Dependence on forward_declarations removed for speed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2938 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Eliminate stores of zeroes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2937 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use Jacobi preconditioning. Check for float matrices as well.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2936 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

MatrixTools::apply_boundary_values

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2935 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix template problem.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2934 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make apply_boundary_values a template of the number type.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2933 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement Jacobi preconditioning.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2932 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement residual for block matrices.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2931 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Error in 3D removed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2930 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2929 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add new testcase.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2928 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use reinit(Vector) instead of reinit(size), to make solver compatible
with other matrices as well.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2927 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adapt to recent changes in the lib.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2926 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update to changes in the lib.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2925 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix @p tag by #...#

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2924 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

FE_DGx::restriction is changed to a local projection

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2923 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

small fix

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2922 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

small reformating and doc fixes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2921 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove 38659 lines of code for the restriction matrices for DG2 and DG3 for dim=3, as they do not compile in optimized mode. For the case they are needed, they can be get out of cvs archive

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2920 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implementation of the restriction matrices for DG elements. For DG this restriction is a projection from the child cells to the mother cell. Use of the restriction_is_additive_flags

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2919 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

scripts for assembling the restriction matrices for DG elements. Restriction for DG is not an interpolation but a projection

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2918 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug with non-square/square block matrices.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2917 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check that the fe used by a fevalues object is the same as the one used to reinit the fevalues object on a new cell.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2916 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a function to get at the DoFHandler of an accessor. Move the implementation functions to the correct .templates.h file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2915 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new colors for enclosed square

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2913 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

parameter for solver

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2912 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make this file work in non-MT mode as well.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2911 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Unconditionalize inclusion of thread_management, now that we use the typedefs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2910 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change ACE_* to Threads::*

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2909 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change ACE_* to Threads::*

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2908 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change ACE_Thread* to Threads::*

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2907 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix more non-MT problems.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2906 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2905 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change formatting.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2904 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement dummy thread creation and mutices to be able to use the same interfaces for MT and non-MT modes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2903 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement more functions for block matrices as well.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2902 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix another such bug.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2901 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug that shows up when a line is empty.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2900 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reindent.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2899 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2898 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

work around a bug in egcs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2897 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

MeshSmoothing moved into Triangulation class. New smoothing flag patch_level_1

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2896 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Ack, I didn't want to check in this file. Sorry.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2895 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Ups, one should check things, even if they appear simple.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2894 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix alleged bugs and add comments.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2893 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix two assertions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2892 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move template function to respective .templates.h file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2891 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mark non-implemented block.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2890 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add some more functions for block sparse matrices. Not all yet tested.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2889 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Allow access to the block indices.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2888 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add more assertions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2887 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2886 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement a block-to-global transformation function.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2885 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix language.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2884 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix indentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2883 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

It compiles now.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2882 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Further work on apply_boundary_values for block matrices; still not compilable, so still commented out.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2881 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add apply_boundary_values for block matrices and vectors.
At present not implemented, but I check it in to work at it at home.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2880 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add apply_boundary_values for block matrices and vectors.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2879 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Grant access to index objects.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2878 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement comparison of block index objects.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2877 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

apply_boundary_values. jacobians

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2876 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix wrong calculation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2875 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

When eliminating boundary values from a matrix, we only have to eliminate the respective element from the other rows for which we know that they have a nonzero element in that column. Previously, we searched all rows for this, but if the sparsity pattern is symmetric then we can do better than that by checking the nonzero elements of the present row and only visiting the respective columns. This reduces the complexity from N*log(m) to m*log(m), where N=size of the matrix and m=number of elements per row, i.e. from O(N) to O(1). In the case of non-symmetric sparsity patterns, it might not be worth to eliminate the respective row, since we have to use a solver for nonsymmetric problems anyway, and that can then eliminate the respective column iteratively.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2874 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reindent.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2873 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix formatting.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2872 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make an assertion stronger. Move invariant code out of the loop.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2871 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

extra argument for formatting

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2870 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use the old scheme to compute the Jacobian matrices again. The one which uses Maple output was horribly slow (about 40 times, or so) and also overly complicated. A simple heat equation program ran 4 times faster after this change (the whole program, not only matrix assembly...), so this change is probably justified.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2869 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix some remaining problem with the templatization.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2868 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add standard container typedefs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2867 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Also templatize on output data type.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2866 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Forgot some explicit instantiations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2865 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Nicer layout and white background.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2864 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Nicer layout.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2863 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

templatized vector args.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2862 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Templatize on vector types in many functions, to support block vectors and Vector<float>s better.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2861 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove 'inline' keyword from functions in this .cc file, since they
can't be called from outside then.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2860 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor reindentations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2859 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix 3d non-compilability.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2858 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add names and dates to the individual changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2857 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add dates to changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2856 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't use the user flags any more for make_hanging_node_constraints.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2855 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clarify which functions use the user flags and which don't.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2854 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clarify which functions use the user flags and which don't.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2853 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make the sparsity pattern a template arg of make_sparsity_pattern.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2852 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

BlockSpars{eMatrix,ityPattern}

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2851 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

small fix.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2850 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add missing includes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2849 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

mt for functions with 6 args.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2848 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2847 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement DoFRenumbering::sort_selected_dofs_back

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2846 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

DoFTools::extract_hanging_node_dofs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2845 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

FEValuesBase::get_cell

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2844 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new function get_cell returns the present cell

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2843 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Accelerate the algorithm to construct the hanging node constraints.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2842 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix small bug, some missing breaks.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2841 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Assemble matrix and rhs in parallel.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2840 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

DoFHandler::max_couplings_between_dofs () bounded by DoFHandler::n_dofs()

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2839 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

max_couplings_between_dofs is bounded by n_dofs()

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@2838 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d