Fix some markdown mishandling by doxygen.

My copy of doxygen does not correctly bold all statements with double
earmuffs; use HTML instead.

Remove spurious links to Boundary.

Fix some typos in step-60.

update VERSION for release

Merge pull request #6548 from tamiko/pr_6538

[9.0] take over #6537, #6538

Merge pull request #6549 from tamiko/pr_6544

[9.0] Take over #6544, #6543, #6541

Merge pull request #6547 from tamiko/pr_6536

[9.0] take over #6535, #6536

Clarify some text.

Remove a repetitive piece of text that doesn't add information.

Update the Gmsh entry in readme.html.

doc: say what we need from Gmsh

Remove a static Manifold from an example.

Clarify Manifold attachment in some functions.

Mention Manifold attachment in GridGenerator.

Attach a TorusManifold to a Torus.

Slightly decrease solver tolerance in lac/gmres_eigenvalues

Slighty increase tolerance in base/quadrature_chebyshev

Merge pull request #6514 from tamiko/pr_6393

[9.0] take over #6393

Merge pull request #6534 from tamiko/pr_6533

[9.0] take over #6533

Merge pull request #6515 from tamiko/pr_6508

[9.0] take over #6508, #6519

Make sure that also the output of the embedded value is on the deformed grid.

Merge pull request #6521 from tamiko/pr_6297

[9.0] take over #6297

Added doi.

Fixes to JP comments

Added references to step-60 in header files.

Added entries in tutorial.h.in

Added external cache.

Added possibility to read parameter from command line.

Written results, modified parameter file to use colorize

Added description of C and a solution example

Corrected refinement

First commented version of step-60

Co-authored-by: Giovanni Alzetta <giovannialzetta@hotmail.it>

Work around an internal compiler error on GCC7.

Only check for validity of the resulting Triangulation

Fix gmsh/create_tria_02

Merge pull request #6516 from tamiko/pr_6513

[9.0] take over #6291, #6511, #6513

put changelog entry back in place

Finally fix step-59 formula.

Fix typo.

Try to fix latex formula.

Explain the benefit of the fast diagonalization method in terms of iteration counts.

Link in step-59 in central tutorial page.

Write results section.

Write introduction.

Add step-59 tutorial program showing matrix-free DG.

Make sure not to attach a PropertyPool if not asked for

update VERSION for pre-release

Merge pull request #6509 from tamiko/pr_6475

[9.0] take over #6475

Fix the remaining gcc-8 warnings

Merge pull request #6503 from tamiko/pr_6491

[9.0] take over #6491

Merge pull request #6506 from tamiko/pr_6498

[9.0] take over #6498

Merge pull request #6507 from tamiko/pr_6499

[9.0] take over #6487 and #6499

Merge pull request #6501 from tamiko/pr_6483

[9.0] take over #6483

Merge pull request #6500 from tamiko/pr_6480

[9.0] take over #6480

Merge pull request #6505 from tamiko/pr_6496

[9.0] take over #6496

Actually fix compute_local_to_global_vertex_index_map.

The MPI types do not match the deal.II types, which is causes chaos when we use
32 bit indices.

Fix compute_local_to_global_vertex_index_map.

The MPI_Allgather call should have the same value inputs for the second
and fifth arguments.

CMake: Unset cached results for C++11/14/17 detection if necessary

CMake: Partially revert #6490

CMake: Rerun checks if compiler configuration changes

CMake: cosmetic changes

Merge pull request #6504 from tamiko/pr_6495

[9.0] take over #6495

Merge pull request #6502 from tamiko/pr_6489

[9.0] take over #6489

Default copy assignement in Tensor for non-Intel compilers

Add a reference to step-10.

While there, also rewrite a couple of sentences.

Add some more MPI checks.

Fix a test to not write past the end of an array.

Fix test

Change default number of properties

Fix invalid number of particle properties in a test

Fix a GCC8 warning.

GCC warns that these types are not trivally copyable so we should not use
std::memmove. We cannot use std::move either since the beginning of the new
range may intersect the old range. Hence: use std::move_backward to copy from
the end, which cannot overlap.

Merge pull request #6492 from luca-heltai/fix-order-parsing-external-conf

Move parsing of external.conf at the end.

Move parsing of external.conf at the end.

Merge pull request #6485 from masterleinad/fix_depraction_warning

[9.0] take over #6486

Fix warning text

update VERSION for pre-release

Merge pull request #6482 from tamiko/undo_mess_2

Revert "Default copy assignement in Tensor for non-Intel compilers"

Revert "Default copy assignement in Tensor for non-Intel compilers"

This reverts commit b509e726018ba3c8689158f0606867664039416e.

Merge pull request #6479 from tamiko/pr_6474

[9.0] take over #6474

Merge pull request #6477 from tamiko/revert_change

[9.0] Revert "Replace std::memmove by std::move for std::pair"

Default copy assignement in Tensor for non-Intel compilers

Merge pull request #6478 from tamiko/pr_6476

[9.0] take over #6476

Add inclusion guards around instantiation that requires OpenCascade.

Revert "Replace std::memmove by std::move for std::pair"

This reverts commit 11aef84a644b036b3f7acae2bad252737d8151aa.

update VERSION for pre-release

Merge pull request #6471 from tjhei/port_6465

[9.0] take over #6465: use std::tmpfile instead of tmpnam

Merge pull request #6469 from tamiko/pr_6461

[9.0] take over #6461

Merge pull request #6468 from tamiko/fix_tests_9.0

[9.0] take over #6460

use std::tmpfile instead of tmpnam

Merge pull request #6470 from tamiko/remove_unfinished_steps

[9.0] Release tasks step 8: remove unfinished steps

removed unfinished steps (release tasks step 8).

Replace std::memmove by std::move for std::pair

Update test output for changes in hyper_shell

Merge pull request #6467 from tjhei/port_6466

[9.0] take over #6466

enable WITH_GMSH for doxygen

Merge pull request #6464 from tjhei/port_6463

[9.0] take over #6463

fix ConstraintMatrix initialize warning

update AUTHORS

update VERSION

Merge pull request #6453 from tamiko/fix_cmake

CMake: Bugfix: Only set test dependencies if tests are actually defined...