Merge pull request #13756 from kronbichler/add_instantiation

MatrixFree: Add instantiation for ConstraintValues::insert_entries

MatrixFree: Add instantiation for ConstraintValues::insert_entries

Merge pull request #13750 from marcfehling/fixtest-petsc

Update petsc test output.

Update petsc test output.

Merge pull request #13748 from simonsticko/assert_mapping_cartesian

Assert that the incoming cell is Cartesian in MappingCartesian

Merge pull request #13749 from simonsticko/rename_ExcReclassifyNotCalled

Rename an exception

Merge pull request #13747 from tamiko/fix_step_75_emplace

Step-75: use well-formed deleter

Assert that the incoming cell is Cartesian in MappingCartesian

Rename an exception

To be consistent with the names of the other exceptions.

Step-75: use well-formed deleter

LLVM/Clang's libc++ library version 13/14 got stricter by checking
requirements of the deleter, in particular, according to [1] a deleter
must pass the requirement `__shared_ptr_deleter_ctor_reqs` which is
defined as follows:
```
template <class _Dp, class _Pt, class = decltype(declval<_Dp>()(declval<_Pt>()))>
static true_type __well_formed_deleter_test(int);

template <class, class>
static false_type __well_formed_deleter_test(...);

template <class _Dp, class _Pt>
struct __well_formed_deleter : decltype(__well_formed_deleter_test<_Dp, _Pt>(0)) {};

template<class _Dp, class _Tp, class _Yp>
struct __shared_ptr_deleter_ctor_reqs
{
    static const bool value = __compatible_with<_Tp, _Yp>::value &&
                              is_move_constructible<_Dp>::value &&
                              __well_formed_deleter<_Dp, _Tp*>::value;
};
```
Unfortunately, our construct
```
coarse_grid_triangulations.emplace_back(
  const_cast<Triangulation<dim> *>(&(dof_handler.get_triangulation())),
  [](auto &) {});
```
does not pass this test. The issue is that the deleter takes a pointer,
not a reference which, so the lambda `[](auto &){}` does not pass above
`__shared_ptr_deleter_ctor_reqs`.

While at it, remove the const cast: `coarse_grid_triangulations` is
declared as a vector holding a `shared_ptr<const Triangulation<dim>>`,
thus we should simply take the address and not convert to a non-const
object.

[1] https://github.com/llvm/llvm-project/blob/main/libcxx/include/__memory/shared_ptr.h

Merge pull request #13744 from tamiko/transfinite_fix_codim_one

TransfiniteInterpolationManifold: fix codimension one case

Merge pull request #13746 from tamiko/fix_typo

base/tensor.h: Fix a typo

base/tensor.h: Fix a typo

TransfiniteInterpolationManifold: add a test

Merge pull request #13742 from bangerth/typo

TransfiniteInterpolationManifold: fix codimension one case

The codimension one case currently fails with an assertion:
```
An error occurred in line <290> of file <source/grid/grid_tools.cc> in function
    std::pair<DerivativeForm<1, dim, spacedim>, Tensor<1, spacedim>> dealii::GridTools::affine_cell_approximation(const ArrayView<const Point<spacedim>> &) [dim = 2, spacedim = 3]
The violated condition was:
    ::dealii::deal_II_exceptions::internals::compare_for_equality(vertices.size(), GeometryInfo<dim>::vertices_per_cell)
Additional information:
    Dimension 9 not equal to 4.
```
This is triggered because we take a compatibility branch in case of
`dim < spacedim` (in `include/deal.II/fe/mapping_q_internal.h`):
```
908         if (real_support_points.size() ==
909               GeometryInfo<dim>::vertices_per_cell ||
910             dim < spacedim)
911           {
```
but still initialize the vector `unit_points` by a subdivided quadrature
(which is needed for the default quadratic approximation; in
`source/grid/manifold_lib.cc`):
```
1686   std::vector<Point<dim>> unit_points =
1687     QIterated<dim>(QTrapez<1>(), 2).get_points();
1688   std::vector<Point<spacedim>> real_points(unit_points.size());
```

Fix this by simply initializing `unit_points` with the right number of
interpolation points for the `dim < spacedim` variant.

Fix a typo.

Merge pull request #13730 from kronbichler/add_test_output_variant

Add another variant for multigrid test

Merge pull request #13717 from luca-heltai/cgal-compute_boolean_operation

Corefine and compute boolean operations in CGAL

Merge pull request #13739 from marcfehling/fixtest_sharedtria_refine

Added missing headers to failing test.

Added missing headers to failing test.

Fixed documenation.

Merge pull request #13737 from peterrum/ldv_fix_size

LA:d:V: fix size in the case of shared memory

Merge pull request #13738 from gfcas/typo

Fix typo w_cycle

Merge pull request #13736 from drwells/gcc-12-warnings

Fix some GCC-12 warnings.

Merge pull request #13732 from tamiko/remove_as_needed

CMake: remove -Wl,--as-needed flag setup

Fix typo w_cycle

LA:d:V: fix size in the case of shared memory

Add boolean operations between surface_meshes

Simplify some code.

Fix some GCC-12 warnings.

Merge pull request #13712 from marcfehling/security

Restrict permissions for GITHUB_TOKEN.

Merge pull request #13705 from luca-heltai/cgal-surface_mesh-to-coarse_mesh

Create coarse mesh out of a CGAL::Surface_mesh

Merge pull request #13733 from bangerth/ca-types-4

Avoid double packing/unpacking for CA algorithms.

Merge pull request #13731 from bangerth/ca-types-3

Simplify the type used by ConsensusAlgorithm in compute_n_point_to_point_communications().

Merge pull request #13729 from simonsticko/quadrature_initialize

Set is_tensor_product_flag in Quadrature::initialize(..)

Avoid double packing/unpacking for CA algorithms.

CMake: remove -Wl,--as-needed flag setup

The issue with the current handling of the --Wl,--as-needed flag is the
fact that we set it internally but later on filter it (unconditionally)
for user projects.

This has the issue that it is currently not possible to set
--Wl,--as-needed by hand when needed.

Thus, let us simply remove the setup and the workarounds.

Simplify the type used by ConsensusAlgorithm in compute_n_point_to_point_communications().

Merge pull request #13722 from bangerth/ca-type-2

Merge pull request #13728 from sebproell/mf-reinit-empty-procs

Add another variant for multigrid test

Set is_tensor_product_flag in Quadrature::initialize(..)

If you first create a quadrature which is a tensor product and then
call initialize with points and weights which does not correspond
to a tensor product, you can make is_tensor_product_flag have the
wrong value. Set the flag in intialize(..) to avoid this.

New test for MatrixFree::reinit with empty procs

Merge pull request #13726 from tamiko/silence_warning

CMake: Do not warn about not finding CGAL

CMake: Do not warn about not finding CGAL

Newer CMake versions (encountered with CMake 3.20) seem to warn very
verbosely about not finding a package. Let's add the "QUIET" keyword to
the find_package() call to silence the warning.

Merge pull request #13723 from kronbichler/fix_cg_interleave

Fix three bugs in interleaved CG method

Merge pull request #13724 from kronbichler/simplify_chebyshev

Choose common SFINAE detection path for PreconditionChebyshev

Merge pull request #13725 from peterrum/mf_fe_nothing_fix

MF: fix if all cells of a process are FE_Nothing

MF: fix if all cells of a process are FE_Nothing

Choose common SFINAE detection path for PreconditionChebyshev

Fix two bugs in interleaved CG method

Do not compress data.

Add a necessary include.

Replace std::vector<RequestType> by RequestType.

Same for AnswerType.

Merge pull request #13720 from bangerth/ca-type

Rename the template type arguments of the consensus algorithms.

Merge pull request #13719 from drwells/cleanup-duplicated-vertices

Clean up delete_duplicated_vertices() a little.

Convert CGAL::Surface_mesh to coarse mesh

Rename the template type arguments of the consensus algorithms.

Clean up delete_duplicated_vertices() a little.

Merge pull request #13718 from bergbauer/fix-master

Fix master face_no

Merge pull request #13698 from kronbichler/cg_interleave

Add a data-locality-optimized iteration scheme to SolverCG

Fix master face_no

Merge pull request #13063 from peterrum/ecl_unstructured_evaluate

Implement FEFaceEvaluation::evaluate() for ECL/unstructured meshes

Merge pull request #13590 from bergbauer/gradient_hessian_ellipsoid

Add gradient to SignedDistance::Ellipsoid

Merge pull request #13637 from peterrum/MGTransferBlockGlobalCoarsening

Introduce MGTransferBlockGlobalCoarsening

Merge pull request #13694 from peterrum/do_interpolate_boundary_values

Generalize do_interpolate_boundary_values() for pyramid and wedge

Merge pull request #13577 from drwells/muparser-pimpl

Implement second variant for specialized preconditioner

Merge pull request #12463 from peterrum/set_dof_values_by_interpolation_assert

Improve asserts in parallel::distributed::SolutionTransfer

Merge pull request #13716 from marcfehling/changelog

Adjust changelog for 64bit nonzeros.

Merge pull request #13631 from CorbinFoucart/python3_binding_cmake_build_fix

Merge pull request #13714 from marcfehling/step55-ierr

Fix test simplex/step-55.

Fix typo.

Merge pull request #13715 from singima/changelog_entry

changelog news entry

Adjust changelog for 64bit nonzeros.

Fix test simplex/step-55.

Merge pull request #13711 from drwells/fix-nodal-renumbering-tests

Fix the nodal renumbering tests.

Merge pull request #13713 from tamiko/update_cdash_url

Server move: Update server URLs

changelog news entry

examples/step-69: Update URL

Server move: Update CDash URL

Fixes CMake version > 3.12 python-binding build failure due to deprecated FindPythonInterp call.

Restrict permissions for GITHUB_TOKEN.

Generalize do_interpolate_boundary_values() for pyramid and wedge

Merge pull request #13700 from drwells/celldata-default-arg

Correctly size CellData::vertices in GridTools.

Merge pull request #13710 from masterleinad/restrict_feinterface_stokes

Restrict feinterface/stokes test

Fix the nodal renumbering tests.

Saving assertion messages in this way isn't portable.

Merge pull request #13693 from peterrum/unit_face_support_points

unit_support_points and unit_face_support_points for wedges and pyramids

Merge pull request #13706 from bangerth/ref-cell-2

Add ReferenceCell::get_midpoint_quadrature().

Correctly size CellData::vertices in GridTools.

Restrict feinterface/stokes test

Merge pull request #13709 from simonsticko/add_asserts_mesh_classifier

Add two asserts in NonMatching::MeshClassifier.

Improve asserts in parallel::distributed::SolutionTransfer

Merge pull request #13708 from simonsticko/exception_white_space

Merge pull request #13699 from drwells/skip-default-cell-data

Skip default values in get_coarse_mesh_description().

Add two asserts in NonMatching::MeshClassifier.

Rename a few variables and use range based loop in mesh classifer test.

Add white space to fix exception message split over several lines.

Merge pull request #13707 from bangerth/tests-7

Add more tests.