Merge pull request #15801 from bangerth/x3

Make GridGenerator::hyper_cube_with_cylindrical_hole<2>() more robust.

Merge pull request #15816 from peterrum/contains_cell

Introduce Triangulation::contains_cell()

Merge pull request #15845 from luca-heltai/stefanozampini/ts-alternative-output

petsc_ts_03: need to add an output for pre 3.20

need to add an output for pre 3.20

Merge pull request #15841 from peterrum/compute_weights

MGTwoLevelTransfer: remove temporal vector in compute_weights()

Inroduce Triangulation::contains_cell()

MGTwoLevelTransfer: remove temporal vector in compute_weights()

Avoid some uses of GeometryInfo.

Avoid a compiler warning in a test.

Make sure we don't match points on the perimeter of the domain as 'inside'.

Fix a warning in a test.

Merge pull request #15785 from luca-heltai/stefanozampini/ts-resize-and-hooks

PETScWrappers::TimeStepper support resizing while solving

Merge pull request #15829 from drwells/fe-values-split-1

Split fe_values.h and fe_values.cc into three files each.

Merge pull request #15832 from gassmoeller/optimize_step_68

Avoid memory allocations in step 68

Merge pull request #15805 from AbbBallout/VectorFunctionFromTensorFunction_gradient

Added gradient() evaluation to VectorFunctionFromTensorFunction

Added gradient() evaluation to VectorFunctionFromTensorFunction

Added gradient() evaluation to VectorFunctionFromTensorFunction

Added gradient() evaluation to VectorFunctionFromTensorFunction

Added gradient() evaluation to VectorFunctionFromTensorFunction

Added gradient() evaluation to VectorFunctionFromTensorFunction

Add test functions_08_gradient

Removed value() functions_08_gradient test

Added doc/news/changes/minor/

Update doc/news/changes/minor/20230730AbbasBallout

Co-authored-by: Daniel Arndt <arndtd@ornl.gov>
Update doc/news/changes/minor/20230730AbbasBallout

Co-authored-by: Daniel Arndt <arndtd@ornl.gov>
Update 20230730AbbasBallout doc minor changes

Fix test in base/functions_08_gradient.cc

Split fe_values.h and fe_values.cc into three files each.

In 367243a1614 (PR 15575) I removed SPLIT_INSTANTIATIONS_INDEX et al from
fe_values.cc. This was fine for -O2 but with -O3 -march=native this file now
takes several minutes to compile.

The majority of our compilation time here is in FEValuesViews - ultimately I'd
like to split that up. This commit performs one step towards splitting that up
by splitting up fe_values.h and corresponding source files into files for
FEValuesViews, FEValues, and FEValuesBase.

Merge pull request #15826 from peterrum/fix_test2

Fix a build warning

Avoid memory allocations in step 68

Fix test

Merge pull request #15815 from peterrum/NoncontiguousPartitioner_import_from_ghosted_array

Merge pull request #15822 from peterrum/fix_test

Merge pull request #14976 from peterrum/pack_rtree_of_indices_win

Fix test

Add NoncontiguousPartitioner::import_from_ghosted_array()

Merge pull request #15802 from bangerth/x4

Merge pull request #15811 from peterrum/simplices_find_cell

GridTools::find_active_cell_around_point() and find_all_active_cells_around_point() for simplices

GridTools::find_active_cell_around_point() and find_all_active_cells_around_point() for simplices

Merge pull request #15808 from peterrum/find_all_locally_owned_active_cells_around_point_cache_get_vertex_to_cell_map

Use Cache::get_vertex_to_cell_map() in GT::find_all_locally_owned_act…

PETScWrappers::TimeStepper: use empty function when not knowing how to deal with the exception

PETScWrappers::TimeStepper: make setup_xxx calls private

Use Cache::get_vertex_to_cell_map() in GT::find_all_locally_owned_active_cells_around_point()

Merge pull request #15810 from peterrum/vertex_to_cell_map_check_hn

GT::vertex_to_cell_map(): check if triangulation is locally refined.

implement Wolfgang's comments

Merge pull request #15812 from luca-heltai/fix_hanging_nodes_in_parallel_nnmg

Add constrained entries to partitioner_coarse in NonNestedMG

Merge pull request #15649 from pcafrica/serialization_test

Test serialization for serial and shared triangulations

GT::vertex_to_cell_map(): check if tria has hn

Move create_coarse_partitioner to public

Merge pull request #15809 from peterrum/use_create_extended

Use BB::create_extended()

Add warning to pack_rtree_of_indices()

Add test with locally refined distributed grids

Add constrained DoFs to locally relevant DoFs in non-nested MG

Use BB::create_extended()

Merge pull request #15752 from peterrum/gc_init_MGConstrainedDoFs

MGTransferGlobalCoarsening: initialize with MGConstrainedDoFs

MGTransferGlobalCoarsening: initialize with MGConstrainedDoFs

Merge pull request #15793 from peterrum/interpolate_to_mg_zero

`MGTransferMF::interpolate_to_mg()`: zero out ghost values

Make GridGenerator::hyper_cube_with_cylindrical_hole<2>() more robust.

Merge pull request #15800 from peterrum/ac_warning

AffineConstraints: fix warnings

MGTransferMF::interpolate_to_mg(): zero out ghost values

Merge pull request #15799 from masterleinad/restrict_trilinos_sparse_matrix_mmult_01

trilinos_sparse_matrix_mmult needs EpetraExt

Merge pull request #15797 from peterrum/add_mg_data_vector

DataOut::add_mg_data_vector(): copy vector and update ghost values

Adjust expectations in a function.

AffineConstraints: fix warnings

Merge pull request #15798 from masterleinad/fix_block_vector_vector_assign

Fix block_vector_vector_assign

trilinos_sparse_matrix_mmult needs EpetraExt

Fix [complex_]block_vector_vector_assign

Merge pull request #15795 from bangerth/x2

Minor addition to the documentation of a GridTools function.

Merge pull request #15796 from bangerth/x1

Simplify code using structured bindings.

Remove VectorHelper

DataOut::add_mg_data_vector(): copy vector and update ghost values

Merge pull request #15792 from peterrum/mg_level_object_clear

Add MGLevelObject::clear()

Minor addition to the documentation of a GridTools function.

Simplify code using structured bindings.

Add MGLevelObject::clear()

Merge pull request #15791 from masterleinad/fix_timing_step_37

Fix timing_step_37.cc

Fix timing_step_37.cc

Merge pull request #15784 from peterrum/MGTransferMG

Replace MGTransferMG usages in tests/matrix_free

PETScWrappers::TimeStepper: add missing tests for callbacks

PETScWrappers::TimeStepper: cannot change the pointers to the matrices

use MatCopy instead (just to make sure....)

PETScWrappers::TimeStepper: Fix for older versions of PETSc

Merge pull request #15783 from bangerth/_t

More work to replace std::*::type by std::*_t.

Merge pull request #15781 from bangerth/no-mpi

Allow compilation with PETSc but without MPI.

Merge pull request #15756 from tamiko/test_draft_prs

github: run all github actions on draft PRs as well

Prefer std::remove_*_t over std::remove_*::type.

PETScWrappers::TimeStepper support resizing while solving

add hooks to completely support deal.II style
improve documentation

Merge pull request #15782 from peterrum/solution_copy_indices_global_mine

MGLevelGlobalTransfer: remove unused variables

Replace MGTransferMG usages in tests/matrix_free

MGLevelGlobalTransfer: remove unused variables

Prefer std::conditional_t over std::conditional::type.

Prefer std::make_(un)signed_t over std::make_(un)signed::type.

Merge pull request #15753 from peterrum/af_merge_number

AffineConstraints::merge(): allow mixed numbers

Merge pull request #15750 from peterrum/MGTransferMatrixFree_spacedim

MGTransferMatrixFree: remove unused template argument

Merge pull request #15779 from peterrum/mf_kokkos_performance

Small modifications to performance/timing_matrix_free_kokkos

Allow compilation with PETSc but without MPI.

Small modifications to performance/timing_matrix_free_kokkos

Merge pull request #15770 from luca-heltai/stefanozampini/petsc-version

Config.h.in: use PETSc/SLEPc macros to determine PETSc/SLEPc version

Merge pull request #15769 from luca-heltai/stefanozampini/update-snes-docs-and-stricterrorcode

Update PETScWrappers::NonlinearSolver

Merge pull request #15777 from masterleinad/cuda_wrappers_matrix_free_required_mirrors

CudaWrappers::MatrixFree: Only create required host mirrors

Merge pull request #15771 from peterrum/mf_kokkos_performance

Add performance test for `CUDAWrapper::MatrixFree`

Merge pull request #15776 from masterleinad/mpi_log_init_all_particles_generators

Use MPILogInitAll in particles/generators_* tests

CudaWrappers::MatrixFree: Only create required host mirrors

Use MPILogInitAll in particles/generators_* tests

Merge pull request #15775 from peterrum/cmake_repeat

CMake: only use REPEAT for >=3.15

PETScWrappers::NonlinearSolver: support strict error codes

PETScWrappers::NonlinearSolver: Improve documentation

Merge pull request #15764 from bangerth/p-h

Improve an error message.

MGTransferMatrixFree: remove unused template argument

CMake: only use REPEAT for >=3.15

Merge pull request #15766 from bangerth/std_predicates

[C++17] Prefer std::is_*_v over std::is_*::value.

Merge pull request #15767 from luca-heltai/stefanozampini/tweak-petsc-tests

tweak PETSc tests