Update to deal.II 9.1: Linear_Elastic_Active_Skeletal_Muscle_Model

Update to deal.II 9.1: goal_oriented_elastoplasticity

Update to deal.II 9.1: ElastoplasticTorsion

Update to deal.II 9.1: Distributed_LDG_Method

Add IDE related files to .gitignore

Update to deal.II 9.1: Ceres

Add build folders to .gitignore

Update to deal.II 9.1: cdr

Document code maintenance procedure

Merge pull request #75 from drwells/headers-2

Fix some #includes on noncompiled source files

Fix some #includes on noncompiled source files

Merge pull request #41 from bangerth/fix-elastoplastic

Do not make a variable 'static' in the elastoplastic code gallery.

Merge pull request #61 from bangerth/depr

Avoid deprecated stuff.

Merge pull request #74 from drwells/fix-virtual-warnings

Fix virtual warnings

Merge pull request #73 from drwells/cleanup-removed-features

Cleanup removed features

cleanup whitespace

Remove a pessimizing move.

Also a GCC warning.

Add some virtual dtors.

GCC warns about this since the class has a virtual function.

Avoid using DataOut::active_cell_iterator.

This was recently removed from deal.II.

Remove #includes of headers removed in 9.2.

Merge pull request #70 from bangerth/corrections

Minor corrections to a recent code gallery addition

Merge pull request #71 from bangerth/ref

Fix a wrong glossary reference.

Fix a wrong glossary reference.

Use correct latex markup.

Reduce the number of tutorials this program 'depends on'.

Merge pull request #67 from tjhei/doxygen_fix

fix doxygen warning

Merge pull request #32 from Jie-Cheng/time-dependent-navier-stokes

Time-dependent Navier-Stokes

remove warning

fix cmake config

Merge pull request #65 from krishnakumarg1984/tutorial_dag_fix

cleanup tutorial DAG for couple of code-gallery programs

cleanup tutorial DAG for coupel of code-gallery programs

Merge pull request #64 from bangerth/fix

Fix a bug in the Metropolis-Hastings solver.

Simplify the code slightly.

Adjust the number of samples to be computed.

Adjust the proposal distribution to get a particular acceptance ratio.

Pad output file names to a uniform length appropriate for unsigned integers.

Increase the precision of the output.

Augment documentation.

Fix a bug in the Metropolis-Hastings solver.

Avoid deprecated stuff.

Merge pull request #60 from jppelteret/Magneto_Active_Polymers_Book-01

Add placeholder for Magneto-active polymers book

Add placeholder for Magneto-active polymers book

Merge pull request #58 from tamiko/update_to_9.1-4

ElastoplasticTorsion: Update to 9.1

Merge pull request #56 from tamiko/update_to_9.1-2

CeresFE: Update to 9.1

Merge pull request #57 from tamiko/update_to_9.1-3

Distributed_LDG_Method: Update to 9.1

Merge pull request #59 from tamiko/update_to_9.1-5

elastoplasticity: Update to 9.1

Merge pull request #55 from tamiko/update_to_9.1

cdr: Update to 9.1

update FunctionMap

Use AffineConstraints<double>

Update FunctionMap

use AffineConstraints<double>

use AffineConstraints<double>

update FunctionMap

use AffineConstraints<double>

remove obsolete header file

use affine_constraints.h

cdr: Do not use deprecated FunctionMap type

cdr: use affine_constraints.h

cdr: Use AffineConstraints<double>

Merge pull request #54 from bangerth/update

Update the MCMC-Laplace Readme.md file.

Update the MCMC-Laplace Readme.md file.

Merge pull request #52 from bangerth/mcmc-laplace

Add a code that solves a Bayesian inverse problem

Require deal.II 9.1.

Tabulate the exact measurement values, rather than compute them on the fly.

Use the correct quadrature formula order.

Update an outdated program name.

Make all but one of the changes requested by Timo. They are all no-ops
-- the output is the exact same as before.

Merge pull request #53 from bangerth/language

Fix a language issue.

Fix a language issue.

Write the documentation.

Write the program that samples from the posterior probability.

Merge pull request #51 from bangerth/update-goal-oriented

Update the readme.md file of a code gallery code.

Update readme.md.

Merge pull request #45 from tamiko/ceres_fixes

Ceres: Fix CMakeLists.txt, add libconfig dependency

add library variant

Put verbose deal.II error message back in place

Update docs

reindent

Fix Readme.md

Make Ceres compile without warnings

Ceres: Fix CMakeLists.txt, add libconfig dependency

Merge pull request #48 from masterleinad/fix_gcc_9_deprecations

Avoid using the deprecated functions

Avoid using the deprecated functions

Bump the required deal.II version to 9.0

Parallelize the code

Update ReadMe.md

Time-dependent Navier-Stokes

Merge pull request #44 from jppelteret/CQSFS_elas_03

Update the readme file of the cook membrane example.

Update the readme file of the cook membrane example.

Merge pull request #40 from masterleinad/indenting

Apply indenting script

Apply indenting script

Merge pull request #43 from jppelteret/CQSFS_elas_update_02

Use function from Physics module instead of hardcoded equivalent

Remove obsolete StandardTensors class from Cook membrane problem

Use function from Physics module instead of hardcoded equivalent

Since the addition of fixes to the AD number support, all of the functions in the Physics module now work with all of our supported AD number types. Previously, this line would not compile for nested Sacado Rad-DFad types.

Merge pull request #42 from bangerth/minor-edits

Minor edits to grammar and formulas.

Minor edits to grammar and formulas.

Do not make a variable 'static' in the elastoplastic code gallery.

Static variables are only initialized once at the beginning of the run.
Here, the value of a variable depends on a function argument, and so
it will only be computed based on the argument passed to the function
*the first time around*, and will never be updated again in later calls.
This is almost certainly not the desired behavior.

Merge pull request #39 from masterleinad/fix_code_gallery

Fix compiler errors and warnings

Fix two_phase_flow