silence a warning, part 2

Merge pull request #906 from tamiko/fix_warnings

silence a warning

silence a warning

Merge pull request #883 from Rombur/serial_vector

[RFC] deprecate Trilinos and PETSc wrappers of serial vectors

Don't throw an exception recommanding to use mpirun -np 1 in the tutorials.

Fix double entry in changes.h

Deprecate TrilinosWrappers constructors instead of the whole class to silence warnings.

Deprecate the serial TrilinosWrappers and PETScWrappers classes instead of the constructor. Use complete_set_index in the tutorials.

Throw an exception when one tries to use in parallel tutorials that are serial. Consistently use MPI_COMM_WORLD with reinit(IndesSet, MPI_Comm) in the tutorials.

Replace PETScWrappers::Vector by PETScWrappers::MPI::Vector in step-36.

Fix a conflict in step-17.

Update changes.h

Deprecate PETScWrappers::Vector and PETScWrappers::BlockVector and update the tutorials.

Deprecate TrilinosWrappers::Vector and TrilinosWrappers::BlockVector and update the tutorials.

Merge pull request #904 from nicolacavallini/master

multiple polynomials_bernstein instantiation, in polynomials_bernstein.c...

multiple polynomials_bernstein instantiation, in polynomials_bernstein.cc and fe_bernstein.cc

Merge pull request #900 from masterleinad/branch_fix_half_hyper_shell

Fixed colorization for GridGenerator::half_hyper_shell

Fixed colorization for GridGenerator::half_hyper_shell

Merge pull request #901 from luca-heltai/fix-dyn-sparsity

Fix Dynamic Sparsity Pattern bug on Macs

Closes #889

Merge pull request #896 from masterleinad/branch_add_point_gradient

Implement point_gradient similarly to point_value

Merge pull request #899 from tamiko/add_two_small_comments

add two comments

add two comments

Merge pull request #897 from tamiko/move_constructors

A bunch of bugfixes for move operators

Remove move operators and constructors from PETSc variants

fixup

Bugfix: Do not reinitialize in move operator

Bugfix: Implement BlockIndices::swap correctly

Bugfix: Implement PETScWrappers::BlockVector::swap for different block sizes

Bugfix: Correctly set up object in move constructor

Bugfix: Implement TrilinosWrappers::BlockVector::swap for different block sizes

Bugfix: Correctly set up object in move constructor

Bugfix: Implement BlockVector<number>::swap for different block sizes

Bugfix: Correctly set up object in move constructor

Bugfix: Correctly set up object in move constructor

Add an entry to changes.h and reduce the number of actual implementations for point_value and point_gradient

Implement point_gradient similarly to point_value

Merge pull request #893 from tamiko/move_semantic

Add move constructor and operator to Vector and BlockVector

reindent

Do not clear vectors in move operators/constructors for distributed data structures

Add tests for native deal variants and TrilinosWrappers::MPI

add a changes.h entry

Add move constructor and operator to PETScWrappers::MPI::Vector and PETScWrappers::MPI::BlockVector

Add move constructor and operator to TrilinosWrappers::MPI::Vector and TrilinosWrappers::MPI::BlockVector

Add move constructor and operator to Vector and BlockVector

Merge pull request #890 from tjhei/blockwise-mg

multigrid block_wise renumbering

add changelog entry

extend test

add serial test for DoFRenumbering::block_wise for MG

Remove is_active check in dof renumbering

Condense locally-owned conditions for renumbering

Add spacedim parameter to renumbering function

Fix block-wise dof renumbering for multigrid

Re-adds a version of DoFRenumbering::block_wise working on a single
multigrid level. For this an internal helper function is changed to
work with non-active cells.

Merge pull request #887 from drwells/consistent-logical-operators

Consistent logical operators

Update to match the current style guide.

Add a style guideline for "&&", "||", and "!".

Merge pull request #886 from fsonner/gmresfix

Remove duplicate memory freeing in GMRES

Add test for double memory freeing bug in GMRES

Remove duplicate memory freeing in GMRES

Merge pull request #884 from Rombur/muelu_periodicity_64bit

The muelu_periodicity tests should not be run with 64bit indices.

Merge pull request #880 from tamiko/update_documentation

Documentation update, minor fixes Changes:

The muelu_periodicity tests should not be run with 64bit indices.

Merge pull request #881 from bangerth/fix-warning

Fix a warning about an unused variable.

Fix a warning about an unused variable.

Provide template default arguments

Update documentation

Add operator*=(number) variant to LinearOperator

Merge pull request #878 from drwells/remove-stl-references

Remove STL references

Update copyright years.

Update the estimated memory consumption comment.
This one had a sentence fragment and mentioned the STL.

Remove compatability with EGCS 1.1.
Chances are GCC has been patched in the last sixteen years to fix this
issue.

Remove references to the STL.
These comments should refer to the C++ standard instead, which now
includes the STL (standard template library).

Merge pull request #867 from bangerth/remove-deprecated-row-iterators

Remove deprecated row iterators

Merge pull request #877 from tamiko/silence_warnings

Silence extra diagnostics in the testsuite

Silence extra diagnostics in the testsuite

Merge pull request #864 from ian-r-rose/new_mpi_sum_utilities

Add collective MPI sums for tensorial objects

Add collective MPI sums to tensorial objects

Fix indentation

indentation

Move functions to mpi.h, address other comments

Try to avoid variable length array declaration

Add entry to changelog

Fix slash

Merge pull request #873 from mtezzele/fe_tools-with-fe_bernstein

Added FE_Bernstein in fe_tools.cc.

added FE_Bernstein in tests/fe/fe_tools_01.cc

Added fe_bernstein in fe_tools.cc. Now get_fe_from_name works.

Merge pull request #874 from tjhei/doxygen_fixes

doxygen fixes

remove @tref

doxygen fixes

- Looks like \footnotesize is not valid in MathJax
- escape _ in linear_operator.h

Merge pull request #869 from bangerth/doc-update-24

Update documentation in one of the examples.

Don't compare floating point numbers directly, but via std::fabs.

Update documentation in one of the examples.

I tripped over this place the other day because we were setting
boundary indicators without checking that the face is actually
at the boundary. One of my students used the code as the
template to build his own and promptly proceeded to set the
boundary indicator of an internal face.

Remove deprecated row_iterator type and corresponding functions row_begin() and row_end() from sparsity pattern classes.

Avoid using the deprecated row_iterator types of sparsity patterns. Replace them with uses of regular iterators.

Avoid using the deprecated row_iterator types of sparsity patterns. Replace them with uses of regular iterators.

Avoid using the deprecated row_iterator types of sparsity patterns. Replace them with uses of regular iterators.

Avoid using the deprecated row_iterator types of sparsity patterns. Replace them with uses of regular iterators.

Avoid using the deprecated row_iterator types of sparsity patterns. Replace them with uses of regular iterators.

Avoid using the deprecated row_iterator types of sparsity patterns. Replace them with uses of regular iterators.

Avoid using the deprecated row_iterator types of sparsity patterns. Replace them with uses of regular iterators.

Avoid using the deprecated row_iterator types of sparsity patterns. Replace them with uses of regular iterators.

Avoid using the deprecated row_iterator types of sparsity patterns. Replace them with uses of regular iterators.

Merge pull request #801 from rosskynch/project_bvcc_2d_patch

Fixed bug with project_boundary_value_curl_conforming_l2 in 2D

Merge pull request #865 from bangerth/fix-dynamic-sparsity-pattern-iterators-2

Fix an oversight in a previous patch for DynamicSparsityPattern iterators

Fix an oversight in a previous patch for DynamicSparsityPattern iterators.

Fixed bug with 2D implementation. The tangents were being computed incorrectly on geometries which dont align with the axis of the reference element. A way around this is to use the normal vectors instead, which come directly from the FEFaceValues object.

Have included a test to demonstrate this for a simple test polynomial.