Merge pull request #15497 from tamiko/bob/fix_test_21

Test simplex/compute_point_locations_01: add output variant

Merge pull request #15491 from tamiko/fix_test_18

Test numerics/nonlinear_solver_selector_03: add ouput variant

Test simplex/compute_point_locations_01: add output variant

With clang-16 libc++ we get a different order of quadrature points.
Verified manually that - apart from the order - all output quadrature
points match.

Test numerics/nonlinear_solver_selector_03: add ouput variant

Add an output variant for the case when deal.II is configured with PETSc
support but without Trilinos support.

Merge pull request #15488 from tamiko/fix_test_17

Test: cgal/cgal_intersect_simplices_2d_3d: restrict to CGAL >= 5.5.0

Merge pull request #15487 from tamiko/fix_test_16

Test mpi/p4est_bug_01: remove test

Test: cgal/cgal_intersect_simplices_2d_3d: restrict to CGAL >= 5.5.0

Test mpi/p4est_bug_01: remove test

This test needs an external p4est library built with debug symbols,
otherwise it "fails" because we do not error out while running the test
"expect=run".

Let's remove this test for now.

The long standing bug it documents is reported in
  https://github.com/dealii/dealii/issues/7428

See also
  https://github.com/dealii/dealii/issues/9047

Merge pull request #15486 from kronbichler/test_robustness2

MatrixFree inverse mass matrix: Make tests more robust

Merge pull request #15485 from kronbichler/output_variants

Add two output variants for tests writing p4est vtk output

Make tests more robust

Add two output variants for tests writing p4est vtk output

Merge pull request #15481 from tjhei/kinsol-warning

fix kinsol unused lambda capture warning

Merge pull request #15482 from tjhei/unused-var

fix unused variable warning

fix kinsol unused lambda capture warning

fix unused variable warning

Merge pull request #15474 from luca-heltai/stefanozampini/fp-trap

Fixes for FPE and older versions of PETSc

Merge pull request #15477 from tamiko/fix_test_15

Test fe/fe_enriched_color_07: do not run debug variant

Merge pull request #15475 from tamiko/restrict_scalapack_test_variants

Test scalapack/*: restrict all scalapack tests to less than 10 mpi ranks

Merge pull request #15473 from tamiko/fix_test_14

Test mpi/trilinos_step-27: add output variant

Merge pull request #15472 from tamiko/fix_test_13

Test distributed_grids/checkpointing_03: do not run debug variant

Merge pull request #15465 from bangerth/kokkos

Filter out --help from argv when initializing Kokkos

Merge pull request #15471 from tamiko/fix_la_test_02

Test lac/vector_memory_02: add output variant

Merge pull request #15470 from tamiko/fix_la_test

Test: lac/linear_operator_10: disable floating point exceptions

Merge pull request #15469 from tamiko/fix_grid_tools_cache_tests

Test grid/grid_tools_cache_{04,06,08,09}: add output variants

Merge pull request #15468 from tamiko/fix_test_12

Test grid/grid_generator_pipe_junction: add output variant

Merge pull request #15467 from tamiko/fix_cgal_test_02

Test cgal/cgal_triangulation_05: add test variant for clang-16, libc++

Merge pull request #15466 from tamiko/fix_cgal_test

Test cgal/cgal_remesh_surface: disable floating point exceptions

Test fe/fe_enriched_color_07: do not run debug variant

This test is massive (a whopping 2000 lines of code) and regularly times
out on different regression tester variants. Let's restrict it to run in
release mode only.

Test scalapack/*: restrict all scalapack tests to less than 10 mpi ranks

Let us restrict the maximal concurrency of scalapack tests to less than
10 MPI ranks:

 - The purpose of these tests is to test our interfaces to scalapack and
   not whether scalapack functions properly for high(er) MPI
   concurrency. As such testing a few variants with a low number of MPI
   ranks is enough.

 - This cuts down the number of tests in our testsuite that have a
   concurrency of 10 or more from around 225 to around 190.

   The issue with these tests is the fact that we have to block off
   parallel slots in the ctest run equal to the number of MPI ranks.
   Meaning the more tests we have that have a high number of MPI ranks
   the less optimal the scheduling in ctest.

Test mpi/trilinos_step-27: add output variant

With clang and libc++ I get a slightly different adaptive refinement.
Thus add an output variant.

Disable FPE trapping in some tests with older versions of PETSc

Test distributed_grids/checkpointing_03: do not run debug variant

With gcc-13 in debug mode this test can takeup to 10 minutes to
complete. Thus, restict it to release mode where it only takes a couple
of seconds.

Test lac/vector_memory_02: add output variant

Fix warning

catching polymorphic type ‘class dealii::StandardExceptions::ExcFunctionNotProvided’ by value [-Wcatch-value=]

alternative outputs for MACOSX

Some versions of PETSc do not apply Shift if zero!

Test: lac/linear_operator_10: disable floating point exceptions

Test grid/grid_tools_cache_09: add output variants

Test grid/grid_tools_cache_08: add output variant

Test cgal/cgal_remesh_surface: disable floating point exceptions

Test grid/grid_tools_cache_06: add output variant

Test grid/grid_tools_cache_04: add output variant

Test grid/grid_generator_pipe_junction: add output variant

Test cgal/cgal_triangulation_05: add test variant for clang-16, libc++

Use a range-based for loop.

Filter out --help from Kokkos flags.

Minor clean-up to the Kokkos initialization.

Merge pull request #15461 from tamiko/fix_distributed_grids_tests

Test distributed_grids/3d_refinement_08: add output variants

Merge pull request #15462 from tamiko/fix_cgal_test_02

Test cgal/cgal_triangulation_06: disable floating point exceptions

Test distributed_grids/3d_refinement_08: add output variant

Merge pull request #15460 from bangerth/test-99

Add output variant.

Test cgal/cgal_triangulation_06: disable floating point exceptions

Otherwise this test might trigger a spurious floating point exception
depending on the CGAL library version being used.

Add output variant.

Merge pull request #15458 from bangerth/symengine

Revert a change that breaks compilation.

Merge pull request #15454 from bangerth/77-4

Advertise NonlinearSolverSelector in step-77.

Merge pull request #15370 from bangerth/test-70

Add a test for step-70.

Merge pull request #15455 from tamiko/add_mailmap_entry

add mailmap entry

Revert a change that breaks compilation.

Merge pull request #15450 from tamiko/fix_nox_exception

NOX: catch std::runtime_error instead of char* for Trilinos 14.2.0 onwards

add mailmap entry

Advertise NonlinearSolverSelector in step-77.

Remove brittle logic that depends on directory names.

Merge pull request #15452 from kronbichler/fix_mf_diagonal

Fix invalid data access in MatrixFreeTools::compute_diagonal

Merge pull request #15448 from tamiko/fix_cgal_test

Test cgal/cgal_surface_mesh_02: disable floating point exceptions

Update include/deal.II/trilinos/nox.templates.h

Co-authored-by: Martin Kronbichler <martin.kronbichler@uni-a.de>

Merge pull request #15451 from kronbichler/fix_invalid_access_dof_accessor

Fix invalid memory access of DoFAccessorImplementation

Update include/deal.II/trilinos/nox.templates.h

Co-authored-by: Martin Kronbichler <martin.kronbichler@uni-a.de>

Merge pull request #15434 from drwells/examples-9.5

Examples 9.5

Merge pull request #15410 from bangerth/77-2

Discuss replacing KINSOL by SNES or NOX in step-77.

Merge pull request #15429 from tamiko/fix_gcc_13_warnings

CGAL: fix some bogus warnings with gcc-13

Merge pull request #15446 from tamiko/fix_petsc_tests

lac/parpack_solver: add missing compress() operation

Merge pull request #15447 from tamiko/fix_hdf5_test

Test base/hdf5_0{3,5}.mpirun={1,4}: do not compare test output

Merge pull request #15449 from tamiko/fix_test_properly

Test numerics/nonlinear_solver_selector_03: use check_solver_within_range macro

Fix invalid data access in MatrixFreeTools::compute_diagonal

Fix invalid memory access of DoFAccessorImplementation

NOX: catch std::runtime_error instead of char* for Trilinos 4.2.0 onwards

Merge pull request #15442 from tjhei/fix-step-57-convergence

fix step-57 bilinear form

Test numerics/nonlinear_solver_selector_03: adjust test output

Test numerics/nonlinear_solver_selector_03: use check_solver_within_range macro

Test cgal/cgal_surface_mesh_02: disable floating point exceptions

Otherwise this test might trigger a spurious floating point exception
depending on the CGAL library version being used.

Test base/hdf5_04.mpirun={1,4}: do not compare test output

We have been adding output variants for this test for years, but the
test output is simply not stable. I see different output depending on
debug or release configuration and chosen optimization level.

Let us stop here and only check whether the test runs correctly without
throwing an exception.

Test base/hdf5_03.mpirun={1,4}: do not compare test output

We have been adding output variants for this test for years, but the
test output is simply not stable. I see different output depending on
debug or release configuration and chosen optimization level.

Let us stop here and only check whether the test runs correctly without
throwing an exception.

lac/parpack_solver: add missing compress() operation

Merge pull request #15441 from peterrum/categorize_by_boundary_ids

MFTools::categorize_by_boundary_ids: use iterator

Merge pull request #15425 from tamiko/make_icc_19_happy

CMake: avoid adding ${DEAL_II_BUNDLED_INCLUDE_DIRS} to bundled targets

Merge pull request #15437 from bangerth/33

Fix step-33.

MFTools::categorize_by_boundary_ids: use iterator

fix step-57 bilinear form

Merge pull request #15435 from drwells/cuda-bundled-kokkos-warning

Merge pull request #15436 from bangerth/higher-order

CMake: fully qualify an include path

Add a better error message for Cuda + bundled Kokkos.

Fix step-33.

Warn about the use of higher order output when using Visit.

Merge pull request #15430 from kronbichler/fix_mf_bug

Fix bug in MatrixFree setup for FE_Nothing

Merge pull request #15431 from kronbichler/fix_bug_constraints

Fix bug in AffineConstraints::make_sorted_row_list

CMake: update a comment

Merge pull request #15423 from kronbichler/spell_set_up_2

Fix a few more 'set up'

Bundled: avoid warnings in bundled boost

set -Wno-deprecated-builtins and -Wno-deprecated-declarations