Merge pull request #5527 from masterleinad/fix_mpi_some_to_some_02

Fix base/mpi_some_to_some_02

Fix mpi_some_to_some_02

Merge pull request #5521 from masterleinad/restrict_metis_test

Change partitioner for mpi/subdomain_ids_parallel_08

Use different partitioner in mpi/mpi/subdomain_ids_parallel_08

Merge pull request #5491 from bangerth/complex-test

Change the boundary value type to match the vector type.

Merge pull request #5524 from masterleinad/fix_communicate_active_fe_indices

Fix communicate_active_fe_indices again

Add changelog.

Fix communicate_active_vertice_fe_indices again

Merge pull request #5520 from bangerth/changelogs

Make changelogs look more uniform.

Merge pull request #5519 from bangerth/doc-update

Minor doc updates.

Minor doc updates.

Make changelogs look more uniform.

Merge pull request #5511 from masterleinad/restrict_arpack_tests

Restrict ARPACK tests to UMFPACK support

Merge pull request #5509 from luca-heltai/test-utilities

Added random_value and random_point to tests.h

Be more pedantic with static_cast (now works also for std::complex).

Merge pull request #5518 from masterleinad/fix_communicate_active_fe_indices

Fix sharedtria/communicate_active_fe_indices

Merge pull request #5508 from jppelteret/ad-update_run_testsuite

Update script that runs the testsuite

Merge pull request #5516 from tjhei/tests_avoid_metis

Tests: avoid using metis in tests using shared tria

Tests: avoid using metis in tests using shared tria

This is because maintenance of 4 output files is a nightmare

Fix sharedtria/communicate_active_fe_indices

Fixed Denis' comments.

Added random_value and random_point to tests.h

Merge pull request #5517 from jppelteret/ad-doxygen_settings

Update doxygen options to include Adol-C

Update doxygen options to include Adol-C

Merge pull request #5501 from masterleinad/bump_trilinos_version

Bump required Trilinos version to 12.4.2

Bump required Trilinos version to 12.4

Restrict ARPACK tests to UMFPACK support

Merge pull request #5458 from GivAlz/new_guess_bbox

Added GridTools::guess_point_owner and test

Update script that runs the testsuite

Merge pull request #5482 from jppelteret/ad-sacado_product_type

 Remove redundant specializations of scalar_product for Sacado numbers

Merge pull request #5436 from tcclevenger/distribute_dofs_shared

Change sharedtria dof distribution to match distributed tria

Merge pull request #5502 from luca-heltai/some-to-some-all-gather

New some_to_some and all_gather functions.

Merge pull request #5507 from kronbichler/fix_spherical_manifold_intermediate

Fix get_intermediate_point in spherical manifold for particular point

Added GridTools::guess_point_owner and test

Merge pull request #5493 from gassmoeller/fix_particle_handler_bug

Fix ghost particle bug

Removed one output that requires MPILogInitAll in serial.

Merge pull request #5468 from GivAlz/improve_computeptloc

Improving and fixing GridTools::compute_point_locations

Added tests for serial, and one more complex test.

Add test.

Fix SphericalManifold::get_intermediate_point for particular point combination.

Merge pull request #5503 from cpraveen/convert-support-dof

Add convert_generalized_support_point_values_to_dof_values in FE_FaceQ and FE_TraceQ

Fixed serial case.

Addressed Denis' comments.

Merge pull request #5504 from kronbichler/fix_convergence_table

Fix convergence rates with 64 bit integer key column

Changelog.

Add test.

Fix TableEntry for unsigned long long int.

Renamed tests to be more descriptive.

some_to_some and all_gather.

Add entry in news

Indent using astyle 2.04

Fix indentation

Merge pull request #5500 from luca-heltai/pack_unpack

Utilities::pack and unpack

Fix comment

Add convert_generalized_support_point_values_to_dof_values

This function is missing for FE_FaceQ and FE_TraceQ which is now
implemented by copying from FE_DGQ.

See https://github.com/dealii/dealii/issues/5449

Added support for tuple serialization in Utilities.

Added pack/unpack to Utilities.

Merge pull request #5489 from o-sutton/fix_adaptation_bad_access

Fix EXC_BAD_ACCESS occurring when marking all elements for refinement or coarsening

Merge pull request #5495 from masterleinad/remove_unused_typedefs

Remove unused typedefs

Remove unused typedefs

Fix ghost particle bug

Add a test to ensure that refine_and_coarsen_fixed_number behaves as expected when either top_fraction or bottom_fraction are set to 1.0.

Add test.

Change the boundary value type to match the vector type.

Merge pull request #5488 from masterleinad/avoid_scoped_lock_warning

Avoid warning about unused ScopedLock for DEAL_II_WITH_THREADS=OFF

Add to minor news

Update grid_refinement.cc

Fix indentation

Fix EXC_BAD_ACCESS occurring when marking all elements for refinement or coarsening using refine_and_coarsen_fixed_number.

Avoid warning about unused ScopedLock for DEAL_II_WITH_THREADS=OFF

Merge pull request #5484 from davydden/bug/missing_instantiations_find_closest_vertex_of_cell

fix missing instantiation of find_closest_vertex_of_cell()

Merge pull request #5485 from masterleinad/fix_bounding_box_warning

Fix warning in base/bounding_box.cc

Fix warning in base/bounding_box.cc

fix missing instantiation of find_closest_vertex_of_cell()

Merge pull request #5479 from masterleinad/array_view_2

Introduce ArrayView::data() and use where appropriate

Remove redundant specializations of scalar_product for Sacado numbers

Change the temporary type for a scalar_product function.

Merge pull request #5481 from jppelteret/ad-changelogs_01

Add changelogs related to newly implemented AD number functionality.

Add changelogs related to newly implemented AD number functionality.

Changelog entry

Introduce ArrayView::data() and use where appropriate

Merge pull request #5476 from masterleinad/instantiate_compute_interpolation_to_quadrature_points_matrix

Instantiate compute_interpolation_to/from_quadrature_points_matrix

Merge pull request #5125 from gassmoeller/add_particle_handler

Add particle handler

Instantiate compute_interpolation_to/from_quadrature_points_matrix also for dim!=spacedim

Merge pull request #5473 from jppelteret/ad-math_headers

Add math headers for AD numbers

Merge pull request #5474 from jppelteret/ad-fe_values

Add support for AD calculations to FEValues functions

Merge pull request #5117 from GivAlz/LocallyOwnedBBox

Compute bounding boxes approximating cells with a property (adding in grid_tools)

Make serial case compile. Disable case without p4est.

Test to show that a zero-valued function can have non-zero derivatives.

Remove unnecessary ProductTypes and std::decay in FEValues functions

With the current functionality my application of these two features in
the FEValues function is now overly defensive. So this effectively
reverts some of the changes made in #4951, as #4893 makes some use of
ProductType unnecessary and #5251 ensures compatible conversions between
numbers of all CV qualifications.

Add support for AD calculations to FEValues functions

When using AD to automatically compute the linearisation of a residual, one cannot a-priori assume no sensitivity with respect to zero-valued degrees-of-freedom. This commit ensures that this calculation shortcut is not taken for AD numbers.

Remove strict inclusion guards in unified AD header

Add Sacado math header

This adds some missing fundamental math functions for the supported
Sacado numbers.

Add Adol-C math header

This imports the Adol-C math operations into standard namespace. It
gives us the ability to use them (e.g. sqrt) within the Tensor class,
and it also allows the user to write generic code and switch between AD
number types.

Merge pull request #5470 from tjhei/petsc_lu_doc2

update PETSc PreconditionLU documentation, take 2

Merge pull request #5410 from kronbichler/improve_performance_transfinite

Performance improvement for transfinite interpolation manifold.

Merge pull request #5392 from jppelteret/ad-numbers_and_type_traits

 Implement type traits and helper classes for AD numbers

Merge pull request #5471 from masterleinad/avoid_ub

Guard some calls to memcpy, memset and memmove to avoid undefined behavior

Clean up code, fix comments by David.

Add tests for number traits classes: Sacado

Add tests for number traits classes: Adol-C