Merge pull request #8599 from bangerth/test

Add a test.

Merge pull request #8579 from peterrum/pdt_dofhandlerpolicy_generalization

Generalize DoFHandlerPolicy of p:d:t

Merge pull request #8604 from bangerth/21

Further edits to the introduction of step-21.

Merge pull request #8567 from peterrum/cellid-coarse-id

Modify the definition of CellId

Merge pull request #8608 from masterleinad/fix_tuple_h

Fix tuple.h

Further edits to the introduction of step-21.

Add a test.

Fix tuple.h

Merge pull request #8605 from masterleinad/fix_optional_optimization_tests

Replace boost::none by the std::optional default constructor

Merge pull request #8597 from GrahamBenHarper/graham_dev_polynomials_fe

Remove PolynomialType Template Argument from FE_PolyTensor

Generalize DoFHandlerPolicy of p:d:t

Modify the definition of CellId

Conflicts:
include/deal.II/grid/tria.h

Merge pull request #8586 from peterrum/cellid-getcoarsecellid

Return coarse-cell id by CellId

Merge pull request #8600 from peterrum/parallel_triangulationbase

Rename parallel::Triangulation to parallel::TriangulationBase

Merge pull request #8574 from bangerth/contract

Avoid a couple FP subtractions.

Remove template argument from FE_PolyTensor

Replace boost::none by the std::optional default constructor

Add get_coarse_cell_id to CellID

Conflicts:
include/deal.II/grid/tria.h

Merge pull request #8470 from omosebi1/saturationfix

Fix for Saturation Equation

Explains formulation of the saturation equation

Avoid a couple FP subtractions.

By noting that the existing code performs dim subtractions of
terms that are each a product of two values, we can reorder
things in such a way that we first accumulate the products
(which is a dot product) and then subtract the result. This
should allow for some vectorization.

The performance gain is almost certainly completely negligible,
but it makes the code marginally easier to read. The reason
why the indices involved here allow for this is because
'jacobian_pushed_forward_grads[i]' happens to be a
Tensor<3,dim> and 'shape_gradients[k][i]' is a
Tensor<1,dim>. So the types are so that their product
is in fact equivalent to the summation of the last index
as was written before.

Rename parallel::Triangulation to parallel::TriangulationBase

Merge pull request #8542 from maemar/generalized-subdivided-hyperL

Added the function GridGenerator::subdivided_hyper_L().

Merge pull request #8594 from masterleinad/cxx17optional

Replace boost::optional by std_cxx17::optional.

Merge pull request #8595 from rezarastak/add_inline

added inlined keyword to function definitions in quadrature_point_data.h

Merge pull request #8596 from bangerth/exscan

Use MPI_Exscan instead of MPI_Scan.

Merge pull request #8593 from peterrum/dofaccessor_mgdofindices_1D

Implement DoFAccessor::set/get_mg_dof_indices for 1D

Merge pull request #8585 from rezarastak/doxygen_forward_declarations

added #ifndef DOXYGEN to forward declarations

Merge pull request #8588 from GrahamBenHarper/graham_dev_polynomials_derived

Change Polynomial Classes to Derive from TensorPolynomialsBase

Use MPI_Exscan instead of MPI_Scan.

Merge pull request #8555 from marcfehling/hp-chainsofconstraints

New test: Chains of constraints on parallel hp-adaptive applications.

Replace boost::optional by std_cxx17::optional

Implement DoFAccessor::set_mg_dof_indices and get_mg_dof_indices for 1D

Change Polynomials classes to derive from TensorPolynomialsBase

added inlined keyword to function definitions in quadrature_point_data.h

Merge pull request #8572 from bangerth/cleanups

Make a few variables 'const'.

forward declatations removed from doxygen in all header files

Make a few variables 'const'.

Merge pull request #8569 from peterrum/cellaccessor_faceiterators

Add cell->face_iterators()

Merge pull request #8570 from melaniegerault/eccentric_hyper_shell

Add the links to the figures in the documentation of GridGenerator::eccentric_hyper_shell()

Merge pull request #8573 from melaniegerault/master

Exclude MacOS self-generated files from untracked files

added #ifndef DOXYGEN to some forward declarations

Merge pull request #8584 from masterleinad/fix_clang_tidy_symengine

Fix clang-tidy complaints for Symengine

Merge pull request #8580 from masterleinad/mf_additional_ref

Pass MatrixFree::AdditionalData by reference

Fix clang-tidy complaints for Symengine

.DS_Store etc. and .swp removed from untracked files

Merge pull request #8576 from peterrum/test_grid_accessor_01

Correct variable type in test grid/accessor_01

Merge pull request #8582 from simonsticko/fix_parallel_block_vector_warning

Update deprecated warning message in parallel_block_vector.h.

Update deprecated warning message in parallel_block_vector.h.

The warning suggests including a file which doesn't exist. Change the
message to the intended file.

Pass MatrixFree::AdditionalData by reference

Merge pull request #8513 from gassmoeller/change_pack_compression_to_default

Add compression options to pack and use default parameters

Merge pull request #8522 from gassmoeller/optimize_particle_packing

Implement pack_particles functions

Correct variable type in test grid/accessor_01

Add cell->face_iterators()

Update to documentation and downsized figures

Merge pull request #8528 from GrahamBenHarper/graham_dev_polynomials_base

Implement the PolynomialsBase classes

Move functions in anonymous namespace

Divided scenario into three separate ones.

Merge pull request #8430 from masterleinad/reduce_floating_point_division

Reduce floating-point division in operator/

New test: Chains of constraints on parallel hp-adaptive applications.

Added the links to the pictures in the documentation of GridGenerator::eccentric_hyper_shell()

Merge pull request #8526 from melaniegerault/eccentric_hyper_shell

Eccentric hyper shell

Implement the PolynomialsBase class

Figures for 2D and 3D grids plus edits on grid_generator.cc

Update source/grid/grid_generator.cc

Co-Authored-By: David Wells <drwells@email.unc.edu>

Add GridGenerator::eccentric_hyper_shell

Add an eccentric hyper shell geometry that is formed by two spheres
with different center points.

Add GridGenerator::eccentric_hyper_shell

Add an eccentric hyper shell geometry that is formed by two spheres
with different center points.

Merge pull request #8566 from dangars/full_matrix_doxygen

Fix doxygen documentation

Merge pull request #8568 from simonsticko/fix_git-hook_instructions

Update instructions on where to find the pre-commit git-hook.

Update instructions on where to find the pre-commit git-hook.

Merge pull request #8382 from fmilicchio/master

Checking if MPI is enabled to allow both Trilinos and PETSc.

Fix doxygen documentation

Use default compression for Utilities::pack

Merge pull request #8560 from bangerth/assert

Fix an assertion that was missing a semicolon.

forgot to indent

fixed typo, made h array, renamed variable

Merge pull request #8557 from bangerth/22

Update the description in step-8 that uses the new pictures.

Merge pull request #8539 from chronictectonic/step-8_figures

Improve resolution in step 8.

Update the description in step-8 that uses the new pictures.

Fix an assertion that was missing a semicolon.

Merge pull request #8561 from masterleinad/another_mailmap

Add another .mailmap entry

Add another .mailmap entry

Merge pull request #8519 from mjayadharan/grid_tools_debug

Grid tools debug

Merge pull request #8429 from marcfehling/pd-fetransfer

Parallel distributed: Communicate active_fe_indices after deserializa…

Merge pull request #8559 from bangerth/3

Minor update to step-3.

Merge pull request #8556 from bangerth/sticked

Fix a funny comment.

Correct indentation.

Merge pull request #8554 from bangerth/doc

Update a piece of documentation to use less jargon.

Merge pull request #8514 from User-zwj/step-2-dof-extension

Add extension to step2

Minor update to step-3.

Fix a funny comment.

Update a piece of documentation to use less jargon.

Merge pull request #8547 from kronbichler/fix_mf_ghosting

Fix bug in MatrixFree ghost exchange with faces and FE_Q

Adding function subdivided_hyper_L to GridGenerator.

Added changelog entry, replaced call to .at() with [] operator,
fixed lines breaks in documentation.

forgot to fix indentation

changed parameter order

updated log file and error message

Merge pull request #8551 from bangerth/doc

Update some documentation pieces.

Merge pull request #8479 from aggarwal-ashna/step4comments

step 4: minor documentation edits

Update some documentation pieces.

Merge pull request #8531 from masterleinad/cuda_warnings_always_inline

Avoid CUDA warnings related to DEAL_II_ALWAYS_INLINE

Merge pull request #8549 from drwells/local_branch

Add more citations to step-51.

Merge pull request #8521 from Rombur/matrix_free_atomic

Matrix free atomic