Merge pull request #14630 from tamiko/silence_kokkos_warning

Merge pull request #14623 from jppelteret/compiler_fix_01

Fix compiler error for older version of GCC

CMake: Silence a Kokkos warning about unset OMP_PROC_BIND

We now set the OMP_PROC_BIND variable to false to allow free movement of
the two worker threads and silence a KOKKOS warning (which might insist
on this variable to be defined).

Merge pull request #14568 from tjhei/jenkins-mpi-all

[CI]: test all MPI tests

Merge pull request #14622 from bangerth/vtu-77

Remove some duplication; also simplify VTK code.

Merge pull request #14625 from bangerth/assertion

Improve documentation.

Merge pull request #14621 from masterleinad/remove_compiler_cuda_aware

Remove DEAL_II_COMPILER_CUDA_AWARE

Merge pull request #14537 from masterleinad/kokkos_la_d_vector_kokkos

Remove a static assert in symmetric tensor

Merge pull request #14624 from bangerth/ref

Move a function to ReferenceCell

Merge pull request #14620 from tjhei/jenkins-random

Jenkins: run tests in random order

Move a function into ReferenceCell.

Adjust return types and function argument names.

Improve documentation.

Fix compiler error for older version of GCC

Merge pull request #14596 from tamiko/fix_step_81_doc

step-81: Fix a typo in external links

Merge remote-tracking branch 'upstream/master' into kokkos_la_d_vector_kokkos

Update examples/step-81/doc/results.dox

Co-authored-by: Marc Fehling <mafehling.git@gmail.com>

Remove some duplication; also simplify VTK code.

The VTK tags are already defined in helper functions in class ReferenceCell; get them from
there. While there, the previous version of a helper function was rather hard to read
because of a long list of if-else cases; make it a bit easier to read.

Use subview

Add label for parallel_reduce

Use subview

Jenkins: run tests in random order

Schedule tests in random order to improve load balance over time and therefor improve speed.

Revert changes to boost

Make doxygen happy

Kokkos::Experimental::abs -> Kokkos::Experimental::fabs

Merge pull request #14611 from jppelteret/fe_interface_values_02

Fix

Remove unused paramter

Use Kokkos::abs

Use create_mirror_view_and_copy

Remove la_parallel_vector_cuda.cc

Don't initialize Views

wqAnnotate Kokkos::parallel_for

Add a changelog entry

Extend hp support in FEInterfaceValues

Extend FEInterfaceValues::reinit() to take [q,mapping,fe]_index

Use delegate constructors in FEInterfaceValues

Merge pull request #14618 from Rombur/fix_test_kokkos_memory_space

Merge pull request #14617 from jppelteret/bugfix_01

Fixes https://github.com/dealii/dealii/issues/14582

Merge pull request #14616 from Rombur/fix_kokkos_memory_space

Remove incorrect static_assert when using CUDA-aware MPI

Add ADOL-C back into serial Jenkins build

Fix free function specialisations for ADOL-C types

Fix ADOL-C tests broken by presence of static variables.

Fix test output: replace CUDA with Default

Remove incorrect static_assert when using CUDA-aware MPI

Merge pull request #14576 from tjhei/jenkins-new-serial

CI: new serial Jenkins

disable adolc tests

CI: new serial Jenkins

Move the serial tester to ci.tjhei.info.

update

Merge pull request #14615 from tamiko/fix_prm_concurrency

CMake: avoid race conditions between concurrent prm tests

CMake: avoid race conditions between concurrent prm tests

We need to serialize all tests that share a common executable target.
This involves tests with .threads=N. and .mpirun=N. annotation, as well
as tests with parameter files (that might share a common executable
target).

Running multiple variants of tests with the same target executable in
parallel triggers a race condition where the same (not yet existent)
target is built concurrently leading to undefined outcomes.

CMake: remove old prm-test workarounds

Merge pull request #14614 from drwells/isotropic-refinement-cleanup

Isotropic refinement cleanup

isotropic refinement: clean up some more comments.

Merge pull request #14613 from bangerth/doc-87

Better indent documentation of class Function.

isotropic refinement: convert to unsigned int.

isotropic refinement: get rid of 'if (true)'.

isotropic refinement: clean up some comments.

isotropic refinement: add some more test output.

These don't print anything because the lines are all consistently oriented.

isotropic refinement: remove some extra dealii:: qualifications.

Better indent documentation of class Function.

Merge pull request #14600 from luca-heltai/changelog_hp_feiv

Add changelog for hp support in fe_interface_values

Add changelog for hp-fe_interface_values

Merge pull request #14612 from tjhei/tridiagonal_mat_cleanup

small cleanup in tridiagonal_matrix.cc

small cleanup in tridiagonal_matrix.cc

Merge pull request #14603 from peterrum/warning

Merge pull request #14593 from drwells/compress-face-and-line-data

Compress face and line data

Fix warning

Merge pull request #14598 from masterleinad/dont_install_mold

Don't install mold linker in CI

Merge pull request #14592 from luca-heltai/petsc-block-matrix-to-nestmat

PETScWrappers:BlockSparseMatrix: create PETSc MATNEST

Merge pull request #14575 from luca-heltai/petsc-mat-mpi-getter

Petsc mat mpi getter

Don't install mold linker in CI

Merge pull request #14547 from luca-heltai/hp-FEIV

Add hp to FEInterfaceValues

Merge pull request #14591 from luca-heltai/petsc-mpi-management-and-getarray

Petsc mpi management and getarray

step-81: Fix a typo in external links

It should read "noabs" for the first example with Dirichlet boundary
conditions and "abs" for the examples with absorbing boundary
conditions.

Use std::vector<bool> for line orientations.

This saves a further 17 MB with the 2.4 million cell tet mesh.

Fix constness.

Apply suggestions from code review

Co-authored-by: David Wells <drwells@email.unc.edu>

Compress face types to a single bit.

This lowers memory consumption from 712 MB to 707 MB for my 2.4 million
cell tet mesh.

Merge pull request #14587 from drwells/memory-optimizations

Memory optimizations

Apply suggestions from code review

Co-authored-by: David Wells <drwells@email.unc.edu>

Apply suggestions from code review

Co-authored-by: David Wells <drwells@email.unc.edu>

Merge pull request #14586 from tamiko/quick_quick_tests_fix

ChangeLog.

PETScWrappers:BlockSparseMatrix: create PETSc MATNEST

ChangeLog.

Add hp to FEInterfaceValues

PETScWrappers::MatrixBase remove improper usage of WORLD

support printing a matrix that does not implement MatGetRow

PETScWrappers::MatrixFree remove improper usage of MPI_COMM_WORLD

PETScWrappers fix improper usage of WORLD and GetArray

add a method  to get the Vec

Merge pull request #14590 from peterrum/connectivity_refactoring

Some refactoring in connectivity.h

Merge remote-tracking branch 'upstream/master' into kokkos_la_d_vector_kokkos

CMake: do not trigger install during make test

CMake: return a non-zero exit code when quick tests fail

Merge pull request #14588 from tjhei/jenkins-mpi-quick-failure

CI: show quicktest failures in Jenkins

Merge pull request #14510 from masterleinad/kokkos_la_d_vector_1

Use Kokkos in MemorySpaceData

Some refactoring in connectivity.h

Improve memory usage when reading ExodusII grids.

For my big heart mesh (which has about 2.4 million elements) this lowers
peak memory consumption from 1.3 GB to 1.2 GB.