Merge pull request #7340 from jppelteret/ad-helpers-tests_02

Add tests to check compilation of functions / classes with AD numbers

Merge pull request #6978 from jppelteret/ad-helpers_04

AD Helpers: Add helper for residual linearisation (cell-level)

Add tests to check compilation with AD numbers: Physics NS (part 3)

Physics::Transformations

Add tests to check compilation with AD numbers: Physics NS (part 2)

Physics::Elasticity::StandardTensors class

Add tests to check compilation with AD numbers: Physics NS (part 1)

Physics::Elasticity::Kinematics

Add tests to check compilation with AD numbers: SymmetricTensor class

Add tests to check compilation with AD numbers: Tensor class

Improve documentation for ADHelperEnergyFunctional

Improve documentation for ADHelperCellLevelBase

Improve an in-code comment

AD Helpers: Add helper for residual linearisation (cell-level)

Merge pull request #7336 from masterleinad/fix_step-16

Fix step-16

Fix step-16

Merge pull request #7329 from BenBrands/ScaLAPACK_use_string

use std::string instead of char *

Merge pull request #7283 from jppelteret/refactor_ad_drivers_helper_base_01

Refactor AD drivers helper base 01

Move special AD numbers related to taping from namespaces to structs.

Refer to #7117

Change an exception.

This commit corrects the spelling of an exception that refers to ADOL-C
(capitalised).

Rework implementation of taping within ADHelperBase.

This commit abstracts the notion of taping almost completely away from
the ADHelperBase class. The specifics of the taping process are now
fully contained within the driver classes (at the expense of having to
have some non-static interfaces to the driver classes). However, this
should better enable further extension to use other taped AD
implementations in the future.

Merge pull request #7334 from tamiko/update_changes_master

Update the changelog file for the release.

Update the changelog file for the release.

Merge pull request #7332 from tamiko/fix_changes

add a missing changes entry

add a missing changes entry

Merge pull request #7325 from bangerth/doc-update

Minor doc update to class parallel::CellWeights.

Minor doc update to class parallel::CellWeights.

use std::string instead of char *

Merge pull request #7301 from BenBrands/new_constructor_ScaLAPACK

add constructor for ScaLAPACKMatrix

Merge pull request #7320 from dsambit/fixAltivecCompilation

Fixes compilation issues when using altivec vectorization.

Merge pull request #7277 from bangerth/hp-test

Add a test for the parallel hp implementation.

Merge pull request #7284 from marcfehling/merge-domination

Introduced FECollection::find_most_face_dominating_fe_in_subset().

Merge pull request #7310 from davydden/feature/tmmult_pattern

add DynamicSparsityPattern::compute_Tmmult_pattern() by moving existi…

Merge pull request #7295 from luca-heltai/boost-rtree-wrapper

Boost rtree wrapper

add DynamicSparsityPattern::compute_Tmmult_pattern() by moving existing code

Merge pull request #7305 from marcfehling/cell-weights-shared

Make 'CellWeights' available for any 'p::Triangulation'.

Merge pull request #7322 from tamiko/fix_a_test_5

Tests: Fix race condition between mpi and non-mpi variants

Fixes compilation issue when using altivec vectorization.

Merge pull request #7311 from masterleinad/restrict_functionparser

Restrict examples that require a working FunctionParser class

Tests: hp/solution_transfer_14: add mpirun=1 to test variant

Tests: hp/solution_transfer_15: add mpirun=1 to test variant

Tests: mpi/solution_transfer_02 add mpirun=1 to test variant

Merge pull request #7316 from tamiko/fix_a_test_2

Tests: base/reference.cc - avoid "use after scope"

Merge pull request #7317 from tamiko/fix_a_test_3

Tests: fe/fe_enriched_color_07 - use a better preconditioner

Make 'CellWeights' available for any 'p::Triangulation'.

Introduced FECollection::find_face_dominating_fe_in_subset().

Introduced get_active_fe_indices() in DoFAccessor namespace.

Merge pull request #7304 from marcfehling/refactor-find-least

Refactored FECollection::find_least_face_dominating_fe_in_collection().

Merge pull request #7319 from masterleinad/restruct_cuda_10_cxx17

Disallow C++17 support when compiling with CUDA 10

Refactored FECollection::find_least_face_dominating_fe_in_collection().

Disallow C++17 support when compiling with CUDA 10

Merge pull request #7313 from tamiko/fix_a_test

Tests: base/utilities_13.cc - workaround for clang

fix typos

Tests: fe/fe_enriched_color_07 - use a better preconditioner

PreconditionSOR does the job here...

Tests: base/reference.cc - avoid "use after scope"

gcc might be a bit forgiving with our use after scope here,
unfortunately, clang isn't. Let's simply work around this issue by
creating using a sentinel that simply resets the SmartPointer when going
out of scope

Added rtree, pack_rtree, and Segment.

Tests: base/utilities_13.cc - workaround for clang

Clang issues a spurious arithmetic exception if this code snippet is
called with a reference long double pointing into the vector. Work
around this issue by explicitly writing out the long double twice.

Merge pull request #7302 from BenBrands/remove_reference

ScaLAPACKMatrix::reinit() and one constructor: pass shared_ptr by value

Restrict examples that require a working FunctionParser class

add test

add constructor taking file name as argument to load matrix from disk

ScaLAPACKMatrix: pass process grid consistently as const ref. to shared_ptr

Merge pull request #7299 from masterleinad/fix_mpi_const_cast

Fix DEAL_II_MPI_CONST_CAST

Merge pull request #7298 from masterleinad/fix_clang_tidy_complains

Fix clang-tidy complaints

Merge pull request #6629 from kronbichler/vectorization_vsx

Implement VectorizedArray for Altivec/VSX (IBM Power)

Fix DEAL_II_MPI_CONST_CAST

Print vectorization for altivec

Add changelog.

Add configure check for altivec and enable it in vectorization.h

Implement float path for altivec vectorization.

Implement VectorizedArray for Altivec/VSX (IBM Power) in double precision.

Undefine vector, pixel, bool from altivec.h

Simplify aliases in step-16

Fix clang-tidy complaints

Merge pull request #7288 from bangerth/threads-2

Do not use deprecated function Threads::this_thread_id().

Merge pull request #7285 from bangerth/threads

Deprecate Threads::n_existing_threads() and Threads::this_thread_id().

Merge pull request #7268 from BenBrands/update_ScaLAPACK_save_parallel

adapt block size in save_parallel

Merge pull request #7280 from davydden/feature/hsfc

add inverse_Hilbert_space_filling_curve

add inverse_Hilbert_space_filling_curve

Remove an unnecessary #ifdef

Merge pull request #7290 from bangerth/doc-update-3

Update the documentation of FECollection::find_last...().

Update the documentation of FECollection::find_last...().

Add a changelog entry.

Do not use deprecated function Threads::this_thread_id().

Deprecate Threads::n_existing_threads() and Threads::this_thread_id().

Add a test for the parallel hp implementation.

Merge pull request #7275 from bangerth/q-collection

Add a variadic constructor to hp::QCollection.

Merge pull request #6754 from tjhei/flat_manifold_normal_bug

Fix normal_vector crash for small cells

Fix incorrect check for data structure resizing

Move a check that's only valid when an AD tape exists

Fix bug when calling reset() with ADOL-C tapeless number

changelog

Merge pull request #7278 from bangerth/authors

Update author list of hp::DoFHandler.

Update author list of hp::DoFHandler.

Add a changelog entry.

Add a variadic constructor to hp::QCollection.

Merge pull request #7274 from bangerth/doc-update

Make documentation of hp::FECollection clearer.

Make documentation of hp::FECollection clearer.

Merge pull request #7264 from marcfehling/cell-weights

Introduced CellWeights class for load balancing by the number of DoFs.

Introduced CellWeights class for load balancing by the number of DoFs.

Merge pull request #7259 from tjhei/old_mpi_support

use const cast for old OpenMPI version

Merge pull request #7270 from tamiko/cmake_fixes

CMake: Uniformly use ADD_FLAGS and LIST(APPEND for CMAKE_REQUIRED

CMake: Remove PUSH_CMAKE_REQUIRED macro

CMake: Use ADD_FLAGS instead of PUSH_CMAKE_REQUIRED

adapt block size in save_parallel and load_parallel