Merge pull request #11861 from bangerth/extern-template

Mark some classes as 'extern template'.

Merge pull request #11853 from konsim83/improve_docs

Improve docs (indentation targets)

Improve docs (indentation targets)

Merge pull request #11497 from Rombur/arborx

Add new BVH class

Merge pull request #11843 from bangerth/7

Some more additions to step-7.

Merge pull request #11850 from marcfehling/logical-or

Added Utilities::MPI::logical_or().

Added Utilities::MPI::logical_or().

Mark some classes as 'extern template'.

This saves a small amount of space and, possibly, compile time. Here
is a comparison of the cumulative size of all object files for the
debug and release configurations without and with the patch:

without patch:
debug   2,414,548,192
release   459,866,272

with patch:
debug    2,404,864,416
release    459,686,888

One can also compare the sizes of the .so files. I did this only for
the release library:

without patch: 459,866,272
with patch:    459,686,888

So it's a rather minor improvement. One could do this to a lot more
classes than just the two in this patch, though, if we wanted to go
that route.

Merge pull request #11856 from bangerth/decl

Add some missing forward declarations.

Merge pull request #11815 from peterrum/gc_interpolate_to_mg

Add MGTransferGlobalCoarsening::interpolate_to_mg()

Merge pull request #11847 from peterrum/distributed_compute_point_locations

Refactor GridTools::distributed_compute_point_locations()

Merge pull request #11852 from Rombur/config_doc

Update cmake documentation

Merge pull request #11854 from mschreter/fefaceevaluation_assert

Improve assert in FEFaceEvaluation

Add some missing forward declarations.

These are functions for which explicit specializations exist in the .cc file. The
standard says that we need to forward-declare them. In practice, it doesn't matter,
but it did matter for an experiment I'm currently running that explicitly makes use
of the fact that these functions are specialized.

Add MGTransferGlobalCoarsening::interpolate_to_mg()

Refactor GridTools::distributed_compute_point_locations()

Merge pull request #11401 from peterrum/mf_face_type

MatrixFree: introduce FaceToCellTopology::face_type

improve assert in FEFaceEvaluation

Reorder variable alphabetically

Update cmake documentation

Merge pull request #11849 from peterrum/use_get_communicator

Use get_communicator()

Merge pull request #11851 from bangerth/typedef

Replace 'typedef' by 'using' in the test suite.

Replace 'typedef' by 'using' in the test suite.

Merge pull request #11848 from peterrum/wedge_tangential_fix

Fix tangential vector of wedge

Use get_communicator()

MatrixFree: introduce FaceToCellTopology::face_type

Merge pull request #11810 from sebproell/arkode-single-step-solve

ARKode: single step solve option

Merge pull request #11841 from peterrum/test_15

Reduce number of procs from 15 to 10 in test

Fix tangential vector of wedge

Merge pull request #11842 from peterrum/distributed_compute_point_locations_sort

Sort return object of GridTools::distributed_compute_point_locations

Sort return object of GridTools::distributed_compute_point_locations

Some more additions to step-7.

Merge pull request #11840 from peterrum/ca_serial_fix

Fix ConsensusAlgorithms::Serial

Merge pull request #11812 from marcfehling/limit-degrees

Added DoFHandler::prepare_for_coarsening_and_refinement().

Merge pull request #11839 from peterrum/compute_point_to_point_communication_pattern

Enable Utilities::MPI::compute_point_to_point_communication_pattern for self communication

Merge pull request #11503 from peterrum/simplex_step31

Convert step-31 to a simplex test

Merge pull request #11838 from peterrum/ca_char_char

Instantiate ConsensusAlgorithms also for char/char

Optimize DoFHandler::prepare_for_coarsening_and_refinement().

Added DoFHandler::prepare_for_coarsening_and_refinement().

Merge pull request #11836 from kronbichler/avoid_deprecated

Avoid use of deprecated method

Reduce number of procs from 15 to 10 in test

Fix ConsensusAlgorithms::Serial

ARKode: single step solve option

Enable Utilities::MPI::compute_point_to_point_communication_pattern for self communication

Instantiate ConsensusAlgorithms also for char/char

Merge pull request #11837 from bangerth/ref

Fix a reference.

Fix a reference.

Merge pull request #11835 from peterrum/simplex_save_output

Save output if simplex tests have failed

Avoid use of deprecated method

Merge pull request #11798 from marcfehling/dh-clear

Bugfix: DoFHandler connects to Triangulation::Signals only in hp-mode.

Merge pull request #11792 from peterrum/mg_prolongate_and_add

Add MGTransferBase::prolongate_and_add()

Merge pull request #11747 from peterrum/ecl_gradient

ECL: enable gradients for structured meshes and FE_DGQ

Merge pull request #11302 from peterrum/mf_create_inner_face_subrange_hp_by_index_follow_up

MatrixFree: precompute subranges

Convert step-31 to a simplex test

ECL: enable gradients for structured meshes and FE_DGQ

Add MGTransferBase::prolongate_and_add

Merge pull request #11834 from marcfehling/doc-crossref

doxygen: stop unintentional cross-referencing of 'Function'.

Save output if simplex tests have failed

doxygen: stop unintentional cross-referencing of 'Function'.

Bugfix: DoFHandler connected to Triangulation::Signals only in hp-mode.

Merge pull request #11817 from bangerth/doc-87

Better document (and name) a ReferenceCell function.

Merge pull request #11822 from peterrum/tria_get_communicator

Add Triangulation/DoFHandler::get_communicator()

Merge pull request #11786 from luca-heltai/gmsh-api-doxygen

Make GMSH with API appear in doc.

Escape dollar signs.

Merge pull request #11827 from bangerth/doc-89

Minor doc update.

Merge pull request #11825 from bangerth/kinsol

Merge pull request #11819 from peterrum/simplex_get_restriction_matrix

Implement FE_SimplexPoly::get_restriction_matrix()

Add Triangulation/DoFHandler::get_communicator()

Merge pull request #11820 from peterrum/mgtwoleveltransfer_identity

MGTwoLevelTransfer: do not store identity matrix

Merge pull request #11831 from peterrum/gc_if

MGTwoLevelTransfer::restrict_and_add(): remove erroneous if-statement

Better document (and name) a ReferenceCell function.

Reorder the include files.

No longer support SUNDIALS versions before 3.0.

MGTwoLevelTransfer::restrict_and_add(): remove erroneous if-statement

MGTwoLevelTransfer: do not store identity matrix

Implement FE_SimplexPoly::get_restriction_matrix()

Merge pull request #11821 from peterrum/MGTransferGlobalCoarsening_print_remove

Remove MGTransferGlobalCoarsening::print()

Merge pull request #11818 from bangerth/7-2

Adapt the order of factors in an integral.

Merge pull request #11824 from bangerth/doc-88

Minor updates to the KINSOL documentation.

Merge pull request #11823 from bangerth/test

Remove a commented-out part of code.

Minor doc update.

Merge pull request #11759 from peterrum/mpi_reduce

Introduce Utilities::MPI::all_reduce()

Minor updates to the KINSOL documentation.

Remove a commented-out part of code.

Remove MGTransferGlobalCoarsening::print()

Merge pull request #11816 from bangerth/15

Make sure we live what we preach.

Adapt the order of factors in an integral.

Introduce Utilities::MPI::allreduce

Merge pull request #11814 from peterrum/DataAccessOnFaces_values_simplex

Fix DataAccessOnFaces::values for meshes containing non-hypercube cells

Make sure we live what we preach.

Merge pull request #11802 from peterrum/ComputeDiagonalHelper

Modularized MatrixFreeTools::compute_diagonal()

Merge pull request #11805 from peterrum/create_geometric_coarsening_sequence_single_level

Simplify code of create_geometric_coarsening_sequence()

Merge pull request #11813 from peterrum/simplex_renaming_2

Rename further simplex-related files

Fix DataAccessOnFaces::values for meshes containing non-hypercube cells

Rename further simplex-related files

Modularized MatrixFreeTools::compute_diagonal()

Merge pull request #11775 from bangerth/particles

Rename the write/update particle functions.

Merge pull request #11741 from marcfehling/shared-toggle

New class TemporarilyRestoreSubdomainIds.

Merge pull request #11809 from peterrum/remove_simplex_namespace

Remove Simplex namespace

Merge pull request #11808 from bangerth/ref-cell-32

Mark GeometryInfo as deprecated in favor of ReferenceCell.