 from jppelteret/scratch_data-doc_01

Fix documentation in ScratchData

Fixed indentation

Fix documentation in ScratchData

Merge pull request #8193 from bangerth/typo

Fix a typo.

Fix a typo.

Make the transfinite manifold more robust

Merge pull request #8188 from tjhei/undeprecate_get_mg_dofs

undeprecate get_mg_dof_indices

Updated boost::unordered_map/set to std library

undeprecate get_mg_dof_indices

fixes #7887
While the general function makes sense in assembly, this function is
useful in other situations and makes code more expressive.

Merge pull request #8178 from tjhei/step63-fix

followup small step-63 edits

Merge pull request #8186 from tjhei/doxygen_fixes6

doxygen: two broken lists

Merge pull request #8181 from tjhei/examples_folder_other_ccs

examples: ignore temporary cc files in cmake

doxygen: two broken lists

examples: ignore temporary cc files in cmake

I had an editor leave a temporary cc file in the example directory. This
caused cmake/make to fail in hilarious ways. To try it yourself:
``touch examples/step-63/a#.cc``

By reducing the glob to files that are of the form "step-*.cc", we
should be able to avoid this problem. In my case the file was
".#step-63.cc".

followup small step-63 edits

Merge pull request #8177 from masterleinad/tutorial_description_61_64

Add description for step-61 and step-64

Add description for step-61 and step-64

Merge pull request #8079 from tcclevenger/step63-documentation

Step-63 Documentation

Merge pull request #8173 from masterleinad/fix_general_data_storage

Fix general_data_storage test

Fix general_data_storage test

Merge pull request #8171 from tjhei/doxygen_fixes5

fix doxygen formula errors

step-32 text in formula spacing

two more warnings

fix doxygen formula errors

small fixes

fix right test function and Peclet def

address change requests

Intro and small fixes

Intro and Result fixes

changes for results.dox, intro outline, corrections

fix prm formatting, expand prm documentation, doc changes, hook in step-63

Changelog, prm fixes, initial docs, add new parameters

Merge pull request #8168 from drwells/unify-subscriptor-log

Unify the log entry for Subscriptor.

Unify the log entry for Subscriptor.

The remark about rvalue references is no longer correct since we
switched, after the ban on rvalue references, to storing a
std::string (which permits rvalues once more).

Merge pull request #8166 from tamiko/update_version_requirement

Require the current version of deal.II.

Require the current version of deal.II.

Merge pull request #8165 from tamiko/master

update VERSION

update VERSION

Merge pull request #8164 from tamiko/update_tag_file

Update TAG file

Merge pull request #8163 from tamiko/update-changes-file

Replace individual files by one changelog for the whole release.

Update TAG file

Remove now obsolete files.

Update the changelog file for the release.

Merge pull request #8158 from kronbichler/fix_trilinos_precondition_test

Adapt test file for Trilinos IC precondition

Merge pull request #8159 from kronbichler/fix_grid_tools_guess_pt_owner_02

Correct memory access in grid_tools_guess_pt_owner_02

Merge pull request #8160 from jppelteret/ad-band_aid_sacado_test

Band-aid for a failing AD test

Band-aid for a failing AD test

Sacado::Rad::Advar<Sacado::Fad::Dfad<double>> fails for the second derivatives (nan) with the current evaluation point. This fixes the test, but one still wonders what the underlying issue is :-/

Merge pull request #8157 from kronbichler/improve-step-59

Fix some typos in results of step-59

Merge pull request #8154 from tamiko/deuglify_step_42

deuglify step-42

Merge pull request #8151 from masterleinad/fix_icc_19_warning

Avoid ICC-19 warning

Correct memory access in grid_tools_guess_pt_owner_02

Adapt test file for Trilinos IC precondition

Fix some typos in results of step-59

Merge pull request #8135 from kronbichler/gcc9-warning-0

gcc9 warning: Provide copy constructor for class with operator=

Merge pull request #8140 from tamiko/cppcheck-1

cppcheck: Fix include/deal.II/algorithms/general_data_storage.h

Merge pull request #8155 from tjhei/tutorial_improvements

improve tutorial layouts

improve tutorial layouts

- remove a TODO
- replace aspect URL and use ASPECT not Aspect
- fix some formulas
- use table headers

deuglify step-42

Merge pull request #8148 from drwells/disable-fp-exceptions-hdf5

Disable floating point exceptions in two HDF5 tests.

Avoid ICC-19 warning

Merge pull request #8150 from masterleinad/missing_header_symengine

Add missing header in symengine_tensor_operations.h

Add missing header in symengine_tensor_operations.h

Merge pull request #8147 from kronbichler/fix_two_tests

Make two tests more stable

Merge pull request #8142 from drwells/cppcheck-9.1

Cppcheck 9.1

Create vector before assigning

Merge pull request #8149 from drwells/add-6774-changelog

Add a changelog entry for 6774.

Merge pull request #8139 from tamiko/disable-gcc-9-warning

Ignore -Wdeprecated-copy in external headers

fix changelog entry format

Cppcheck: Fix general_data_storage.h

Add a changelog entry for 6774.

Disable floating point exceptions in two HDF5 tests.

Merge pull request #8145 from masterleinad/warn_cuda_threads_native

Warn about using CUDA+Threads+march=native

cppcheck: initialize a member in the init list.

cppcheck: Pass a vector by reference.

cppcheck: Match variable names in the header and source.

cppcheck: explicitly call a virtual function in a ctor.