Changes mostly related to the implementation of coarsening.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@399 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@398 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add functions implementing the coarsening.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@397 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Changes related to the implementation of coarsening.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@396 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add some additional magic numbers.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@395 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@394 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add some things related to the implementation of coarsening grids.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@393 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add typedef to iterators to get access to the Accessor type.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@392 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@391 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@390 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix silly bug (took me far too long to find... :-]])

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@389 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move object file creation rules to global Makefile.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@388 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make apply_boundary_values faster by about a factor of two by using that the rows in a sparse matrix are sorted according to the column numbers.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@387 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@386 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add profiling support to the optimized version of this library.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@385 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix a bug which seems has never occured (or I didn't note it...).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@384 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix two small bugs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@383 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mostly doc updates.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@382 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename some exception classes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@381 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix bug.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@380 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add more smoothing functionality to the refinement of triangulations

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@379 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix various bugs.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@378 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use GeometryInfo instead of home-brew constant. Apart from that, the old value was wrong! (Good reason to use GeometryInfo, I have typed this constant wrong so often...)

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@377 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Additional security check in user accessible function.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@376 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bug fix.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@375 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use new scheme to free memory of dVectors and dSMatrices as well as the associated possibility to initialize/construct a matrix empty.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@374 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement a scheme to free unused memory for dVector and dSMatrix. The memory is not freed (as before) if the object is made smaller, but is now freed altogether if the object is assigned the size zero. This functionality is needed if you really want to free all memory, e.g. to let an object sleep for a while but don't want to use those unhandy pointers for half a dozen vectors and matrices. -- Hopefully the new scheme doesn't break too many other things; the previous state of the library is a bit hacked together (my fault also, I admit...).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@373 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make compilation process specific of the space dimension wanted. This avoid unnecessarily long compile times for the library as well as too large libraries which themselves slow down the linking process of user executables. The selection of the dimension you want the library compiled for is done using the *deal_II_dimension* variable passed through the preprocessor (defined in the Make.global_options file).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@372 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Prepare structure for coarsening of grid (not yet implemented, not documented).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@371 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Cleanup.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@370 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@369 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make a function static which needs not be a member function.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@368 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a bit of error checking.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@367 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Disallow writing of a preamble to ucd files since DealVision presently can't handle it.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@366 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Small fix to avoid warning in output operator.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@365 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Use the GeometryInfo<dim> class in some places to enhance readability.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@364 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc update and use the GeometryInfo<dim> class in two places to enhance readability.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@363 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc update and move some functions from the class declaration to the inline section or the .cc-file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@362 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Makefile update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@361 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@360 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change a parameter from a vector<double> to a dVector since a) it does not hurt in the places where it is used in the library and b) it makes use with the dFMatrix class in my project simpler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@359 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Small changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@358 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Revert really bad typo (is this still the right name for such a thing?).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@357 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Makefile update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@356 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Changes for the exact evaluation of the mass matrix and add function to set up a right hand side vector.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@355 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add exact mass matrix creation and test for many more internal errors.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@354 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Change error detection code a bit.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@353 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add support for the exact evaluation of mass matrices to the finite element classes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@352 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc update and add function for the assemblage of a right hand side,

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@351 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc updates and use of new projection algorithm.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@350 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@349 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add functions to check whether an object looks initialized or not.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@348 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@347 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Externalize compiler options out of subdirectories into a central repository.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@346 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Small changes and bug fixes/work arounds.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@345 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move code closer to the C++ standard.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@344 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move code closer to the C++ standard and add copy operation to triangulations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@343 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move code closer to the C++ standard and small performance changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@342 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add copy operation to triangulations, move code closer to the C++ standard and doc changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@341 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move code closer to the C++ standard and small changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@340 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@339 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Standardize header file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@338 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make Makefile use better suited paths to my local compiler.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@337 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@336 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Re-remove performance checking code.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@335 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Resolve some problems with the projection of functions.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@334 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Oops, seems I haven't tried really after doing the change.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@333 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Small changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@332 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add projection to boundary.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@331 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add support for numbering of boundary (for integration on the boundary).

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@330 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc updates.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@329 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add support for integration along the boundary (introduce numbering of nodes on boundary) and doc updates.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@328 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@327 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Temporarily check the MFlops rate for matrix-vector-product. Remove this next time we see it.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@326 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@325 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

First part of huge changes to allow projection of the trace of a function to the boundary or parts thereof, to allow the creation of mass matrices on the boundary, use boundary projection in the projection of functions to the ansatz space, etc.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@324 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Performance tweak to vmult (gain: approx. 20 per cent). This makes things a bit unreadable, but since these are parts of the library which need never to be modified if they work, that's not so much of a problem.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@323 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Slight cleanup.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@322 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@321 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clarify some things with the update flags for FEValues objects.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@320 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc update and slight clarification of structures.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@319 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Small readability changes in advance of bigger performance changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@318 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Perform some performance tweaks.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@317 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Remove some things that we probably don't need in the near future but which make gcc choke when compiling.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@316 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move some functions from ProblemBase to more useful locations.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@315 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@314 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move some functions from ProblemBase to more general parts of the library.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@313 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Small change.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@312 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@311 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add time dependant functionality to the Function class.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@310 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Take over timer module from the old DEAL library.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@309 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add some checks for safety.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@308 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mainly changes for the String->string conversion of the parameter handler module, but also some minor performance tweaks with assumptions on the size of passed vectors.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@307 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Eliminate the need for libg++.a since we changed String->string in the parameter_handler.* files.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@306 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Performance tweaks with assumptions on the size of passed vectors.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@305 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Implement interpolation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@304 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Mainly doc updates.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@303 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Doc update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@302 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Slight reorganisation (getting the ansatz points of a finite element) and doc updates. Also use the GeometryInfo class more often instead of handcrafted values.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@301 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Slight reorganisation (getting the ansatz points of a finite element) and doc updates.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@300 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d