inline DoFRenumbering::downstream to fix compilation issue with intel compilers; also remove deprecated MGDoFHandler variant in the process

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31766 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Put the -no-vec declaration into the right file :->

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31765 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test requires trilinos

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31764 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Resolve another oddity in how GCC and ICC output __PRETTY_FUNCTION__, this time when virtual functions are involved.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31763 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

First part of documenting the switch to WorkStream in GradientEstimation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31762 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

rework r31759 to my liking and fix a few more places

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31761 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

disable vectorization on intel compilers because they produce wrong code. See issue 156.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31760 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Replace "rand" by "myrand" in the testsuite to avoid a name clash

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31759 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bugfix: create ${TARGET}.signed dummy file in CMakeFiles directory

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31758 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify code slightly.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31756 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Removed comments after confirming changes work

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31755 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Document the third kind of WorkStream::run.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31754 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix compiler warning

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31753 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add test for issue 154 fixed in r31734

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31752 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix clang warnings

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31751 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove one clang compiler warning

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31750 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31749 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

check in proposed change in issue 148 to get rid of crashes in the tests. Not sure if the logic is correct.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31748 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

run test with one proc too, because it crashes on some machines

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31747 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix exception specification for rand() in tests

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31746 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

write own rand() function for the test suite because cygwin has a different implementation. I hope this will not break any test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31745 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

reference tests.h in test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31744 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Testsuite: Bugfix: Fix a typo that prevented all tests under ./deal.II/tests from being set up

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31743 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Documentation update

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31741 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Forbid to use ninja together with icc

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31740 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Testsuite: Some more refactoring and cleanup

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31739 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

clean up and simplify recent changes in exceptions.cc

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31738 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Finally fixed the bug in make_zero_boundary_constraints (Issue 154)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31734 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert false correction.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31733 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed bug regarding the use of ComponentMask in make_zero_boundary_constraints.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31732 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bufix: Well, it is a good idea to not destroy formerly working functionality

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31731 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Testsuite: Remove the dependency of setup_tests on a built library, let's see...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31730 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Testsuite: Refactor testsuite setup into its own project.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31728 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Link to the CS&D paper.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31726 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor indentation changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31725 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Cleanup ExceptionBase: Inherit from std::exception and do the c_string handling directly to avoid the const_casts

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31723 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Introduce IterationNumberControl to perform a fixed number of solver steps without throwing an exception.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31722 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

defer backtrace lookup in dealii::Exception for performance reasons

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31720 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Bugfix: Only run "make sign" if it is necessary

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31718 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Provide a possibility to automatically sign generated executables on Mac OSX

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31717 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Documentation: Add a small section about how to create a new category

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31716 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

replace include of dof_handler_policy.h in dof_handler.h by forward declaration

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31713 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test only works if you have petsc and trilinos

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31712 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

rework r31702

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31711 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix r31695, explicit instantiations are not needed after all

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31710 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

rewrap comments (phew)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31709 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31708 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Testsuite: Bugfix: Allow to run the testsuite script from within an insource build

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31707 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bug fix.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31706 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide more context in the documentation and link to a paper in preparation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31705 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

do not use typeid internally because this is broken on intel 13+. Instead: emulate this in the DoFHandlerPolicy classes. Also update test output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31702 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add missing instantiations (for intel)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31701 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test: add whitespace to output so that numdiff can work, output more digits

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31700 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

loosen tolerance in test to make it pass

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31699 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

output more digits in test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31698 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

output more digits in test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31697 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

mention changes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31696 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix template instantiations for GridGenerator::parallelogram, do not pass array as a reference

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31695 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Augment documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31694 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix the failure of find_cell_10a by implementing a better stopping criterion for the Newton iteration, using a variable metric Newton method.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31693 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix typo

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31692 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Also run test in optimized mode.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31691 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix one testcase, see https://code.google.com/p/dealii/issues/detail?id=134 . Since we are having so much trouble with this function, I also left my debug code in there, guarded with \#ifdef DEBUG_NO_NORMAL_FLUX. Adjust testcase.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31690 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix one testcase, see https://code.google.com/p/dealii/issues/detail?id=134 . Since we are having so much trouble with this function, I also left my debug code in there, guarded with \#ifdef DEBUG_NO_NORMAL_FLUX.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31689 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix non-MPI case

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31688 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix description

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31687 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed: FETools::inteprolation_difference was not working with TrilinosWrappers::MPI::Vectors with ghost entries, also, TrilinosWrappers::VectorBase has a get_mpi_communicator method now.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31686 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a note in a comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31684 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Testsuite: Fix data_out_stack_0?

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31683 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bugfix: Define FP_USE_THREAD_SAFE_EVAL in case of enabled multithreading support.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31682 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set missing svn:keywords property on a bunch of files

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31681 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a lot of stray $Id$s

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31680 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix error message.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31679 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor language fix.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31678 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update comment

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31677 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31676 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

assert that we have a enough fe components in compute_no_normal_flux_constraints

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31675 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add failing test for no_flux

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31674 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add PETSC_WITH_COMPLEX to Config.sample

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31673 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Testsuite: Fix the issue with binary outputs and data_out_base_dx

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31672 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Split a function in hopes to alleviate linker errors with ICC.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31671 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Testsuite: Also accept numerical values that have a relative error of less than 1.e-8 (but an absolute error of more than 1.e-6)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31670 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Bugfix: Do not use >/dev/null on native Windows targets

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31669 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Remove debug output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31668 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Replace the expensive computation of a set intersection with the cheap computation whether two sets have a nonempty intersection at all. We don't need the intersection anyway.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31667 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

CMake: Print TEST_DIR during configuration so that one actually has a clue which TEST_DIR was processed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31666 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fixed output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31665 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add missing initialization

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31664 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust the output of some tests so that we get below the threshold of numdiff.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31663 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Initialize a variable to avoid a testsuite failure with ICC 14.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31662 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid instantiating FE_FaceQ and FE_FaceP in 1d.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31661 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Match function instantiation to the original declaration in hopes to
make ICC 14 happy. Unfortunately, this is not the case.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31660 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide a missing template instantiation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31659 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Augment an exception message. This doesn't solve the problem, but it
gets us closer to it...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31658 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a harmless macro PETSC_WITH_COMPLEX.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31653 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Put in a missing word that was bugging me...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31652 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a reasonable (unfinished) petsc test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31651 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add requested output to slepc quicktest.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31650 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

No need to say
  class.template function ()
when no explicit template arguments are provided.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31649 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide some more information about auxiliary compiler in detailed.log

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@31648 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d