use beta_dot_n

take over changes from 17f331bb57

follow-up fixes

Apply suggestions from code review

Co-Authored-By: Wolfgang Bangerth <bangerth@colostate.edu>

update results

update step-12, rewrite introduction

FEInterfaceValues: new step-12

Merge pull request #8902 from peterrum/gridout-vtk-optional

Make output cells, faces and co-faces optional in GridOut::write_vtk

Merge pull request #8892 from masterleinad/remove_bind_5

Replace std::bind in documentation

Replace std::bind in documentation

Merge pull request #8947 from tjhei/free_mpi_comm

new MPI::free_communicator and DuplicatedCommunicator helper

Merge pull request #8949 from tjhei/doc_write_vtu_and_pvtu

doc: improve write_vtu_with_pvtu_record

Apply suggestions from code review

Merge pull request #8950 from bangerth/geometry

Provide a link to the geometry paper.

address comments

Provide a link to the geometry paper.

doc: improve write_vtu_with_pvtu_record

Merge pull request #8945 from dangars/trilinos_documentation

Remove unnecessary trilinos options

fix test

address comments

Update trilinos options

changelog

add DuplicatedCommunicator

add MPI::free_communicator function

Make output cells, faces and co-faces optional in GridOut::write_vtk

Merge pull request #8942 from bangerth/49

Update the results section of step-49.

Merge pull request #8899 from anates/arpack_solver_control

ArpackSolver sets number of iterations in SolverControl after finishing calculations

Update the results section of step-49.

Merge pull request #8492 from tjhei/step-49-cleanup

step-49: switch to vtu and add possible extensions

Merge pull request #8939 from tjhei/point_to_point_mpi_wait_fix

Fix missing MPI_Wait in compute_point_to_point_communication_pattern

Merge pull request #8940 from drwells/step-3-doxygen

Improve and fix some doxygen things in step-3.

Improve and fix some doxygen things in step-3.

- use CellAccessor::face_iterators()
- no space after function name
- add some more doxygen links
- fix a missing @endcode

Fix missing MPI_Wait in compute_point_to_point_communication_pattern

Remove the early return (we will just execute 0 MPI_Recv) as we forgot
to Wailall. Also add some error checking while I am here.

Merge pull request #8935 from tjhei/consensus_get_requesters_barrier

add a barrier to avoid MPI race in ConsensusAlgorithm

Merge pull request #8936 from tjhei/partitioner_64bit_overflow

avoid 64bit overflow in Partiioner::set_ghost_indices

avoid 64bit overflow in Partiioner::set_ghost_indices

We MPI::sum() a 32 bit value of the total number of ghost indices, which
might overflow. This is unlikely to be a problem unless you exactly have
2^32 ghost indices, but this is nevertheless a bug.

Merge pull request #8934 from bangerth/doc-4

Augment the description of CellId::to_string().

add a barrier to avoid MPI race in ConsensusAlgorithm

As discussed in #8929, messages exchanged in this function can be mixed
up if called twice in succesion. Add a Barrier to make sure this won't
happen.

Merge pull request #8930 from peterrum/consensus-fix

Fix ConsensusAlgorithm_NBX

Updated test outputs for failing tests

Indentation fix in changelog

Fix ConsensusAlgorithm_NBX

Merge pull request #8931 from masterleinad/fix_hp_n_boundary_dofs

Fix hp/n_boundary_dofs_01

Augment the description of CellId::to_string().

Merge pull request #8932 from tjhei/fix_error_message

add missing space to error message

add missing space to error message

Fix hp/n_boundary_dofs_01

Merge pull request #8891 from masterleinad/remove_bind_4

Remove std::bind from examples

Merge pull request #8924 from nfehn/digits

Refactoring of Utilities::needed_digits()

Merge pull request #8926 from masterleinad/replace_workstream_shared_ptr

Replace std::shared_ptr in WorkStream

Merge pull request #8928 from bangerth/doc-3

Be more explicit about the Copied argument to WorkStream::run().

Be more explicit about the Copied argument to WorkStream::run().

Replace std::shared_ptr in WorkStream

Merge pull request #8925 from masterleinad/document_empty_copier

Document usage of empty copiers in WorkStream

Use empty function object for copier

Document usage of empty copiers in WorkStream

Apply suggestions from code review

Co-Authored-By: Wolfgang Bangerth <bangerth@colostate.edu>

Update examples/step-13/step-13.cc

Co-Authored-By: Wolfgang Bangerth <bangerth@colostate.edu>

minor changes

entry doc/news/changes/minor

use Utilities::needed_digits() in write_vtu_with_pvtu_record()

refactor function Utilities::needed_digits()

Merge pull request #8909 from peterrum/matrixfree-face-iterator

Add get_face_iterator to MatrixFree

Merge pull request #8922 from bangerth/update

Minor code and documentation updates.

Merge pull request #8923 from bangerth/update-2

More minor updates.

Merge pull request #8904 from nfehn/master

Simplify code for writing vtu/pvtu output files in application programs

new function DataOutInterface::write_vtu_with_pvtu_record() to avoid reimplementing the same code again and again

Added changelog

Merge pull request #8916 from nfehn/torus

Extend GridGenerator::torus<3,3>() so that one can generate a torus segment

Merge pull request #8921 from bangerth/doc

Add an external reference.

Add get_face_iterator

Conflicts:
include/deal.II/matrix_free/matrix_free.templates.h

More minor updates.

Minor code and documentation updates.

Add an external reference.

Merge pull request #8910 from kronbichler/mf_unsupported_refinement_edges

Document unsupported MG refinement edges for matrix-free DG

Merge pull request #8919 from peterrum/matrixfree-get_level_mg_handler2

Replace level_mg_handler by mg_level

Replace level_mg_handler by mg_level

some renaming to make code more readable

Merge pull request #8917 from bangerth/doc

Use positive form for comments.

Use positive form for comments.

Merge pull request #8915 from peterrum/matrixfree-get_level_mg_handler

Save level_mg_handler inside of MatrixFree

add new test case

extend GridGenerator::torus<3,3>() so that one can generate an open torus with angle 0 < phi <= 2*pi

Save level_mg_handler inside of MatrixFree

Merge pull request #8913 from nfehn/torus

fix bug in GridGenerator::torus<3,3>()

fix bug in GridGenerator::torus<3,3>()

Merge pull request #8901 from dougshidong/master

Fix DoFHandler>::n_boundary_dofs() in issue #8897

Document unsupported MG refinement edges for matrix-free DG

Safety check for usable eigenvalues extended to non-symmetric matrices

Merge pull request #8908 from masterleinad/fix_typo_tensor

Fix another typo in tensor.h

Fix another typo in tensor.h

Merge pull request #8878 from dangars/complex_integrate_difference

Complex integrate_difference()

Merge pull request #8907 from peterrum/tensor_docu_fix

Fix docu in Tensor

Fix docu in Tensor

Merge pull request #8903 from kronbichler/doc_vectorized_array_pod

VectorizedArray: Update documentation POD -> StandardLayoutType

Update documentation about POD -> StandardLayoutType

Fix DoFHandler::n_boundary_dofs() in issue #8897

Only count locally owned dofs in the case of a parallel::distributed::Triangulation.

Use suggested syntax on cell iterator.

Co-Authored-By: Daniel Arndt <arndtd@ornl.gov>
Add test case for n_boundary_dofs in parallel

Fix n_boundary_dofs() for hp version.

Also implement suggested change

    Start 3212: dofs/n_boundary_dofs_01.mpirun=1.debug
1/8 Test # 3212: dofs/n_boundary_dofs_01.mpirun=1.debug .....   Passed    0.50 sec
    Start 3213: dofs/n_boundary_dofs_01.mpirun=1.release
2/8 Test # 3213: dofs/n_boundary_dofs_01.mpirun=1.release ...   Passed    0.49 sec
    Start 3214: dofs/n_boundary_dofs_01.mpirun=2.debug
3/8 Test # 3214: dofs/n_boundary_dofs_01.mpirun=2.debug .....   Passed    0.50 sec
    Start 3215: dofs/n_boundary_dofs_01.mpirun=2.release
4/8 Test # 3215: dofs/n_boundary_dofs_01.mpirun=2.release ...   Passed    0.51 sec
    Start 3216: dofs/n_boundary_dofs_02.debug
5/8 Test # 3216: dofs/n_boundary_dofs_02.debug ..............   Passed    0.51 sec
    Start 3217: dofs/n_boundary_dofs_02.release
6/8 Test # 3217: dofs/n_boundary_dofs_02.release ............   Passed    0.52 sec
    Start 3218: dofs/n_boundary_dofs_03.debug
7/8 Test # 3218: dofs/n_boundary_dofs_03.debug ..............   Passed    0.52 sec
    Start 3219: dofs/n_boundary_dofs_03.release
8/8 Test # 3219: dofs/n_boundary_dofs_03.release ............   Passed    0.54 sec

100% tests passed, 0 tests failed out of 8

Add hp n_boundary_dofs test.

Use unordered_set instead.
Fix a || to a && from switching the if-continue statement.

      Start 3212: dofs/n_boundary_dofs_01.mpirun=1.debug
 1/18 Test # 3212: dofs/n_boundary_dofs_01.mpirun=1.debug .....   Passed   51.27 sec
      Start 3213: dofs/n_boundary_dofs_01.mpirun=1.release
 2/18 Test # 3213: dofs/n_boundary_dofs_01.mpirun=1.release ...   Passed   17.03 sec
      Start 3214: dofs/n_boundary_dofs_01.mpirun=2.debug
 3/18 Test # 3214: dofs/n_boundary_dofs_01.mpirun=2.debug .....   Passed    1.90 sec
      Start 3215: dofs/n_boundary_dofs_01.mpirun=2.release
 4/18 Test # 3215: dofs/n_boundary_dofs_01.mpirun=2.release ...   Passed    1.45 sec
      Start 3216: dofs/n_boundary_dofs_02.debug
 5/18 Test # 3216: dofs/n_boundary_dofs_02.debug ..............   Passed   50.17 sec
      Start 3217: dofs/n_boundary_dofs_02.release
 6/18 Test # 3217: dofs/n_boundary_dofs_02.release ............   Passed   16.30 sec
      Start 3218: dofs/n_boundary_dofs_03.debug
 7/18 Test # 3218: dofs/n_boundary_dofs_03.debug ..............   Passed   50.67 sec
      Start 3219: dofs/n_boundary_dofs_03.release
 8/18 Test # 3219: dofs/n_boundary_dofs_03.release ............   Passed   16.71 sec
      Start 5498: hp/n_boundary_dofs.debug
 9/18 Test # 5498: hp/n_boundary_dofs.debug ...................   Passed   44.68 sec
      Start 5499: hp/n_boundary_dofs.release
10/18 Test # 5499: hp/n_boundary_dofs.release .................   Passed   11.83 sec
      Start 5500: hp/n_boundary_dofs_01.mpirun=1.debug
11/18 Test # 5500: hp/n_boundary_dofs_01.mpirun=1.debug .......   Passed   34.48 sec
      Start 5501: hp/n_boundary_dofs_01.mpirun=1.release
12/18 Test # 5501: hp/n_boundary_dofs_01.mpirun=1.release .....   Passed   12.46 sec
      Start 5502: hp/n_boundary_dofs_01.mpirun=2.debug
13/18 Test # 5502: hp/n_boundary_dofs_01.mpirun=2.debug .......   Passed    1.75 sec
      Start 5503: hp/n_boundary_dofs_01.mpirun=2.release
14/18 Test # 5503: hp/n_boundary_dofs_01.mpirun=2.release .....   Passed    1.36 sec
      Start 5504: hp/n_boundary_dofs_02.debug
15/18 Test # 5504: hp/n_boundary_dofs_02.debug ................   Passed   34.33 sec
      Start 5505: hp/n_boundary_dofs_02.release
16/18 Test # 5505: hp/n_boundary_dofs_02.release ..............   Passed   12.25 sec
      Start 5506: hp/n_boundary_dofs_03.debug
17/18 Test # 5506: hp/n_boundary_dofs_03.debug ................   Passed   41.88 sec
      Start 5507: hp/n_boundary_dofs_03.release
18/18 Test # 5507: hp/n_boundary_dofs_03.release ..............   Passed   15.45 sec

100% tests passed, 0 tests failed out of 18

Indent

Simple test added, including test output

Merge pull request #8900 from peterrum/vectorizedarray-iterator

Introduce VectorizedArrayBase and VectorizedArrayIterator