periodic_neighbor in DoFTools::make_sparsity_pattern

Merge pull request #2514 from jgedicke/mg_assemble_up_fix

fix call of assemble_up in MGMatrixSimple

Merge pull request #2516 from ESeNonFossiIo/fix_old_PETSc_versions

Fix a compilation issue of #2502

add guard on PETSc version

more system tests in assembler_simple_mgmatrix_04

modified assembler_simple_mgmatrix_04 to test for FESystem(RT_0,DGP_0)

Merge pull request #2515 from kronbichler/fix_mg_test

Adjust test to fixed adaptive multigrid

Adjust test to fixed adaptive multigrid

fix call of assemble_up in MGMatrixSimple

Merge pull request #2507 from kronbichler/master

Introduce affinity partitioner to Vector

Adjust memory consumption of vector

Avoid setting the partitioner at the place of use

Do not change partitioners in reinit(n), cleanup code

Mention change

Implement affinity partitioner for the deal.II vector class

Merge pull request #2509 from bangerth/doc-update-58

A number of doc updates.

Merge pull request #2502 from ESeNonFossiIo/PETSc_reinit_helper

PETSc ReinitHelper for LinearOperator

Update documentation of MGLevelObject.

Update a comment about the contents of a file.

Merge pull request #2508 from bangerth/doc-update-57

Update a copy-paste error for DoFTools::extract_boundary_dofs().

Update a copy-paste error for DoFTools::extract_boundary_dofs().

There are two functions of the same name with the same documentation, but in one
the argument is a std::vector<bool> and in the other it is an IndexSet. The former's
documentation was copied from the latter's and referred to the wrong data type.

While there, also mark arguments as [in] or [out].

add check on PETSc contiguos memory

changes.g

PETSc ReinitHelper for BlockVector

test for PETSc Vector reinit helper

PETSc Vector reinit helper

add locally_owned_range_indices and locally_owned_domain_indices

add m() and n() methods

Merge pull request #2503 from danshapero/vector-move-ctor

Vector, BlockVector are reset after move

changelog

Added default move ctor/assignment to BlockVector, BlockVectorBase

This makes a moved BlockVector have the right post-condition, i.e.
the state it would have after default construction.

Added move ctor to BlockIndices

Changed the vector move ctor/assignment operator not to use swap

Added move assignment operator to Subscriptor

Merge pull request #2506 from kronbichler/improve_vector_grainsize

Improve grainsize of vectors, unify vector loops

Merge pull request #2466 from tjhei/parmg_missing_neighbors

rework MG DoF distribution

Improve grainsize of vectors, unify vector loops

Merge pull request #2501 from tjhei/tensor_mf_followup

TensorProductManifold followup

changelog

rework MG distribution

Fix a rare case of missing level ghost neighbors for geometric
multigrid.

Add sanity checks to confirm several assumptions made in the code to
detect problems like this in the future.

Rework and simplify the logic of distribute_mg_dofs: don't communicate
ghost neighbors by level but all at once and instead of guessing who
will send data, actually request cells from the ghost neighbors.

Add and updated tests.

changelog

require muparser for manifold test

Merge pull request #2499 from nicolacavallini/matrix_creator_inst

matrix creator instantiation

matrix creator instantiation

restored codimension zero instatiation

deleted blank line

Merge pull request #2416 from tjhei/tensor_mf

[WIP] implement TensorProductManifold

implement TensorProductManifold

Merge pull request #2497 from kronbichler/fix_cuthill_mckee

Fix Cuthill-McKee renumbering on large processor counts

Merge pull request #2498 from andreamola/read_ucd_manifold_ids_option_test

Read ucd manifold ids option test

implemented modifications asked by Luca H. on tests/grid/grid_in_ucd_01.cc

added comment on new read_ucd option in doc/news/changes.h

indent

Added a test for the new read_ucd option that treats identifiers in a ucd file as manifold_ids instead of boundary_ids

Fix Cuthill-McKee renumbering on large processor counts

Merge pull request #2483 from gpitton/new_gmres_signals

Added Hessenberg and Krylov signals to GMRES

Merge pull request #2494 from luca-heltai/entry-mapping-manifold

Add entry in changes.h for MappingManifold

Update a comment for a variable.

Added entry for MappingManifold.

Merge pull request #2411 from luca-heltai/composition-manifold

Composition manifold.

Improved comment on periodicity for SphericalManifold.

Removed old manifold_tools.h

Added comment and entry to changes.h.

Moved CompositionManifold to its own directory.

Periodicity as Tensor<1,spacedim>.

Added periodicity getter to ChartManifold

Test periodicity.

Composition of Manifold + Rotation.

Initial CompositionManifold.

Merge pull request #2493 from luca-heltai/mdh266-refactor-trilinos-solvers

Cleaned version of mdh266 PR (Refactor Trilinos Solvers)

Refactored trilinos direct solver

Merge pull request #2488 from bangerth/doc-update-56

Add a changelog entry.

Add a changelog entry.

Merge pull request #2462 from kronbichler/change_to_gausslobatto

Make Gauss-Lobatto points the default support points in FE_Q/FE_DGQ

Adjust test output due to change in elements

Change many tests to use equidistant points rather than GL points

FE_Bernstein uses equidistant points

Convert FE_TraceQ to Gauss-Lobatto points for collaboration with FE_Q.

Mention change

Adjust tests to better cover Gauss-Lobatto and equidistant points

Adjust comments regarding Gauss-Lobatto polynomials

Make Gauss-Lobatto points the default node distribution in FE_Q/FE_DGQ.

Merge pull request #2492 from luca-heltai/hot-fix

Restore a line removed by accident.

Restored a line that was mistakenly removed by me.

Merge pull request #2489 from danshapero/move-ctors

move constructor for Quadrature

Added default constructor to Quadrature

Merge pull request #2474 from davydden/step-16vs50

add GMG unit tests which compare serial step-16 to paralle step-50 at…

Merge pull request #2486 from davydden/parpack_fix_warnings

fix compiler warnings in PArpack

fix compiler warnings in PArpack

Merge pull request #2485 from bangerth/doc-update-55

Better document what the anisotropic refine flags mean.

Merge pull request #2459 from andreamola/read_ucd_for_manifold_ids

added new option to read boundary indicators in a ucd file as manifold ids

Better document what the anisotropic refine flags mean.

Merge pull request #2484 from masterleinad/residual_change

Add entry in changes.h for the fix in ResidualSimple

Add entry in changes.h for the fix in ResidualSimple

added new option to read indicators in a abaqus file as manifold ids

added new option to read indicators in a ucd file as manifold ids and not as boundary ids

Merge pull request #2476 from masterleinad/fix_residual_simple

Fix for ResidualSimple such that block vectors always can have multiple blocks

Merge pull request #2481 from bangerth/update-comment

Update the comment for a variable.

Update a comment for a variable.

Merge pull request #2479 from bangerth/better-unit_tangentials-data-structure-2

Use a fixed size data structure for MappingManifold::InternalData::unit_tangentials.

Merge pull request #2480 from bangerth/fix-warnings-7

Avoid warnings with unused variables.

Avoid warnings with unused variables.