Merge pull request #6242 from luca-heltai/map-boundary-to-manifold-ids

Added map_boundary_to_manifold_ids.

Add another test for GridTools::map_boundary_to_manifold_ids

Touchup documentation

Merge pull request #6232 from jppelteret/ad-fixes_04

Update SymmetricTensor class for AD numbers

Merge pull request #6248 from luca-heltai/reset-manifolds

Deprecate set_manifold(id), moved to reset_manifold(id)

Fixed JPs comments.

Fixed JPs comments.

Docentry.

Replace set_manifold by reset_manifold

Deprecated set_manifold. Added reset_all_manifolds.

Merge pull request #6236 from GivAlz/DocumentationFe

Corrected documentation for FEFieldFunction

Corrected documentation about FEFieldFunction and distributed triangulation: exception is triggered only for artificial cells

Merge pull request #6231 from jppelteret/ad-fixes_03

Update Tensor class for AD numbers

Merge pull request #6244 from tjhei/document_hyper_l

documentation fixes for hyper_L

Merge pull request #6243 from GivAlz/EraseDouble

Removed double include in grid_tools.h

documentation fixes for hyper_L

Removed double include in grid_tools.h

Added map_boundary_to_manifold_ids.

Merge pull request #6239 from jppelteret/muparser_werror

Add default cases to switches in muParser

Merge pull request #6235 from BenBrands/MRRR_bug

ScaLAPACKMatrix: remedy for exceptions from within p_syevr/_syevr

Merge pull request #6224 from davydden/feature/extractor_tensor

add gradient of Tensor extractor

Merge pull request #6220 from Rombur/cuda_solver

[RFC] Add CG test using cuda

remedy for exceptions from within p_syevr/_syevr

Merge pull request #6211 from tcclevenger/stokes_comp_test

add test stokes computation

Add default cases to switches in muParser

Fixes #6238

Instantiate SymmetricTensor class for auto-differentiable numbers

Fix issue with AD SymmetricTensor eigenvalue/vector calculations.

For auto-differentiable numbers, when the input tensor was diagonal the
sensitivities of the eigenvalues/vector with respect to one another were
deduced. This means that although the correct results were being
returned, their derivatives were incorrect. This patch attempts to
correct this by perturbing a diagonal input tensor (of AD number type)
and computing an approximation to the eigenvalues/vectors.

more fixes of whitespaces and incode comments

update tests and add a changelog

Instantiate Tensor class for auto-differentiable numbers

Fix Tensor::invert() for auto-differentiable numbers

Merge pull request #6230 from jppelteret/ad-fixes_02

Various updates and fixes for AD numbers

implement gradient of FEValuesViews::Tensor

Also change meaning of divergence so that
Grad(T) : I = Div(T).

cleanup incode comments in fe_values.h

Merge pull request #6215 from kronbichler/reduce_number_of_threads

Reduce number of threads in tests

Add ProductType for Sacado expression templates

Update Sacado number types.

Default definitions for helper functions are now given irrespective of
whether deal.II is compiled with Trilinos or not. This assists in
generic programming.

Update Adol-C number types.

Default definitions for helper functions are now given irrespective of
whether deal.II is compiled with Adol-C or not. This assists in generic
programming.

Update ADNumberTraits

The addition of the scalar_type to the default definition for arithmetic
types increases the usefulness of this class for generic programming.

Ensure that numbers::NumberTraits works with AD numbers.

Merge pull request #6146 from bangerth/parallelize

Parallelize a few operations in the FE_Q_Base constructor.

Merge pull request #6227 from kronbichler/fix_transfinite_interpolation_signal

Fix signal handling of transfinite interpolation once cleared

Merge pull request #6226 from kronbichler/avoid_warning_jacobi

Avoid warning in computation of Jacobi polynomial roots

Fix signal handling of transfinite interpolation once cleared.

Merge pull request #6221 from masterleinad/fix_stp_22_mass

 Store the pressure mass matrix separately in step-22

Avoid warning in computation of Jacobi polynomial roots.

Merge pull request #6202 from kronbichler/issue_5667_mapping_cells

Convert data structures in MF::MappingInfo to a face-compatible variant

Merge pull request #6177 from kronbichler/jacobi_polynomial

New function for Jacobi polynomial evaluation and its roots

Rename CellType -> GeometryType.

Merge pull request #6182 from luca-heltai/clone-manifolds

Clone manifolds + std::unique_ptr in Tria

Adjust test output due to (more accurate) expression of quadrature points.

Adapt Wolfgang's approach

add test stokes computation

Add another test.

Add changelog.

Use Jacobi roots to simplify quadrature implementation.

Test Jacobi polynomial evaluation.

Use Jacobi polynomial roots for definition of Hermite-like interpolation rather than LAPACK.

Add user-visible implementation of Jacobi polynomial.

Convert data structures in MF::MappingInfo to a face-compatible variant.

Merge pull request #6155 from bangerth/unique-ptr

Convert ReadWriteVector to std::unique_ptr.

Store the pressure mass matrix separately in step-22

Add CG test using cuda

Merge pull request #6175 from bangerth/glossary

Add glossary entry on dimensions.

Adjust test output.

Reduce number of threads in tests.

Add glossary entry on dimensions.

While there, also update the glossary entry on concepts.

Merge pull request #3 from tjhei/pr6146

make sure creating a task will initialize the thread_limit

Fixed DA comments.

Fixed DA comments.

Fixed MK comments.

make sure creating a task will initialize the thread_limit

Merge pull request #6209 from masterleinad/fix_sparsity_pattern_docu

Fix documentation of SparsityPattern

Fix documentation of SparsityPattern

Merge pull request #6124 from bangerth/fix-vector-tools

Fix VectorTools::integrate_difference()

Merge pull request #6204 from masterleinad/macos_setup_astyle

Allow setup_astyle.sh to be used on macOS as well

Merge pull request #6062 from BenBrands/MRRR

ScaLAPACKMatrix: add eigensolver routines using MRRR algorithm

Fixed failing tests.

Added clone members to (deprecated) Boundary objects.

Make step-53 compatible with the new interface.

Changelog.

Make tria use std::unique_ptr<Manifold<dim,spacedim> >

Clone functions for OpenCASCADE objects.

Implement clone for each standard Manifold class.

Add clone method for Manifold and FlatManifold

Merge pull request #6191 from bangerth/doc-update-2

Clarify a comment in FiniteElement.

Merge pull request #6205 from davydden/doc/step-37_hanging_nodes

doc: mention Kelly estimator in step-37 extensions

doc: mention Kelly estimator in step-37 extensions

Clarify a comment in FiniteElement.

Merge pull request #6176 from masterleinad/cast_dynamic

Use dynamic_unique_cast in more places

Allow setup_astyle.sh to be used on macOS as well

Merge pull request #6190 from bangerth/doc-update

Extend documentation of contrib/utilities/setup_astyle.sh.

Merge pull request #6189 from bangerth/noreturn

Mark a couple of functions as '[[noreturn]]'.

Merge pull request #6203 from masterleinad/separate_step4

Guard blank line by HTML comment

Guard blank line by HTML comment

Merge pull request #6201 from masterleinad/separate_step4

Separate a note from 'The commented program'

Merge pull request #6198 from davydden/feature/zero_out_ghosts

make zero_out_ghosts() const

Separate a note from 'The commented program'

Merge pull request #6199 from tjhei/fix_changelog_entry2

fix changelog date format

Merge pull request #6195 from kronbichler/tensor_always_inline2

Use DEAL_II_ALWAYS_INLINE in SymmetricTensor