compute the norm of the divergence

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25323 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

we indeed checked for a wrong flag here

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25322 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add a function to copy from a transposed matrix

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25321 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25319 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25318 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Augment documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25317 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix incorrect description of variables.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25316 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Provide a target 'all' in all Makefiles that simply builds the application. This is not strictly necessary, but it is standard for many projects to have such a target, and Eclipse for example automatically does 'make all' before it runs an executable -- which currently of course fails, and then sometimes simply leads to running an executable that isn't up to date. Since this is easily avoided, do so throughout.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25312 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Convert tabs into spaces so that editors with different notions how many spaces a tab corresponds to still all show our carefully indented code correctly.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25311 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added missing function (detected by Martin Kronbichler)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25310 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update ./configure so that it gets the change to configure.in in r25300.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25309 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Set properties.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25308 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove accidentally checked in executables.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25307 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust test output for the fact that we now run these tests with --with-lapack.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25306 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add an instantiation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25303 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update mark-up.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25302 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test for lapack eigenvalue solver for symmetric matrices with additional options included

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25301 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

eigenvalue solver for symmetric LAPACK matrices included. This eigensolver in particular includes the option of specifying the accuracy used for computing eigenvalues. Additionally, an interval in which eigenvalues are computed can be specified

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25300 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

include header to fix compilation in certain configurations (thanks Pearl Flath)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25299 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Augment documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25298 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove appearance of PETSC_DEV

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25297 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Stop petsc-dev from complaining about unknown nonzero off-diagonal entries.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25295 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Documentation update

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25293 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

tests Assembler::MGMatrixSimple

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25281 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

local blocks for Assembler::MGMatrixSimple

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25280 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove a test that shows a user error rather than a problem in the library.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25279 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Two more typos.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25278 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reindent and simplify.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25277 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo and remove documentation of deprecated class

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25276 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Corrected typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25275 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test correct local block association

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25273 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

remove debug output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25272 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix glitch with blockwise numbering

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25271 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

and add assertions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25270 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add add function like for sparse matrix

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25269 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test initialize_info and reinit

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25268 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

missing deal.II prefix added

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25267 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

start testing new block functionality

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25266 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add initialization of local blocks

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25265 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add function to output debugging information

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25264 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

implement new block structure in DoFInfo

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25263 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove unused variable.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25262 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

The configure and config.h.in files produced via autoreconf of autoconf version 2.68

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25261 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bugfix: Disable compilation of bundled boost if external boost library is used

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25260 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Restrict use of -Wa,--compress-debug-sections to non-cygwin systems.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25257 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove files that were spuriously merged back by accident from Seba's branch in r25229.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25256 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Get rid of unused types.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25255 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

List Ralf's contributions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25254 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix an erroneous assertion. I'm mystified how this could possibly have worked before.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25253 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use the correct test output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25250 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Test inverse Jacobians.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25249 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Adjust output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25248 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Weaken an assertion.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25247 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

rerun autoconf to force ./reconfigure for everyone because of changes in common/template-arguments

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25245 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add my name in one spot in publications I missed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25244 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add new failing test for no_normal_flux

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25243 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

We're back to mainline now.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25239 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Solution transfer for hp elements.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25237 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove rogue define macri (petsc-dev).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25234 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

tags

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25233 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test block structure

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25232 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25231 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added instations for codim 2

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25230 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Merge branch_codim_two back into trunk

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25229 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Switch to types::boundary/material_id_t from 'unsigned char'.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25227 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Augment documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25226 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Switch to types::boundary/material_id_t from 'unsigned char'.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25225 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix recently introduced error in quarter_hyper_shell()

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25224 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert r25212 and 25217 for the moment since it doesn't compile on the autotester.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25223 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add a comment to the diag_element () function

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25219 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

make Timo a maintainer in various places. Also fix some formatting.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25218 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Completely stop PETSc from complaining about new nonzero elements in MPI matices; instead, just allocate the memoty (read TODO).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25217 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

also mark TrilinosWrappers::Vector::is_non_negative() as not implemented in parallel

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25216 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fixed: TrilinosWrappers::Vector::all_zero() in parallel.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25215 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update PETScWrappers for the next backward-compatibility failure...

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25212 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

add failing test for quarter_hyper_shell & no_normal_flux

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25211 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New: GridGenerator::quarter_hyper_shell() in 3d.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25210 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use new scheme for #include paths.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25206 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

clarify comment in test

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25200 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix test output

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25199 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix vtu data output with 0 own cells. Before we wrote an empty file, but then the collection can not be read in with visit or paraview.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25198 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Test that compare the kelly estimator for the same mesh, when consider
as codim 0 or as codim 1

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25196 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New: DataOut::write_vtu_in_parallel(). This routine uses MPI I/O to write a big vtu file in parallel.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25195 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

A couple more notes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25194 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Final version.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25193 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

First attempt to update 2011 and move it to 2012.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25188 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add another flag necessary for xlC as per email from Basic Kanneth to
WB today.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25187 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Step-44: Deleted old pictures

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25186 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

step:44 minor changes to code and results.dox

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25185 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor editorial changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25182 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Allow serialization of TriaObjects again.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25181 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Simplify code slightly.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25180 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Introduction of types::boundary_id_t and types::material_id_t

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25179 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Resize the images.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25177 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add more pictures.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25176 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

further possible extentions

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25175 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fixing bugs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25174 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

extend the output by the contact force

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25173 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

step:44 updated intro

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25172 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Undo bogus commit to a figure. Add a sentence to Joerg's affiliation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25171 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d