fixed TrilinosWrappers::VectorBase::swap()

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25668 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test TrilinosWrappers::Vector::swap() (test fails)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25667 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Untabify.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25666 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set a flag for the PGI C++ compiler that allows it to compile all but one file in debug mode.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25665 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add an include file that's necessary for the pgi compiler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25664 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Suppress output to the screen.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25663 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a couple other places where using FE_Nothing triggered assertions that weren't warranted here.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25661 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Using the SolutionTransfer class with hp::DoFHandler and on meshes where some cells are associated with a FE_Nothing element could result in an error.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25660 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Work around a problem where we now got into an if-branch that we
didn't want to get into.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25659 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Patch by Uwe Koecher: Avoid warnings in header files if -Wunused-parameters is given, for cases where parameters are only evaluated in Assert contexts and are thus unused in optimized mode.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25658 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Disable a bunch of warnings for MS Visual C++.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25657 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid a warning with gcc 4.7 (based on a patch by Uwe Koecher).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25656 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set svn properties.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25655 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix compilation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25654 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Correct output directory.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25653 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25652 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement a line search strategy to deal with cases where the nonlinear iteration in MappingQ1::transform_real_to_unit_cell does not converge. If the line search doesn't converge either, then throw an exception and assume that in fact this means that the point lies outside. Deal with this result in all of the places where we call the function.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25651 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix yet another bug in VectorTools::no_normal_flux when dealing with fluxes that are tangential to *two* adjacent faces. This can only possibly have worked before if these faces where parallel to at least one coordinate axes :-(

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25649 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clarify documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25648 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reduce it to one cell.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25647 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test, currently failing.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25646 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Typo fix.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25645 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a forward declaration apparently needed for MSVC.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25644 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove a few stray empty lines left over from the time when we replaced 'class' + 'static' functions with a 'namespace'.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25643 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a missing set of instantiations. Put more things under the template expander and order them in the same way as the declarations in the .h file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25642 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make it clear that the *result*, not just one operand, should be of
type char. I think otherwise the arithmetic is still performed in data
type int.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25641 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test to verify that indeed Trilinos bug 5609 is and remains fixed.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25640 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix bug pointed out by Saul Teukolsky and add submit_divergence function.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25639 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

step-38: fix compilation error with some compilers

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25638 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Patch by Jason Sheldon: Add some previously missing instantiations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25637 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More patches for MS Windows.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25636 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25635 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More changes by Bob Goodwin to make things compile with MS Visual C++.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25634 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Work around a problem with a zero-length array when dim==0. MSVC complains
about that. (Patch by Bob Goodwin.)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25633 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Second set of Microsoft Windows Visual C/C++ patches by Bob Goodwin.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25632 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Patches by Bob Goodwin: First set of changes for making things work with MS Visual C++.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25631 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Detect Cray C++.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25630 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

After testing, fix compilation for petsc-3.3

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25628 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Patch by Jason Sheldon: Add a missing instantiation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25627 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fig bug and augment FEEValuation. Rename MatrixFree::get_quadrature_formula into MatrixFree::get_quadrature. Fix typos in tutorial programs. Cleanup in matrix free class for hp case.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25626 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a misleading error message

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25625 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use vtk output. Add a TODO.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25624 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Default to debug mode.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25623 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use proper markup.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25622 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Comment on the refinement criterion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25621 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update after r25604.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25620 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update a couple test results after r25604.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25619 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25618 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add one more link.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25616 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add one picture.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25615 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Allow selecting something different than gfortran by setting the F77 environment variable.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25614 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update test results after recent changes to FE_DGQArbitraryNodes and PointValueHistory.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25613 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

added missing instantiations for DerivativeApproximation::approximate_derivative_tensor()

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25612 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide links from functions to a module.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25611 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a couple sentences.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25610 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add one more paragraph as suggested by Joerg.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25609 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a section.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25608 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Announce step-43.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25607 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Regenerate.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25606 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify the decision which iterator class to use somewhat. My hope is that this gives IDEs a better handle at what these iterator types actually are, though it doesn't seem to help much with Eclipse right now.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25605 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added support for FE_DGQArbitraryNodes in codimension one.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25604 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

clarify documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25603 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor simplifications.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25602 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reindent.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25601 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a missing include file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25600 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Finish step-15.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25599 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide more references to a recently added glossary entry on component masks.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25598 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement W1infty norm and seminorm in VectorTools::integrate_difference.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25597 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

The point seems to be outside the cell

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25596 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Patch by Michael Rapson: Major update of the PointValueHistory class.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25595 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25594 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add one large comment on adaptive meshes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25593 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25592 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert r25581 and leave a TODO discussing the issue.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25591 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor doc update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25590 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Correct documentation. Provide a glossary entry and link to it.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25589 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

step-42: fix deadlock with many CPUs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25588 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Slightly more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25587 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clarify the description of ConstraintMatrix::set_zero(..) in the documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25586 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update test results that started failing in r25578.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25585 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor formatting changes. Remove unnecessary code to set a vector to zero.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25584 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Break long comment lines.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25583 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Two more tests that currently fail.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25582 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Small improvement, but not the real deal yet.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25581 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clean up code: clearly separate input arguments and return values, rather than using one function argument as both an initial hint and the place where a value is returned.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25580 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25579 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Improve an algorithm in MappingQ::transform_real_to_unit_cell.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25578 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

update tests/bits/find_cell_6

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25577 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

One more test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25576 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25575 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement one function though it isn't quite enoughg to get the Triangulation<1,3> case going.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25574 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Extend test for dim=1, spacedim=3.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25573 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename test. Add a bunch more commentary and make output less verbose and more informative.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25572 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide more cross-references.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25571 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor doc edit.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25570 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Patch by Marco Engelhard: Add DataOutInterface::write_pvd_record.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25569 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify test.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25568 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix numerous bugs in GridTools::find_cells_adjacent_to_vertex.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25567 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More tests.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25566 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reindent two tests.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25565 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d