FEPointEvaluation: Allow evaluating more points together

Merge pull request #16920 from drwells/remove-duplicated-tables-2

Remove another duplicated table.

Remove another duplicated table.

Merge pull request #16916 from drwells/clarify-inverse-orientation

Explicitly use the inverse orientation instead of hard-coding.

Merge pull request #16917 from kronbichler/fix_mf_kokkos

Portable matrix-free: Fix Kokkos index access

Merge pull request #16918 from kronbichler/fix_test2

matrix_free/point_evaluation_33 test: add two more output variants

Merge pull request #16914 from drwells/remove-duplicated-tables

Remove duplicated tables

matrix_free/point_evaluation_33 test: add two more output variants

Portable matrix-free: Fix Kokkos index access

Explicitly use the inverse orientation instead of hard-coding.

Partially reverts #15678.

While #15678 fixed the permutation bug, it didn't address the true cause of the
problem: since face orientations are computed in the "apply this permutation to
face 1 to get face 2" direction, QProjector should use inverse orientations.
Since 2d orientations are their own inverses this only shows up in 3d.

Whenever two faces abutt, the first face is always in the default orientation
and the second face's orientation is computed relative to that (as decribed
here). Hence, when we project quadrature points onto the first face they do not
need to reoriented. However, we need to apply the *reverse* permutation on the
second face so that they end up in the same positions as the first face. More
formally: most, but not all, orientations are their own inverses. In particular,
triangle orientations 3 and 5 are each-other's inverses.

This matches the notion of inverse orientation used in #16828 for hypercubes. In
the future, we should combine the hypercube and non-hypercube implementations to
avoid these kinds of inconsistencies.

Part of #14667.

ReferenceCell::get_combined_orientation(): refactor.

We can use templated lambdas to avoid hard-coding the orientation tables in this
function.

Explicitly use the combined orientation.

Merge pull request #16911 from kronbichler/inline_poly

Polynomial: Make values_of_array always inline in release mode

Merge pull request #16913 from drwells/tria-orientation-cleanup

Tria orientation cleanup

Merge pull request #16891 from bergbauer/active_q_points

FEPointEvaluation: Implement n_active_entries_per_quadrature_batch

Merge pull request #16909 from bangerth/matrix-free

Use slightly better variable names in the MatrixFree::loop() functions.

Merge pull request #16912 from kronbichler/mf_portable_minor

Portable tensor product kernels: Simplify loop

Use numbers::invalid_unsigned_int.

Split a long line.

Remove a double negative.

Clean up some long lines.

Merge pull request #16906 from bangerth/restriction

Explain the term 'restriction' in FiniteElement.

Portable tensor product kernels: Simplify loop

Polynomial: Make values_of_array always inline in release mode

Use slightly better variable names in the MatrixFree::loop() functions.

Explain the term 'restriction' in FiniteElement.

Merge pull request #16898 from bangerth/64

Fix use of incorrect Epetra function.

Merge pull request #16904 from bangerth/fix-anchor

Use the same style of anchor name as elsewhere.

Merge pull request #16899 from bangerth/message

Print a message on the screen when normalizing a test output.

Merge pull request #16903 from bangerth/href

When creating a reference, use 'href', not 'name'.

Merge pull request #16895 from kronbichler/fix_rpe

Small improvement to RemotePointEvaluation

When creating a reference, use 'href', not 'name'.

Use the same style of anchor name as elsewhere.

Merge pull request #16896 from kronbichler/fix_nonnested_transfer

Non-nested MG transfer: Avoid repeated access of arrays

Merge pull request #16902 from pcafrica/vector_traits

Add VectorTraits to Trilinos and Tpetra wrappers

Add VectorTraits to Trilinos and Tpetra wrappers

Non-nested MG transfer: Avoid repeated access of arrays

Small improvement to RemotePointEvaluation

Print a message on the screen when normalizing a test output.

Add a changelog entry.

Fix use of incorrect Epetra function.

Merge pull request #16887 from kinnewig/nedelec_sz_get_shape_value_component

Add get_shape_value_component() to FE_NedelecSZ

Add changelog entry.

Unify the different evaluate() functions into one templated function.

Merge pull request #16894 from marcfehling/sundials-7

Added changelog for #16879.

Added changelog for #16879.

Merge pull request #16621 from bangerth/boost-1.84

Import BOOST 1.84.

Merge pull request #16726 from RichardYCJ/master

Also change out_stream condition when enable/disable_output

Merge pull request #16880 from pcafrica/epetra_vector_access_operator

Epetra vector access operator

Merge pull request #16886 from kinnewig/nedelec_sz_prolongation_matrix

Add get_prolongation_matrix() to FE_NedelecSZ.

Add EpetraWrappers::VectorTraits class

Merge pull request #16889 from bangerth/doc-vector

Better document operator= for parallel vectors.

Add test

Implement n_active_entries_per_quadrature_batch

Write Doxygen entries for get_shape_value_component(), get_shape_grad_component() and get_shape_grad_grad_component().

Implement get_shape_value_component(), get_shape_grad_component() and get_shape_grad_grad_component().

Move the computation of the InternalData into a separate function.

Implement EpetraWrappers::internal::VectorReference

Minor cleanup

Add changelog entry.

Merge pull request #16879 from marcfehling/sundials-7

Compatibility with SUNDIALS 7.

Better document operator= for parallel vectors.

Testing the prolongation matrix of FE_NedelecSZ.

Add get_prolongation_matrix() to FE_NedelecSZ.

Merge pull request #16885 from quangx/step-32-typo

Fix typo regarding templates in step 32

Merge pull request #16884 from drwells/un-hardcode-2d-orientation

Un-hardcode 2d orientation.

change <2> to <dim>

Introduce get_communicator_by_value().

Move parentheses out of preprocessor conditionals.

Add a test.

This fails on master due to twisted elements.

FE_Q_Base: combine permutation operations.

FiniteElement: remove 2d orientation assumptions.

For mixed meshes, we need to support quadrilaterals whose faces may have either
valid line orientation.

FE_Q_Base: clean up an assertion.

FE_Q_Base: Simplify some code with 'if constexpr'.

Merge pull request #16854 from kronbichler/improve_mapping_info

 NonMatching::MappingInfo: Avoid memory allocations in reinit()

Merge pull request #16881 from marcfehling/tria_base-inst

Clean up many explicit instantiations.

Merge pull request #16883 from Rombur/python_binding_2

Add GridGenerator::cylinder/subdivided_cylinder/truncated_cone to the python wrappers

Merge pull request #16882 from masterleinad/fix_atomics_kokkos

Don't define __ATOMIC_* in bundled Kokkos

Merge pull request #16872 from drwells/mixed-mesh-orientation

Mixed mesh orientation

Don't define __ATOMIC_* in bundled Kokkos

Add changelog entry

Add GridGenerator::truncated_cone to the python wrappers

Add GridGenerator::subdivided_cylinder to the python wrappers

Add GridGenerator::cylinder to the python wrappers

Clean up many explicit instantiations.

Use alias for sundials booleantype.

Use correct types for sundials 7.

Merge pull request #15773 from luca-heltai/fe-coupling-values

FECouplingValues.

FECouplingValues.

Merge pull request #16876 from drwells/hdf5-floating-point-exceptions

Explicitly open HDF5 and then clear its floating-point exceptions.

More efficient access via new Mapping::InternalDataBase::reinit

NonMatching::MappingInfo: Avoid memory allocations in reinit()

Explicitly open HDF5 and then clear its floating-point exceptions.

New versions of HDF5 detect the floating-point environment by doing several
things which trigger floating point exceptions, i.e., programs in the test suite
now abort in H5open(). Work around that by explicitly setting up HDF5 before we
turn on the 'abort on floating point exceptions' code.

Merge pull request #16869 from peterrum/extract_level_constant_modes

Add DoFTools::extract_level_constant_modes()

Add a test.

Merge pull request #15572 from Rombur/init_finalize

Add InitFinalize base class of MPI_InitFinalize

Merge pull request #16875 from bangerth/typos

Fix a whole lot of typos.

Merge pull request #16870 from bangerth/distort-random

Update documentation for GridTools::distort_random().

Update documentation for GridTools::distort_random().

In particular also remove a reference to the function in the documentation of class
Triangulation. The function used to be part of that class, but has not been for a long
time.

Fix a whole lot of typos.